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Name : hslVU (WESB_0082) Accession : YP_006702643.1 Strain : Brachyspira pilosicoli WesB Genome accession: NC_018604 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ATP dependent protease HslVU/ClpYQ ATPase subunit Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 89262 - 90623 bp Length : 1362 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTCATTTGATGCGAAATTAGAAAGTGAGCTTACACCTAGAAGAATTGTTGAAGCTTTAGACCAATATATAATAGGTCA AACTGAGGCTAAACGTTCTGTGGCTATAGCTTTAAGAAATAGATATAGAAGACGTCATTTACCTGAGGAGTTAAAAGATG AAGTTGCTCCTAAAAATATTATATTAATAGGACCTACTGGGGTTGGTAAGACTGAGATTGCGAGAAGGCTTGCTAAATTA GTTAATGCTCCTTTTATCAAAGTTGAGGCTACTAAATATACTGAAGTTGGATATGTGGGAAGAGATGTTGAGAGCATGGT TAGAGATTTAGTTAATGCGGCTATATTTGAGCTTAAAACTTCTATGATGAAAGAGGTTGAAAAAGAGGCTACTGATATTG CTTTGGATAAACTTGCTAAACTTTTACTTCCATCTGTTAAAAAAGAAGATAATGAAATAATATCTGCTGAAGAGGCTGAA AGAAAAAATAATGCCAAAGAACAAATAAAAAAACGCATAGCTAATGGGGATTTTGATGAGAGTTATGTTGAAATAAAAAT ATCATCTAGTCAGGGTAGAATGTTTGGTATAATACCTGGAATGGGATTTGAAGAGAATGATATGATTCAGTCTATGGTTG GAAGTATTATGCCTCAAAATAAAAAAAATAAAAAATTAAGAGTAAAAGAGGCTAAGAAATATCTTATAAATGAGGCTTCT GAAACTTTAATAGATATGGAAAAAATTACTTCTGATGCTTTATCTTTGGCTGAGAATATGGGTATAATATTTTTAGATGA GATAGACAAAATAGCTAGCGGAAATAAAACAGACAGTGCAGATGTTGCCCGTCATGGTGTACAGAGGGATTTGCTTCCTA TAGTTGAAGGTACAACAGTTAATACTAAATATGGTCCTATAAAAACTGACCACATACTTTTTATAGCAGCTGGTGCTTTT CATGTTAATAAGCCTTCTGATTTGATACCGGAATTGCAGGGAAGATTTCCTATTAGAGTTGAATTAAAAGCTTTATCAAA AGAAGATTTTAAAGATATACTTATTAATCCTAAGAATGCTATTACTAAACAGTATCAGGAATTACTTAAAACTGAGGGTG TTACTATAGAGTTTGAAGATGAGGCTTTAGAGAAAATAGCTGATTTGGCTTATAATATTAATACTAATGTTGAAAATATT GGAGCTAGAAGACTTTATACTATTATGGAAAAAGTTTTTGAAGAGATTTCTTTTAGTGCAGATGAACATAGCGGAGAATT TATAAAAATAACTTCCGATAATGTTAAGGAGGCTGTAAAAGATATAGAAGAAAATAGGGATATTAGCAGATATATATTAT AA Protein sequence : MSFDAKLESELTPRRIVEALDQYIIGQTEAKRSVAIALRNRYRRRHLPEELKDEVAPKNIILIGPTGVGKTEIARRLAKL VNAPFIKVEATKYTEVGYVGRDVESMVRDLVNAAIFELKTSMMKEVEKEATDIALDKLAKLLLPSVKKEDNEIISAEEAE RKNNAKEQIKKRIANGDFDESYVEIKISSSQGRMFGIIPGMGFEENDMIQSMVGSIMPQNKKNKKLRVKEAKKYLINEAS ETLIDMEKITSDALSLAENMGIIFLDEIDKIASGNKTDSADVARHGVQRDLLPIVEGTTVNTKYGPIKTDHILFIAAGAF HVNKPSDLIPELQGRFPIRVELKALSKEDFKDILINPKNAITKQYQELLKTEGVTIEFEDEALEKIADLAYNINTNVENI GARRLYTIMEKVFEEISFSADEHSGEFIKITSDNVKEAVKDIEENRDISRYIL |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| hslU | YP_003728753.1 | heat shock protein HslU | Not tested | cag PAI | Protein | 3e-94 | 50 |
