Name : WESB_2437 (WESB_2437) Accession : YP_006704987.1 Strain : Brachyspira pilosicoli WesB Genome accession: NC_018604 Putative virulence/resistance : Virulence Product : PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 2682061 - 2683332 bp Length : 1272 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGATTACAGGAATATTAAATTTTATAGTTTATGATTTATTAGGTACTAGTTCTATATTAGTTGGTTTTATAGCTATGTT TGGTCTTATCTTACAAAAGAAGAAATGGGATAAGGTTGTAATCGGTACTATAAAAACAATAGTTGGATTTATAATTTTTA GTGCTGGTTCTTCTTTGGCAACTAGTTCATTAAATTCTTTCCAAACTTTATTTACAAAAGCATTTAATTTGGAAGGAGTA TTACCTTTAGCTGAAGCTGTTACAGCATTGGCTCAAAATAAATTTGGACCTATAGTTGCTTTAATAATGGTTACCGGTTT TATAGCTAATTTAATAATAGCTAGATTAACTCCATTTAAATACATATTTTTAACAGGTCAGCACAATTTATATTTAGCAG CACTTTTAACTGTAATATTTAAAGCAAACGGTGTATCTGATGGTCTTACTATAGGATTGGGAGCTATTATATTAGGAGCT TCTGCAGCATTATTCCCTGCTATAGCACAAAGAGGTATGAAGAAAATTACTGGTGAAAATGAAATAGCTATGGGACACTA TGTTACATTAGCTTATGCTTTATCATCTTTCATAGGTTCTAAAGTTGGTAAACCAGAAGACAGTACTGAAAAATTAAAAT TACCTTCTTGGCTTATGATATTTAAAGATTATGTTGTTTCAGTAGCTTTATCTGTTGCAGTGTTCTATTATATATCAGCA TTTATGGCTGGTAAAGCAGAAGTTGAGGCTTTATCTGGAAATGTTAGCTGGATATTATTCCCATTTTTACAATCATTATC ATTTGCAGCTTCATTATTTATAATCATCACTGGTGTAAGAATGGTATTAGGTGAAATAGTTTCTGCATTTGTTGGTATTT CTGAAAAACTTATTCCTAATGCAAAACCTGCTTTAGACTGTCCTGTAGTATTCCAGTATGCTCCTACTGCTACTGTTATA GGATTCTTATCTGCTTATATAGGCGGTTTATTATGTATACCTGTATTTATAGCTTTAAAAACACCTGTAATCATACCTGT TGCTGTTCCTTATTTCTTCATAGGTGCTACTGCTGGTGTATTTGGTAATGCTACAGGCGGTTGGAAAGGTGCTATTGCTG GAGGATTTATCACTGGTATACTTATAGCTGTTGGACCTGCTTTAATATACCCTATAATGAGTTCTATAGGTTTAACAGGT ACTTCTTTCCCAGAAACAGACTTTGTTAGTGTTGGTTTAATATTAAATGCTATATTAAGCATATTCAATTAA Protein sequence : MITGILNFIVYDLLGTSSILVGFIAMFGLILQKKKWDKVVIGTIKTIVGFIIFSAGSSLATSSLNSFQTLFTKAFNLEGV LPLAEAVTALAQNKFGPIVALIMVTGFIANLIIARLTPFKYIFLTGQHNLYLAALLTVIFKANGVSDGLTIGLGAIILGA SAALFPAIAQRGMKKITGENEIAMGHYVTLAYALSSFIGSKVGKPEDSTEKLKLPSWLMIFKDYVVSVALSVAVFYYISA FMAGKAEVEALSGNVSWILFPFLQSLSFAASLFIIITGVRMVLGEIVSAFVGISEKLIPNAKPALDCPVVFQYAPTATVI GFLSAYIGGLLCIPVFIALKTPVIIPVAVPYFFIGATAGVFGNATGGWKGAIAGGFITGILIAVGPALIYPIMSSIGLTG TSFPETDFVSVGLILNAILSIFN |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
ORF8 | AAK27335.1 | unknown | Not tested | PAI-I AL862 | Protein | 9e-91 | 46 |
unnamed | CAC39291.1 | hypothetical protein | Not tested | LPA | Protein | 6e-91 | 46 |
vpeC | ADD91725.1 | putative PTS system-specific IIC component VpeC | Virulence | PAI-I AL862 | Protein | 6e-91 | 46 |