Name : WESB_2432 (WESB_2432) Accession : YP_006704982.1 Strain : Brachyspira pilosicoli WesB Genome accession: NC_018604 Putative virulence/resistance : Virulence Product : PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 2678145 - 2679413 bp Length : 1269 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGTATTAAAATTTTTAGTTGACTTACTTAGCCAAGCTTCAATACTTGTAGCTTTATTTACTATGGTAGGTCTTATTCT ATTAAAAAAGCCTATTAATGAAATAATAGCAGGTTCTATGAAATCTTTAATAGGTTTTATTTTGCTTGGTGCTGGTGCTA CAGTTATTACAACTTCATTAGCTCCTTTTGGAAATATGGTAGAGGTTGCTTTTAATGTTCAAGGTGTTGTGCCAAATAAT GAGGCTATAGTATCTTTAGCATTAACAAAGTATGGTACTCAAGTTTCTATGGTTATGATACTTTCTATGATATTCCATAT AATCATAGCTAAATTCTCACCATTGAAATTTATATTCTTAACAGGTCACCATATATTCTACATGGGTGTAATGATTACAG TTATATTAGCAGTAGCAGGTTTAAGCGGTGTTACTCTTATAATAGCTGCTTCTTTAATAAATGCTCTTGCTATGAGTATT TCTCCTTTATTAAGCTATTGGGCTATGCCTAAAGTTATAGGAGACAGCACTAGTCAGGTTGCTTTAGGTCACTTCTCTAA TGTTACTTATAGTATTTCTGCTCTTATTGGTAAAATAGTGGGCGGAAATTCTCCTTCTGTTGAGGATTTAAAATTACCTA AAGGTTTAAGCTTCATGAGAGATAATATACTTGCTATAGCTTTAACTATGTCTATTATTTATATTATAGTTGCTATTGCT GCAGGAAGTGCTTATATAGAAAAAGAATTATCTAATGGTCAGAATTATTTAGTATTTGCTCTTATACAGGGTGTTACTTT TGCTGCTGGTGTTTCTGTTGTATTATCTGGTGTTAGAATGATATTAGGTGAAATTATTCCTGCTTTCAAAGGTATATCTG AAAAGATTGTTCCTAATGCTATACCTGCTTTGGATTGTCCTGTAGTATTCCCTTATGCTCCTAATGCTGTTTTAATAGGA TTTATTACAAGCTTTATAGGCGGATTAGTTGGTTTAGCTATACTTGGTGCTGTAGGCGGCGTTTTAATTATACCTGGTGT TGTACCGCATTTCTTTGTTGGTGCTACTGCTGGTGTATTTGGTAATGCTACTGGCGGAAGAAGAGGCTGTATTATAGGTT CTTTCATTAATGGTCTTCTTCTTGCTTTCCTTCCTATTATATTACTTCCTATACTTGGAGATTTAGGTTTCCAAAATACT ACTTTCAGCGATGCTGACTTTGTAGCTGTGGGCGGTATTATAGGATTTATCACTAGCTTGATAAAATAA Protein sequence : MVLKFLVDLLSQASILVALFTMVGLILLKKPINEIIAGSMKSLIGFILLGAGATVITTSLAPFGNMVEVAFNVQGVVPNN EAIVSLALTKYGTQVSMVMILSMIFHIIIAKFSPLKFIFLTGHHIFYMGVMITVILAVAGLSGVTLIIAASLINALAMSI SPLLSYWAMPKVIGDSTSQVALGHFSNVTYSISALIGKIVGGNSPSVEDLKLPKGLSFMRDNILAIALTMSIIYIIVAIA AGSAYIEKELSNGQNYLVFALIQGVTFAAGVSVVLSGVRMILGEIIPAFKGISEKIVPNAIPALDCPVVFPYAPNAVLIG FITSFIGGLVGLAILGAVGGVLIIPGVVPHFFVGATAGVFGNATGGRRGCIIGSFINGLLLAFLPIILLPILGDLGFQNT TFSDADFVAVGGIIGFITSLIK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
vpeC | ADD91725.1 | putative PTS system-specific IIC component VpeC | Virulence | PAI-I AL862 | Protein | 8e-85 | 54 |
ORF8 | AAK27335.1 | unknown | Not tested | PAI-I AL862 | Protein | 1e-84 | 54 |
unnamed | CAC39291.1 | hypothetical protein | Not tested | LPA | Protein | 8e-85 | 54 |