Gene Information

Name : WESB_1889 (WESB_1889)
Accession : YP_006704442.1
Strain : Brachyspira pilosicoli WesB
Genome accession: NC_018604
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : PTS system glucose subfamily transporter subunit IIA
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 2101243 - 2103402 bp
Length : 2160 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGAAGGATAAACTTTTTGGAGTATTGCAAAGAGTAGGAAGGTCATTCATGCTTCCTATAGCGGTGCTTCCTGTAGCAGG
GCTCTTTTTGGGTATAGGTAGCTCTCTCACAAACACAACTATGCTTGAAACCTATAATCTTATGGGCATTTTAGGTCCGG
GCACTATTGCTTATGATATATTATCAGTATTAAGTGAGGCTGGTAATATTATATTTGGAAACTTGCCTATTATATTTGCT
ATGAGTGTAGCTATTGGTATGGCAAAAAAAGAAAAAGAGGTTGCTGCTTTATCTGGAGCTATAGCATTTTTTGTAATGCA
TGCTTCTATTGGTAAGATGATAACAGTTATGGGAGGAGCTGATAAATTATTGGCTGGTTCTACTACTAATGTTGTTGGTA
TATTATCACTTCAAATGGGTGTGTTCGGCGGTATTATAGTAGGGTTAGGAGTTGCTGCTTTACATAACAGATTCTATACT
ATAGAGCTTCCTCAAGTATTATCATTTTTCGGCGGTACAAGATTTGTACCTATAATATCTGCTATTACATTTTTGGTAGT
TGGTATATTGATGTATTTTGTATGGCCTCCTATACAGGTTGTAATGAATAAACTCGGAGATTTAATAGCTGGTTCTGGTT
ATGTGGGTACTTTATTCTATGGTATCATAGAAAGAGCATTAATACCTTTCGGTCTTCACCACGTATTCTATACACCTTTA
TGGCAAACTTCACTCGGCGGCACTATGATGATAGACGGCAATTTGGTAGAAGGTGCACAAAACATATTCTTTGCTCAATT
AGGCTCTCCTACTACAACTGCATTTAGTGTTGATGCTACTCGTTTTATGACTGGTAAATTCCCATTCATGATATTTGGCT
TACCTGGTGCTGCTTTGGCGATGTATAAAACTTCAAGAGCAGAAAAGAAACAAGTTGTAGGTGCTTTGCTTTTCTCTGCT
GCTTTAACTGCTATGCTTACTGGTATCACTGAACCTATAGAGTTTACATTCCTTTTTGTAGCTCCAATATTCTATGCTAT
ACACTGTGTACTTGCTGGTATATCTTTCATGCTTATGCATATACTTCATGTTACAGTTGGTATGACATTCTCAGGCGGTT
TAATTGACTTGCTTTTATTTGGTGTAATACAAGGAAATGCTAAAACTAATTGGGTTTGGATTGTAGTAGTTGGTGCTGTT
TATTTCTTTATTTATTATTTCTTATTCTCTACATTGATTAAGAAATTTGACTGGAAAACACCAGGAAGAGAACCAGATAG
TGAAGAGCCTAAACTTTATAAAAGAGCAGATGTTGAGGCTGCTAAGGCTTTAGCTAAAGGAGAAAATATTGATACTAATC
CTTTATTTAAATATGAAGAAGCTCCTTTAATCACTTCAGGACTTGGCGGAAAGAAAAATATAAGCGATGTTGACTGCTGT
GCTACAAGACTTCGTGTTACAGTGTTTGATACTTCTAAAGTTAATGACACTATGCTAAAACAAAGCGGTGCTGCTGGAAT
CATCAAAAAAGGTAATGGCATACAGGTTATATACGGACCTAAAGTTACAGTAATAAAATCAAGACTTGAAGAGTATTTAC
ATGACCCTATAAGCGACAATGAAGATAATATGACTGTTTCTAATGAAAACACTTCTGCTAATGAACCTCAAAAGCAAGAA
TCTGCAGCTTCTGGTAGTAATGAACTTGTTGACACTGTTTATGCTCCTATTAAAGGAAACATTGTTAAACTTGAAGATGT
TAAAGATGAGGCATTTTCTTCTGGTGCTATGGGTAAAGGTATTGCTATTGACCCAGCTGAAGGCAAAGTATATGCTCCTT
TTGACGGAATAATAGAAACTGCTTTTCCTACAAAACATGCTATTGGACTTAGTTCTGATAAAGGCGTTGAGTTGTTAATA
CATATAGGTATGGATACTGTTAAACTCAATGGTGAGCATTTTACTTCACATATTGAAGATGGTCAGAAGATTAAAAAAGG
CGATTTATTATTAGAGTTTAACATTGAGGGAATAAAATCTGCAGGCTACCCTACAGTTACTCCTGTAATTATCACTAACT
CTGATGATTATGCAAATATAGAGCCAACATCATCTCTTAGTGTAAATGCTTTAGACAAACTCATTGATGTTAAAAAATAA

Protein sequence :
MKDKLFGVLQRVGRSFMLPIAVLPVAGLFLGIGSSLTNTTMLETYNLMGILGPGTIAYDILSVLSEAGNIIFGNLPIIFA
MSVAIGMAKKEKEVAALSGAIAFFVMHASIGKMITVMGGADKLLAGSTTNVVGILSLQMGVFGGIIVGLGVAALHNRFYT
IELPQVLSFFGGTRFVPIISAITFLVVGILMYFVWPPIQVVMNKLGDLIAGSGYVGTLFYGIIERALIPFGLHHVFYTPL
WQTSLGGTMMIDGNLVEGAQNIFFAQLGSPTTTAFSVDATRFMTGKFPFMIFGLPGAALAMYKTSRAEKKQVVGALLFSA
ALTAMLTGITEPIEFTFLFVAPIFYAIHCVLAGISFMLMHILHVTVGMTFSGGLIDLLLFGVIQGNAKTNWVWIVVVGAV
YFFIYYFLFSTLIKKFDWKTPGREPDSEEPKLYKRADVEAAKALAKGENIDTNPLFKYEEAPLITSGLGGKKNISDVDCC
ATRLRVTVFDTSKVNDTMLKQSGAAGIIKKGNGIQVIYGPKVTVIKSRLEEYLHDPISDNEDNMTVSNENTSANEPQKQE
SAASGSNELVDTVYAPIKGNIVKLEDVKDEAFSSGAMGKGIAIDPAEGKVYAPFDGIIETAFPTKHAIGLSSDKGVELLI
HIGMDTVKLNGEHFTSHIEDGQKIKKGDLLLEFNIEGIKSAGYPTVTPVIITNSDDYANIEPTSSLSVNALDKLIDVKK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
ef0067 AAM75272.1 EF0067 Not tested Not named Protein 1e-80 42