Gene Information

Name : inlB (LMOSLCC7179_0423)
Accession : YP_006698116.1
Strain : Listeria monocytogenes SLCC7179
Genome accession: NC_018593
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : internalin B
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 448488 - 450380 bp
Length : 1893 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
GTGAAAGAAAAGCACAACCCAAGAAGGAAGTATTGTTTAATCTCAGGTTTAGCTATTATTTTTAGTTTATGGATAATTAT
TGGAAACGGGGCGAAAGTACAAGCGGAGACTATCACCGTGCCAACGCCAATCAAGCAAATTTTTTCAGATGATGCTTTTG
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ATCATTGCGAATAATAGTGATATTAAATCCGTTCAAGGAATTCAGTATTTACCCAATGTGACAAAGTTATTTTTAAACGG
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TGAGTTTTATTTTCTATCAGCCAGTCACTATTGGAAAAGCAAAAGCAAGATTTCATGGGAGAGTAACCCAACCACTGAAA
GAGGTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAAGCAGGGACGCGGATAACTGCACC
TAAACCTCCGACCAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGATGGTATACTGAAAAAAATGGTGGGCATGAGTGGAATTTTAATA
CGGATTATATGTCCGGAAATGATTTTACTTTGTACGCAGTATTTAAAGCGGAAACGACCGAAAAAGCAGTCAACTTAACT
CGCTATGTCAAATATATTCGCGGGAATGCAGGCATCTACAAACTTCCACGAGAAGATAACTCGCTTAAACAAGGAACTCT
AGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAGAGAAGCCCGAAATGGCGGAAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATA
TTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACCGATACGATAAAATGGAATATGACAAAGGGGTTACCGCTTATGCA
AGAGTGAGAAATGCGTCTGGAAATTCGGTTTGGACAAAACCCTACAACACAGCCGGCGCTAAACACGTGAATAAGCTATC
GGTCTACCAAGGTAAAAATATGCGTATCTTGCGCGAAGCCAAAACACCAATTACTACATGGTATCAATTTAGCATTGGTG
GTAAAGTAATTGGTTGGGTCGATACCCGAGCACTTAACACATTCTACAAACAAAGTATGGAAAAACCAACCCGTTTAACT
CGTTATGTCAGCGCCAATAAAGCTGGCGAATCGTACTATAAAGTCCCGGTAGCAGATAATCCAGTCAAAAGGGGTACTTT
AGCCAAGTATAAAAATCAAAAGTTAATTGTTGATTGTCAAGCAACCATCGAAGGTCAACTTTGGTACCGAATAAGGACTA
GTTCCACTTTCATTGGTTGGACGAAAGCAGCTAATTTAAGGGCACAGAAATAA

Protein sequence :
MKEKHNPRRKYCLISGLAIIFSLWIIIGNGAKVQAETITVPTPIKQIFSDDAFAETIKDNLKKKSVTDAVTQNELNSIDQ
IIANNSDIKSVQGIQYLPNVTKLFLNGNKLTDIKPLTNLKNLGWLFLDENKIKDLSSLKDLKKLKSLSLEHNGISDINGL
VHLPQLESLYLGNNKITDITVLSRLTKLDTLSLEDNQISDIVPLAGLTKLQNLYLSKNHISDLRALAGLKNLDVLELFSQ
ECLNKPINHQSNLVVPNTVKNTDGSLVTPEIISDDGDYEKPNVKWHLPEFTNEVSFIFYQPVTIGKAKARFHGRVTQPLK
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RVRNASGNSVWTKPYNTAGAKHVNKLSVYQGKNMRILREAKTPITTWYQFSIGGKVIGWVDTRALNTFYKQSMEKPTRLT
RYVSANKAGESYYKVPVADNPVKRGTLAKYKNQKLIVDCQATIEGQLWYRIRTSSTFIGWTKAANLRAQK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
inlB CAC20629.1 internalin B Virulence Internalin Protein 0.0 99

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
inlB YP_006698116.1 internalin B VFG0076 Protein 0.0 99