Name : inlA (LMOSLCC7179_0422) Accession : YP_006698115.1 Strain : Listeria monocytogenes SLCC7179 Genome accession: NC_018593 Putative virulence/resistance : Virulence Product : internalin A Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 446001 - 448403 bp Length : 2403 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGAGAAAAAAACGATATGTATGGTTGAAAAGTATACTAGTAGCAATATTAGTATTTGGCAGTGGAGTATGGATTAACAC GAGCAACGGGACAAATGCTCAGGCAGCTACAATTACACAAGATACTCCTATTAATCAGATTTTTACAGACGCAGCTCTAG CGGAAAAAATGAAGACGGTCTTAGGAAAAACGAATGTAACAGACACGGTCTCACAAACAGATCTAGACCAAGTTACGACG CTTCAGGCGGATAGGTTAGGGATAAAATCTATCGATGGAGTGGAATACTTGAACAATTTAACACAAATAAATTTCAGCAA TAATCAACTTACGGACATAACGCCACTTAAAAATTTAACTAAGTTAGTTGATATTTTGATGAATAATAATCAAATAGCAG ATATAACTCCGCTAGCTAATTTGACGAATCTAACTGGTTTGACTTTGTTCAACAATCAGATAACGGATCTAGACCCGCTT AAAAATCTAACAAATTTAAATCGGCTAGAACTATCTAGTAACACGATTAGTGATATTAGTGCGCTTTCAGGTTTAACTAG TCTACAGCAATTATCTTTTGGTAATCAAGTGACAGATTTAAAACCATTAGCTAATTTAACGACACTAGAACGACTAGATA TTTCAAGTAATAAGGTGTCAGATATTAGTGTTCTGGCTAAATTAACCAATTTAGAAAGTCTTATCGCTACTAACAACCAA ATAAGTGATATAACTCCACTTGGGATTTTAACGAATTTGGACGAATTATCCTTAAATGGTAACCAGTTAAAAGATATAGG CACATTGGCGAGTTTAACAAACCTTACAGATTTAGATTTAGCAAATAACCAAATTAGTAATCTAGCACCACTGTCGGGTC TAACAAAACTAACTGAGTTAAAACTTGGAGCTAACCAAATAAGTAACATCAGTCCCCTAGCAGGTTTAACCGCACTCACT AACTTAGAGCTTAATGAAAATCAGCTGGAAGATATTAGCCCAATTTCTAACCTGAAAAATCTCACATATTTAACTTTGTA CTTTAATAATATAAGTGATATAAGCCCAGTTTCTAGTTTAACAAAGCTTCAAAGATTATTTTTCTATAATAACAAGGTAA GTGACGTAAGCTCACTTGCGAACTTAACAAATATTAATTGGCTTTCGGCCGGGCATAACCAAATTAGCGATCTTACACCA TTGGCTAATTTAACAAGAATCACCCAACTAGGGTTGAATGATCAAGCATGGACAAATGCACCAGTAAACTACAAAGCAAA TGTATCCATTCCAAACACGGTGAAAAATGTGACTGGCGCTTTAATTGCACCAGCTACTATTAGCGATGGCGGTAGTTACA CAGAACCTGATATAACATGGAACTTACCTAGTTATACAAATGAAGTAAGCTATACCTTTAGCCAACCTGTCACTATTGGA AAAGGAACGACAACATTTAGTGGAACCGTGACGCAGCCACTTAAGGCAATTTTTAATGTTAAGTTTCATGTGGACGGCAA AGAAACAACCAAAGAAGTGGAAGCTGGGAATTTATTGACTGAACCAGCTAAGCCCGTAAAAGAAGGTCACACATTTGTTG GTTGGTTTGATGCCCAAACAGGCGGAACTAAATGGAATTTCAGTACGGATAAAATGCCGACAAATGACATCAATTTATAT GCACAATTTAGTATTAACAGCTACACAGCAACCTTTGAGAATGACGGTGTAACAACATCTCAAACAGTAGATTATCAAGG CTTGTTACAAGAACCTACACCACCAACAAAAGAAGGTTATACTTTCAAAGGCTGGTATGACGCAAAAACTGGTGGTGACA AGTGGGATTTCGCAACTAGCAAAATGCCTGCTAAAAACATCACCTTATATGCCCAATATAGCGCCAATAGCTATACAGCA ACGTTTGATATTGATGGAAAAACAACGACTCAAACAGTAGACTATCAAGGACTTCTAAAAGAACCAAAGGCACCAACGAA AGCCGGATATACTTTCAAAGGCTGGTATGACGAAAAAACAGATGGGAAAAAATGGGATTTTGCGACGGATAAAATGCCAG CAAATGACATTACGCTGTACGCTCAATTTACGAAAAATCCTGTGGCTCCACCAACAACTGGAGGGAACACACCGCCTACA ACAAATAACGGCGGGAATACTACACCACCTTCCGCAAATATACCTGGAAGCGACACATCTAACACATCAACAGGGAATTC AGCTAGCACAACAAGTACAATGAACGCTTATGACCCTTATAATTCAAAAGATGCTTCACTCCCAACAACTGGCGATAGCG ATAATGCGCTCTACCTTTTGTTAGGGTTATTAGCAGTAGGAACTGCAATGGCTCTTACTAAAAAAGCACGTGCTAGTAAA TAG Protein sequence : MRKKRYVWLKSILVAILVFGSGVWINTSNGTNAQAATITQDTPINQIFTDAALAEKMKTVLGKTNVTDTVSQTDLDQVTT LQADRLGIKSIDGVEYLNNLTQINFSNNQLTDITPLKNLTKLVDILMNNNQIADITPLANLTNLTGLTLFNNQITDLDPL KNLTNLNRLELSSNTISDISALSGLTSLQQLSFGNQVTDLKPLANLTTLERLDISSNKVSDISVLAKLTNLESLIATNNQ ISDITPLGILTNLDELSLNGNQLKDIGTLASLTNLTDLDLANNQISNLAPLSGLTKLTELKLGANQISNISPLAGLTALT NLELNENQLEDISPISNLKNLTYLTLYFNNISDISPVSSLTKLQRLFFYNNKVSDVSSLANLTNINWLSAGHNQISDLTP LANLTRITQLGLNDQAWTNAPVNYKANVSIPNTVKNVTGALIAPATISDGGSYTEPDITWNLPSYTNEVSYTFSQPVTIG KGTTTFSGTVTQPLKAIFNVKFHVDGKETTKEVEAGNLLTEPAKPVKEGHTFVGWFDAQTGGTKWNFSTDKMPTNDINLY AQFSINSYTATFENDGVTTSQTVDYQGLLQEPTPPTKEGYTFKGWYDAKTGGDKWDFATSKMPAKNITLYAQYSANSYTA TFDIDGKTTTQTVDYQGLLKEPKAPTKAGYTFKGWYDEKTDGKKWDFATDKMPANDITLYAQFTKNPVAPPTTGGNTPPT TNNGGNTTPPSANIPGSDTSNTSTGNSASTTSTMNAYDPYNSKDASLPTTGDSDNALYLLLGLLAVGTAMALTKKARASK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
inlA | CAC20628.1 | internalin A | Virulence | Internalin | Protein | 0.0 | 99 |
inlF | AAB67968.1 | internalin | Virulence | Internalin | Protein | 3e-137 | 46 |
Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
inlA | YP_006698115.1 | internalin A | VFG0075 | Protein | 0.0 | 99 |