Gene Information

Name : inlB (LMOSLCC2479_0437)
Accession : YP_006686700.1
Strain : Listeria monocytogenes SLCC2479
Genome accession: NC_018589
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : internalin B
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 455753 - 457645 bp
Length : 1893 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
GTGAAAGAAAAGCACAACCCAAGAAGGAAGTATTGTTTAATCTCAGGTTTAGCTATTATTTTTAGTTTATGGATAATTAT
TGGAAACGGGGCGAAAGTACAAGCGGAGACTATCACCGTGCCAACGCCAATCAAGCAAATTTTTTCAGATGATGCTTTTG
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ATCATTGCGAATAATAGTGATATTAAATCCGTTCAAGGAATTCAGTATTTACCCAATGTGACAAAGTTATTTTTAAACGG
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TGAGTTTTATTTTCTATCAGCCAGTCACTATTGGAAAAGCAAAAGCAAGATTTCATGGGAGAGTAACCCAACCACTGAAA
GAGGTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAAGCAGGGACGCGGATAACTGCACC
TAAACCTCCGACTAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGATGGTATACTGAAAAAAATGGTGGGCATGAGTGGAATTTTAATA
CGGATTATATGTCCGGAAATGATTTTACTTTGTACGCAGTATTTAAAGCGGAAACGACCGAAAAAGCAGTCAACTTAACC
CGCTATGTCAAATATATTCGCGGGAATGCAGGCATCTACAAACTTCCACGAGAAGATAACTCGCTTAAACAAGGAACTCT
AGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAGAGAAGCCCGAAATGGCGGAAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATA
TTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACCGATACGATAAAATGGAATATGACAAAGGGGTTACCGCTTATGCA
AGAGTGAGAAATGCGTCTGGAAATTCGGTTTGGACAAAACCCTACAACACAGCCGGCGCTAAACACGTGAATAAGCTATC
GGTCTACCAAGGTAAAAATATGCGTATCTTGCGCGAAGCCAAAACACCAATTACTACATGGTATCAATTTAGCATTGGTG
GTAAAGTAATTGGTTGGGTCGATACCCGAGCACTTAACACATTCTACAAACAAAGCATGGAAAAGCCAACCCGTTTAACT
CGTTATGTCAGCGCCAATAAAGCTGGCGAATCGTACTATAAAGTCCCGGTAGCAGATAATCCAGTCAAAAGGGGTACTTT
AGCCAAGTATAAAAATCAAAAGTTAATTGTTGATTGTCAAGCAACCATCGAAGGTCAACTTTGGTACCGAATAAGGACTA
GTTCCACTTTCATTGGTTGGACGAAAGCAGCTAATTTAAGGGCACAGAAATAA

Protein sequence :
MKEKHNPRRKYCLISGLAIIFSLWIIIGNGAKVQAETITVPTPIKQIFSDDAFAETIKDNLKKKSVTDAVTQNELNSIDQ
IIANNSDIKSVQGIQYLPNVTKLFLNGNKLTDIKPLANLKNLGWLFLDENKVKDLSSLKDLKKLKSLSLEHNGISDINGL
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ECLNKPINHQSNLVVPNTVKNTDGSLVTPEIISDDGDYEKPNVKWHLPEFTNEVSFIFYQPVTIGKAKARFHGRVTQPLK
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RYVKYIRGNAGIYKLPREDNSLKQGTLASHRCKALTVDREARNGGKLWYRLKNIGWTKAENLSLDRYDKMEYDKGVTAYA
RVRNASGNSVWTKPYNTAGAKHVNKLSVYQGKNMRILREAKTPITTWYQFSIGGKVIGWVDTRALNTFYKQSMEKPTRLT
RYVSANKAGESYYKVPVADNPVKRGTLAKYKNQKLIVDCQATIEGQLWYRIRTSSTFIGWTKAANLRAQK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
inlB CAC20629.1 internalin B Virulence Internalin Protein 0.0 100

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
inlB YP_006686700.1 internalin B VFG0076 Protein 0.0 100