Gene Information

Name : inlB (LMOSLCC2372_0438)
Accession : YP_006683765.1
Strain : Listeria monocytogenes SLCC2372
Genome accession: NC_018588
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : internalin B
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 455737 - 457629 bp
Length : 1893 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
GTGAAAGAAAAGCACAACCCAAGAAGGAAGTATTGTTTAATCTCAGGTTTAGCTATTATTTTTAGTTTATGGATAATTAT
TGGAAACGGGGCGAAAGTACAAGCGGAGACTATCACCGTGCCAACGCCAATCAAGCAAATTTTTTCAGATGATGCTTTTG
CAGAAACAATCAAAGACAATTTAAAGAAAAAAAGTGTGACAGATGCAGTGACACAAAATGAATTAAATAGTATAGATCAA
ATCATTGCGAATAATAGTGATATTAAATCCGTTCAAGGAATTCAGTATTTACCCAATGTGACAAAGTTATTTTTAAACGG
GAATAAACTAACAGATATAAAGCCCTTAGCAAACTTGAAAAATTTAGGATGGCTTTTTTTAGACGAAAATAAAGTTAAGG
ACCTAAGTTCGCTCAAGGATTTAAAAAAATTAAAATCACTTTCTTTGGAGCATAATGGTATAAGTGATATAAACGGACTT
GTTCATTTACCACAGCTGGAAAGTTTGTATTTGGGAAATAATAAAATAACGGATATAACGGTTCTTTCACGTTTAACTAA
ACTGGATACTTTGTCTCTCGAAGATAACCAAATTAGTGATATTGTGCCACTTGCAGGTTTAACTAAATTGCAGAACCTAT
ATTTAAGTAAAAATCACATAAGCGATTTAAGAGCATTAGCAGGACTTAAAAATCTAGATGTTTTAGAATTATTTAGCCAA
GAATGTCTTAATAAGCCTATTAATCATCAATCTAATTTGGTTGTTCCGAATACAGTGAAAAACACTGATGGGTCGTTAGT
GACTCCAGAAATAATAAGTGATGATGGCGATTATGAAAAACCTAATGTTAAATGGCATTTACCAGAATTTACAAATGAAG
TGAGTTTTATTTTCTATCAGCCAGTCACTATTGGAAAAGCAAAAGCAAGATTTCATGGGAGAGTAACCCAACCACTGAAA
GAGGTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAAGCAGGGACGCGGATAACTGCACC
TAAACCTCCGACTAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGATGGTATACTGAAAAAAATGGTGGGCATGAGTGGAATTTTAATA
CGGATTATATGTCCGGAAATGATTTTACTTTGTACGCAGTATTTAAAGCGGAAACGACCGAAAAAGCAGTCAACTTAACC
CGCTATGTCAAATATATTCGCGGGAATGCAGGCATCTACAAACTTCCACGAGAAGATAACTCGCTTAAACAAGGAACTCT
AGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAGAGAAGCCCGAAATGGCGGAAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATA
TTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACCGATACGATAAAATGGAATATGACAAAGGGGTTACCGCTTATGCA
AGAGTGAGAAATGCGTCTGGAAATTCGGTTTGGACAAAACCCTACAACACAGCCGGCGCTAAACACGTGAATAAGCTATC
GGTCTACCAAGGTAAAAATATGCGTATCTTGCGCGAAGCCAAAACACCAATTACTACATGGTATCAATTTAGCATTGGTG
GTAAAGTAATTGGTTGGGTCGATACCCGAGCACTTAACACATTCTACAAACAAAGCATGGAAAAGCCAACCCGTTTAACT
CGTTATGTCAGCGCCAATAAAGCTGGCGAATCGTACTATAAAGTCCCGGTAGCAGATAATCCAGTCAAAAGGGGTACTTT
AGCCAAGTATAAAAATCAAAAGTTAATTGTTGATTGTCAAGCAACCATCGAAGGTCAACTTTGGTACCGAATAAGGACTA
GTTCCACTTTCATTGGTTGGACGAAAGCAGCTAATTTAAGGGCACAGAAATAA

Protein sequence :
MKEKHNPRRKYCLISGLAIIFSLWIIIGNGAKVQAETITVPTPIKQIFSDDAFAETIKDNLKKKSVTDAVTQNELNSIDQ
IIANNSDIKSVQGIQYLPNVTKLFLNGNKLTDIKPLANLKNLGWLFLDENKVKDLSSLKDLKKLKSLSLEHNGISDINGL
VHLPQLESLYLGNNKITDITVLSRLTKLDTLSLEDNQISDIVPLAGLTKLQNLYLSKNHISDLRALAGLKNLDVLELFSQ
ECLNKPINHQSNLVVPNTVKNTDGSLVTPEIISDDGDYEKPNVKWHLPEFTNEVSFIFYQPVTIGKAKARFHGRVTQPLK
EVYTVSYDVDGTVIKTKVEAGTRITAPKPPTKQGYVFKGWYTEKNGGHEWNFNTDYMSGNDFTLYAVFKAETTEKAVNLT
RYVKYIRGNAGIYKLPREDNSLKQGTLASHRCKALTVDREARNGGKLWYRLKNIGWTKAENLSLDRYDKMEYDKGVTAYA
RVRNASGNSVWTKPYNTAGAKHVNKLSVYQGKNMRILREAKTPITTWYQFSIGGKVIGWVDTRALNTFYKQSMEKPTRLT
RYVSANKAGESYYKVPVADNPVKRGTLAKYKNQKLIVDCQATIEGQLWYRIRTSSTFIGWTKAANLRAQK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
inlB CAC20629.1 internalin B Virulence Internalin Protein 0.0 100

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
inlB YP_006683765.1 internalin B VFG0076 Protein 0.0 100