Gene Information

Name : inlF (LMOSLCC2755_0417)
Accession : YP_006680867.1
Strain : Listeria monocytogenes SLCC2755
Genome accession: NC_018587
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : internalin F
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 440483 - 442954 bp
Length : 2472 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGAAAGCGAAAAATAATTTTTTTAAACAATTAATTTCCATAATGACTGTCTTGAGCCTTTTGTTCATGGTATTAGGTAT
TCAGGGTAATAATGAGGTTAAAGCAGCAACTTTAGCCACGCCACCAGCTCCAATTAATCAAATTTTCCCAGATGCAGATT
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CGCTAAATGAGCCAGTAGACTACAATGTCACATTTAATATAGACGGCAATACAAGCGAAGTAAAAACTGTAACAGAAGAA
GATCTAATTCCAGAACCTGCGAACCCGACCAAACAAGGTTATACATTTGATGGTTGGTACGACGCCGAAACAGGTGGAAC
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TGAATTTTGATATAGATGGCGCAGTAATGAATGAAGCGGTAGTATACGATACTTTGCTCAATGAACCGACCGCTCCAACC
AAACAAGGTTATACATTCGATGGTTGGTATGACGCAGAAACAGGCGGTAATAAGTGGGATTTCAAAACGATGAAAATGCC
CGCAAATGATGTTACTTTATATGCACATTTTACTGTCAGCAGTTACCAAGTGAATTTTGATATAGATGGTGCGGTAACGA
ATGAAGCAATAGTATACGATACCTTACTCAATGAACCGGCGACTCCAACTAAACAAGGTTATACATTTGATGGCTGGTAT
GACGCAGAAACAGGCGGTAATAAGTGGGATTTCAAAACAATGAAAATGCCCGCAAATGATGTCACTTTATATGCACATTT
TACCATCAACAACTATCAAGCTAATTTTGATATAGATGGTTCGGTAACGAATGAAACGATAACATATGATACCTTACTTA
ATGAACCGACTGCTCCAACCAAACAAGGTTTCCTTTTCGATGGGTGGTATGACGCAGAAGTAGGCGGAACAAAATGGGAT
TTTAACACGATGAAAATGCCTGCGAACGATATTAATTTGTACGCACATTTCAGTAAAGAAACGCCACTTATTCCTAGCCC
ATCTGACGAATCAGACTCGAAACCTACCAATGGATCAATCACTATAAATGAACCGAGTGCAACTAGTATGCCAGCCCAAA
ATAATAACATCACAGTAACAGCAGGGGAAAATACTCCAGAACTAACAACAGCTAAACTTCCGAAAACTGGAGATAATAAC
CCGTGGCAAACACTATTCGCCGGGATATTACTTTCATCATCCGCGTTTTATATTTGGAGAAAAAAAGCATAA

Protein sequence :
MKAKNNFFKQLISIMTVLSLLFMVLGIQGNNEVKAATLATPPAPINQIFPDADLAEGIRAVLQKASVTDVVTQEELESIT
KLVVAGEKVASIQGIEYLTNLEYLNLNGNQITDISPLSNLVKLTNLYIGTNKITDISALQNLTNLRELYLNEDNISDISP
LANLTKMYSLNLGANHNLSDLSPLSNMTGLNYLTVTESKVKDVTPIANLTDLYSLSLNYNQIEDISPLASLTSLHYFTAY
VNQITDITPVANMTRLNSLKIGNNKITDLSPLANLSQLTWLEIGTNQISDINAVKDLTKLKMLNVGSNQISDISVLNNLS
QLNSLFLNNNQLGNEDMEVIGGLTNLTTLFLSQNHITDIRPLASLSKMDSADFANQVIKKPARNFSKTLSVPNNITSIDG
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PWQTLFAGILLSSSAFYIWRKKA

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
inlF AAB67968.1 internalin Virulence Internalin Protein 0.0 74
inlA CAC20628.1 internalin A Virulence Internalin Protein 2e-136 45

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
inlF YP_006680867.1 internalin F VFG0075 Protein 9e-137 45