|
Name : qoxB (LMOSLCC2378_0017) Accession : YP_006674686.1 Strain : Listeria monocytogenes SLCC2378 Genome accession: NC_018585 Putative virulence/resistance : Unknown Product : quinol oxidase AA3 subunit I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 1.10.3.- Position : 19425 - 21404 bp Length : 1980 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAAATGGAATGAGTTTATCGTAACTGGCGACCCAATGATTTTAGGCGCGCAGATTTCTATCGTACTTGTAAGTATTGG TGTTGTTGCGTTACTAACTTATACAAAAAAATGGAAGTGGCTCATGAAAGAGTGGATTTCTTCCGTTGATCATAAAAAAA TTGGTATTATGTACTTGCTTGCTGCTGTCTTAATGTTTTTCCGTGGTGGTGTGGATGCGCTAATGATGCGTACCCAGCTC GCTTTACCGGATATGAAATTTTTAGACGCACAGCATTACAATGAAGTTTTTTCTACACATGGAACGATTATGATTTTATT TATGGCGATGCCGTTTATCATCGGATTGATGAACATTGCCGTACCACTTCAAATTGGTGCGCGTGATGTAGCATTTCCAT TTTTAAACAACTTAAGTTTTTGGACGTTCTTTATGGGAGCGATGCTATTTAACTTATCATTCGTAATTGGTGGTTCGCCA GATGCTGGTTGGACAAACTATGCGCCACTTGCGACAGATTTTAGCGCTGGATATGGAATTAACTTCTATCTTCTAGGTGT TCAAATCGCTGGTATTGGTACGCTGATGACGGGGATTAACTTTTTCGTCACGATTTTAAGAATGCGTACAAAAGGTATGA CGTTAATGAAAATGCCAATGTTTACTTGGTCTTCATTAATTACAAGTTTGATCATTATTTTCGCTTTCCCAGTTTTAACA GTGGCACTTGCTTTGATGTCATTTGACCGACTGTTTGGGACAGCATTCTTCACACTCACGAATGGCGGGCTCCCAATGAT GTGGGCCAACTTGTTCTGGGTTTGGGGTCATCCGGAAGTATATATTGTTATTTTGCCAGCTTTCGGTATTTTCTCAGAGA TTATTTCTACTTTCTCGAGGAAAAAATTATTCGGTTATCCGGCGATGGTTGCCGCGATGGCAGTTATTTCTTTACTAAGT TTCCTAGTTTGGGTCCATCACTTCTTTACAATGGGATCAGGGGCGCTTGTTAACTCCTTCTTCTCCATTACAACGATGAT GATTGCGATACCGACCGGGATTAAGATATTCAACTGGCTCTTTACGATGTACAAAGGGCGAATAACCTTTACAACGCCAA TGCTTTGGTCGCTTGCCTTTATCCCTAACTTTGTTGTTGGTGGGGTAACTGGGGTTATGCTTGCGATGGCTGCAGCCGAT TATCAATATCACAATACGTACTTCTTAGTATCCCATTTCCACTACGTATTAATTGCTGGAACTGTGTTCTCCTGCTTTGC CGGGCTTACATACTGGTATCCAAAAATGGTCGGTTACAGACTAAATGAAAAAATTGGTAAATGGTTCTTCTGGATTTTCG TTGTTGGATTTAACGTTTGTTTCTTCCCGCAATATTTCCTAGGACTAGATGGTATGCCGCGTCGTATTTACACTTACGTA CAAGGTGATGGCTGGACAACGCTTAACTTTATCTCTACTGTGGGCGGATTCTTGATGGGTGTAGCATTCTTAGTTCTTTG CTACAACATCTACTACAGCTACAAAAACTCTAAACGTGAAGTTACTGGTGACCCGTGGGATGCTCGTACGCTTGAATGGG CTACAAGTTCCGCTGTTCCTCCAAAATATAACTTTGCTGTTTTACCTGAATGGAATGACTTGGATGATTTCTGGAATAGA AAACAAAAAGGCGATCCATATGTAAATGATAAAAATTATAAACCAATCCATATGCCAAGTAATACCATGGTTGGGTTTGT AATGTCTGTCTTCTTCTTCATTGCAGGTTTCGGACTAGTCTTCTACTGGTACTGGATGGGAATTATTGGCCTAGTTGGTA TTTTAGGATGTATGATTTATCGTTCATTCCAAAATAACGATGGTTACCACGTTGAAGTGGACGAAATTAAAGCAACAGAA GAACATAATGCGCGCGAACTTGCGACTGGTGTGAAGGAGGGTAACCCATGGAATCTGTAG Protein sequence : MKWNEFIVTGDPMILGAQISIVLVSIGVVALLTYTKKWKWLMKEWISSVDHKKIGIMYLLAAVLMFFRGGVDALMMRTQL ALPDMKFLDAQHYNEVFSTHGTIMILFMAMPFIIGLMNIAVPLQIGARDVAFPFLNNLSFWTFFMGAMLFNLSFVIGGSP DAGWTNYAPLATDFSAGYGINFYLLGVQIAGIGTLMTGINFFVTILRMRTKGMTLMKMPMFTWSSLITSLIIIFAFPVLT VALALMSFDRLFGTAFFTLTNGGLPMMWANLFWVWGHPEVYIVILPAFGIFSEIISTFSRKKLFGYPAMVAAMAVISLLS FLVWVHHFFTMGSGALVNSFFSITTMMIAIPTGIKIFNWLFTMYKGRITFTTPMLWSLAFIPNFVVGGVTGVMLAMAAAD YQYHNTYFLVSHFHYVLIAGTVFSCFAGLTYWYPKMVGYRLNEKIGKWFFWIFVVGFNVCFFPQYFLGLDGMPRRIYTYV QGDGWTTLNFISTVGGFLMGVAFLVLCYNIYYSYKNSKREVTGDPWDARTLEWATSSAVPPKYNFAVLPEWNDLDDFWNR KQKGDPYVNDKNYKPIHMPSNTMVGFVMSVFFFIAGFGLVFYWYWMGIIGLVGILGCMIYRSFQNNDGYHVEVDEIKATE EHNARELATGVKEGNPWNL |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 4e-90 | 45 |
