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Name : LMOATCC19117_1114 (LMOATCC19117_1114) Accession : YP_006672915.1 Strain : Listeria monocytogenes ATCC 19117 Genome accession: NC_018584 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA helicase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 3.6.1.- Position : 1143910 - 1145841 bp Length : 1932 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGACATCAAATATTTTTGAAATTAATTATAATGGTACTGGACAAAGCCAAAATACAAATGCGTTAGGAATGCGTGAGAT GCAGGCGCGTGTCTATGAAAAACGTACATCTCAATATCTATTAGTTAAAGCTCCCCCTGCATCAGGGAAATCACGCGCTT TGATGTTTGTAGCTTTGGATAAGCTCGCAAATCAAGGCATAAAAAAAGTAATTATTGCAGTTCCAGAACGTTCAATTGGA AAATCTTTTCAAACCACAGAACTAGCAAAATTCGGCTTCTTCTCTGATTGGATTATTAATCCCAAAAACAATCTCATGGA TCGTGGAACAAGTGAAAGTAAAGTGTCTCAGTTTGTTAATTTTATTCGTTCAACAAACTCAGAAGATAATATTATGGTTT GCACCCACGCGACTCTACGTTTTGCTTTTGAAAAATTGAATGATTCTGACTTTGACAATGTTTTACTTGCCATTGATGAG TTTCATCATGTATCACAAGATGATAATTCTGTTCTTGGTAATGCGATGCGTAAAATTATGGGAAATTCTTCTGCGCATAT CATTGCAATGACAGGTTCCTACTTTCGAGGTGATTCAGTACCAATTTTAGAGTCTACTGATGAGCAAAAATTTGATAAGG CAACCTATACTTATTTTGAACAACTTGAAGGTTATAAATATCTAAAGAGTTTTGCAATGGGCTATAGCTTTTATCGAGGT CGTTATACTGATGCACTTTCAGAAGTTTTGGATACCTCAAAGAAAACAATTATTCATATTCCAAATGTAAATTCCGGCGA ATCCACCAAAGATAAATATGATGAAGTTGACCGTATTCTAGAAGAATTAGGTGATGCAAAATTTGATGAAAAATCAGGGA TTTGGCTACTAACTGGAAAATATGGACGAGTATTAAAAATTGCTGATTTGGTTAATGAAGAAGGTCGTGAAAAAGTTCAA GAATATATCCGAAATATGTCTAAACTAGATGACTTGGACATTATTATTGCACTTGGTATGGCAAAAGAGGGATTTGACTG GCCTTTCGCAGAATATGCTTTAACAATTGGTTATCGTAATTCATTAACTGAAGTTGTGCAAATTATTGGGCGCGTGACTC GTGATAGTTCAAATAAAACTCATGCACAATTTACCAATTTAATTGCTCAACCAGATGCTCAAGATGATGAGGTCATGTTT GCGGTTAATAATGTCATGAAAGCAATCACTGCAAGTCTTTTGATGGAATCTGTATTAGCTCCAAACTTTAACTTTAAGCG TAAAGATAATGATGACCAAAAATCAAAAGGAACAGAAATATTCATCAAAGGTTTAAAAGAGACCAGTACTGAGCGTTCAA AAAATATTATTCAAAACGATTTGAATGACTTGAAAGCGACTATTTTACAAGACAGTCAAATTCAGCAAGCTATTGCTGCC GGTGTAAGTGCAAAAGTGATTAATAAGCAACTTGTACTGCGAGTGATAATGAATACCTATCCTGATTTGTCAAATGATGA GACTGAGGAAGTTCGTCAGCACTTAGTTGCACAAGCTGTCATTCAGTCTGCGGAACATGAAGAAGGAACAGGCGGGAATC AATTTCTTAGAATGGCGAATAAATTTATAAATATTGATGAAATTGCAATTGATTTGATTGATGAAGTAAATCCCTTCCAG CGTGCCTATGAGGTTATTTCAAAGGAAATTGATGCACCAACTTTACGCTTTATCCAAGATTATATGGATGGTATAAAATT CACTTTTTCTGAAGATGAATTAGTTATGTTGTATCCTCAAATTGTTCAATTTAAAAATGAAAATGGTAGAATTCCAGATA AGTCTAGTTCAGATCAATACGAGCAAAGATTAGCCTATGCTTTATTACGTTTGGAGCAACTAAGAAGAGAGAGACAAGAT GGACAAGCTTAA Protein sequence : MTSNIFEINYNGTGQSQNTNALGMREMQARVYEKRTSQYLLVKAPPASGKSRALMFVALDKLANQGIKKVIIAVPERSIG KSFQTTELAKFGFFSDWIINPKNNLMDRGTSESKVSQFVNFIRSTNSEDNIMVCTHATLRFAFEKLNDSDFDNVLLAIDE FHHVSQDDNSVLGNAMRKIMGNSSAHIIAMTGSYFRGDSVPILESTDEQKFDKATYTYFEQLEGYKYLKSFAMGYSFYRG RYTDALSEVLDTSKKTIIHIPNVNSGESTKDKYDEVDRILEELGDAKFDEKSGIWLLTGKYGRVLKIADLVNEEGREKVQ EYIRNMSKLDDLDIIIALGMAKEGFDWPFAEYALTIGYRNSLTEVVQIIGRVTRDSSNKTHAQFTNLIAQPDAQDDEVMF AVNNVMKAITASLLMESVLAPNFNFKRKDNDDQKSKGTEIFIKGLKETSTERSKNIIQNDLNDLKATILQDSQIQQAIAA GVSAKVINKQLVLRVIMNTYPDLSNDETEEVRQHLVAQAVIQSAEHEEGTGGNQFLRMANKFINIDEIAIDLIDEVNPFQ RAYEVISKEIDAPTLRFIQDYMDGIKFTFSEDELVMLYPQIVQFKNENGRIPDKSSSDQYEQRLAYALLRLEQLRRERQD GQA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| CDPW8_0255 | YP_005141822.1 | putative ATP-dependent helicase | Not tested | Not named | Protein | 9e-113 | 47 |
