Name : R0052_04520 (R0052_04520) Accession : YP_006655608.1 Strain : Lactobacillus helveticus R0052 Genome accession: NC_018528 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ATP-dependent DNA helicase RecG Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 784184 - 786214 bp Length : 2031 bp Strand : + Note : COG1200 RecG-like helicase DNA sequence : ATGATAGAAAACGCATTATTTGCTCCTGTAACAGATTTAAAAGGTGTAGGGACAAAAACTGCGGCTGATTTAGGTAGCTT AGGCATTTATAGTATTTATGATTTGCTCTTTTATTTTCCTTTTCGCTATGACGAATTGCAGACGTTGCCTTTAGATCAAA TCATGGATGGTCAAAAGGTAGTGCTAAAGGGAATTGCAGCAACTGAACCATTTGTTAGTCGTTTTGGCTATAAAAAGAAC CGCCTAAGTTTCAAGATGAGAATTGACCATGATGTAATCATGGTCAATTTTTTTAATCAGCCATGGCTTAAGAGCAAGAT TGAAATTGGCGAAGAAGTAGCCATTTATGGCAAATATAATGTTGCTCGGCAAAGTCTTTCGGCTTTTAAGTTTATTGCAG CCAAAGAAAATGACAGTGGCATGGCACCAATTTATCCGGTTAATCGGCATGTTAAACAAAAAAAGCTAGTTAGTTTAATT AACTTGGCAATAGATGGTTTTTTAGATCAAGTTCGTGATATTGTTCCTGAAAATATCAGAGAAAAATATCGCTTATTAAC TGATCAAGAGATTATTCAAAAAATGCATCATCCTAAAAATAGTACTGAAGCAAATTTAGCTAAAAGAAGTGCTATTTTTC GAGAATTTTTCATTTTTGAATTACAGCTGGCACTTTTGGCTAATCATGATGGCAAACAAGCAGGCTATCCTAAGAATTAT GATTTAAAGGAAATAACTCAATTGACGTCTTCTTTGCCATTTGAATTATCAGATGATCAAAAAGAAGTTGTTAATGAAAT ATTTGCGGATATGCAATCATCTGGTCAGATGCGTCGCTTGTTGCAGGGGGATGTAGGATCAGGTAAAACGGTTGTAGCTG TTTATGCTATATTTGCAGCAATTACTGCAGGCTATCAAGTTGCCTTGATGGTGCCAACCGAAATTTTGGCTACGCAGCAT TTTAAAAAGATTGATGAATTGCTTCGCCCATTGGGTGTAATAGTGGCTTTGTTAACAGGTAATACCAAAACATTAGAGCG CAGAGAAATTTATCGCGAATTGACGGATGGTACGATTAATGTGGTGATTGGTACACATGCTTTAATTCAAGAAAATGTCA TTTTTAAGAAGCTGGGTTTGGTAATTATTGATGAGCAGCACCGTTTTGGCGTTGGACAAAGACAAGCTTTAATCAATAAA GGCGATCAACCTGATATTTTAGCAATGACAGCTACGCCAATTCCACGTACGCTTGCTTTAACAGTATATGGGGACATGAC TGTTTCTGAAATTCATCACATGCCCGCTGGTAGAAAACCTATTATTTCATCTTGGAAAACTAGCAGTCAGATGAAAGATG TTTATCAAAAAATGCAGGATCAACTTGATCAAGGCTTTCAAATTTATGCTGTTACGCCGCTGATTACTGAATCTGAAACA TTAGATTTAAAGAATGCTGAAGAATTGCATGCTAAATTAAGTCATGATTTTCCAGATCAAAAGGTGGTTTTGCTTCATGG GCAAATGCCAGGGCCTAAAAAAGATGAGATTATGACTGCTTTTGCAAGTGGAGAGATCAATATCTTAGTGACAACCAGTG TAATTGAAGTTGGAGTCGATGTAGCTAATGCCAATATGATGGTCATTTATAATGCAGATCGTTTTGGATTAAGCCAGCTG CACCAGCTTCGCGGTAGAATTGGTCGTGGCAAGACGCAAAGTTACTGCGTATTTGTAGCCGACCCTAAAACTGATTCTGG TAAGGCAAGAATGAAAATAATTGCCGCCACTAATGATGGCTTTAAATTAGCAGAAGAAGATCTTAAAATGCGTGGTGAGG GTGATCTTTTTGGTAAAGCTCAATCCGGATTGCCGGAATTTCGCGTGGGGGATGTAGTTAATAACTACAATACCTTGGTT GTTGCACAAAAAGTAGCCCGAGATCTAGTTCAACAAGATCCTAAATTAGCTGATTATCCAACGCTTAAACAAGTGCTAGA ATATAAACAATTAGAACAAAATAGAATTTAA Protein sequence : MIENALFAPVTDLKGVGTKTAADLGSLGIYSIYDLLFYFPFRYDELQTLPLDQIMDGQKVVLKGIAATEPFVSRFGYKKN RLSFKMRIDHDVIMVNFFNQPWLKSKIEIGEEVAIYGKYNVARQSLSAFKFIAAKENDSGMAPIYPVNRHVKQKKLVSLI NLAIDGFLDQVRDIVPENIREKYRLLTDQEIIQKMHHPKNSTEANLAKRSAIFREFFIFELQLALLANHDGKQAGYPKNY DLKEITQLTSSLPFELSDDQKEVVNEIFADMQSSGQMRRLLQGDVGSGKTVVAVYAIFAAITAGYQVALMVPTEILATQH FKKIDELLRPLGVIVALLTGNTKTLERREIYRELTDGTINVVIGTHALIQENVIFKKLGLVIIDEQHRFGVGQRQALINK GDQPDILAMTATPIPRTLALTVYGDMTVSEIHHMPAGRKPIISSWKTSSQMKDVYQKMQDQLDQGFQIYAVTPLITESET LDLKNAEELHAKLSHDFPDQKVVLLHGQMPGPKKDEIMTAFASGEINILVTTSVIEVGVDVANANMMVIYNADRFGLSQL HQLRGRIGRGKTQSYCVFVADPKTDSGKARMKIIAATNDGFKLAEEDLKMRGEGDLFGKAQSGLPEFRVGDVVNNYNTLV VAQKVARDLVQQDPKLADYPTLKQVLEYKQLEQNRI |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
recG | CAJ77039.1 | ATP-dependent DNA helicase | Not tested | AbaR1 | Protein | 5e-97 | 42 |