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Name : R0052_11285 (R0052_11285) Accession : YP_006656749.1 Strain : Lactobacillus helveticus R0052 Genome accession: NC_018528 Putative virulence/resistance : Unknown Product : neopullulanase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 2002751 - 2004472 bp Length : 1722 bp Strand : - Note : COG0366 Glycosidases DNA sequence : ATGCAATTAGCAGCATTAAAACACAGAACTGAAAGTGAAGACAGCTTTGTAATTGATGCGACTCATGTTCGTGTTCGTTT TCATAGCGCAAAGAATGATGTTGAAAAGGTTATTGTGCACTATTGCGATAACTATTTGCCATTAAACCAGGCTAAAACAA TTGAAATGACTAAAATTGGTGAAGGCCAAGTCGAGGATCACTGGGGAGCCACCCTTGAGGCACCATTCCATCGTTTAAAG TACACATTTGAAGTAATTGGTAATGATGGAACCAGCGTTGTTGTAGGTGATAGGGCAATTAGCAGCGATGTTGAAAGTGC TCTGATGGAAGACGGATATTATTTTAAGGTGCCGTATTGTCATGATATTGATATGGTTAAGACACCAGAATGGGTAAGAC ATACTGTTTGGTACCAAATTTTCCCAGAGCGTTTTGCTAATGGTGATAAATCTAATGATCCTAAAAATGTAAAGCCTTGG AATCCTGAAGACCATCCTGGTCGAGAAGACTACTACGGTGGTGATTTGCAAGGTGTGTTAGACCATTTGGATTATCTAAA GAAGCTAGGAGTAAATGGCTTATACTTCTGTCCTGTTTTTAAAGCAGGGTCCAACCACAAATATGACACGATTGATTACT TGCAAATTGATCCGGAATTCGGTGATAAAGATCTATTTGCCAAGGTAGTTAATGAAGCTCATGCACGTGGCATGAAAGTT ATGCTAGATGCGGTGTTTAACCACTTAGGTGATAAGTCAATGCAATGGCAAGATGTGGTCAAAAATGGCCCAAGTTCTCG TTTTGCTGGCTGGTTCCACATTAATGAATATCCGGTTGAACCATATTATGATCCATTGCAAGGTGAAGGAAATCCTCAAT TTGATACTTTTGCCTTTGAAAAACACATGCCAAAATTAAATACTGCTAACCCTGAAGTACAAGACTTCTTGCTAGAAATA GCAACTTACTGGGTGAAATACTTTGACATTGATGCTTGGCGTTTGGATGTTGCCAATGAAGTGGATCATCATTTCTGGAA GAAGTTTCATAAGGCTGTGACTGATATCAAGCCAGACTTTTACATTGTCGGTGAAGTTTGGCACTCAGCTCGTCCATGGC TTAATGGTGATGAATTTACAGGTGTAATGAATTATCCATATACTTTGCAAATTGAAGATCATTTCTTTAAGCACAAGCTA ACAGCTGATCAAATGACCAAGCGTTTAACTGATCAGCTCATGAAGTACCGTGATTCAACTAATGCAGCAATGATGAACAT GCTTGATTCCCATGATACTGCTAGAATTTTGACAGTGGCTAACGGCGATCAAGATTTGGCTTTGCAGGCATTAACCTTTG AATTTGTGCAAAAAGGCAGTCCATGTATTTATTACGGTACTGAAATGGGAATGACTGGCGGCAATGACCCAGACTGTCGT AAGCCGATGGATTGGTCAAAAGAAGATGGACCTGTTTGGCAAAGAGTTCATGAACTGATTAAGTTCCGTTTAGACCATGA TGAGACCTTCGGAAAGGGTACAATTAAGTTACACGTAACAAAAAATGGCTTGATTGAGGTTGATAGAGACGGAATTGAAT CTGTTAAGGCATACTTTAATACCACCGATCATGATGTAAAAATCGATTGTAAAGATTCATTTAGTCAAGATTATCAAAAT GGAGTATTGGCTCCAAAAGGCTTTGTAATCACGGTTCGCTAA Protein sequence : MQLAALKHRTESEDSFVIDATHVRVRFHSAKNDVEKVIVHYCDNYLPLNQAKTIEMTKIGEGQVEDHWGATLEAPFHRLK YTFEVIGNDGTSVVVGDRAISSDVESALMEDGYYFKVPYCHDIDMVKTPEWVRHTVWYQIFPERFANGDKSNDPKNVKPW NPEDHPGREDYYGGDLQGVLDHLDYLKKLGVNGLYFCPVFKAGSNHKYDTIDYLQIDPEFGDKDLFAKVVNEAHARGMKV MLDAVFNHLGDKSMQWQDVVKNGPSSRFAGWFHINEYPVEPYYDPLQGEGNPQFDTFAFEKHMPKLNTANPEVQDFLLEI ATYWVKYFDIDAWRLDVANEVDHHFWKKFHKAVTDIKPDFYIVGEVWHSARPWLNGDEFTGVMNYPYTLQIEDHFFKHKL TADQMTKRLTDQLMKYRDSTNAAMMNMLDSHDTARILTVANGDQDLALQALTFEFVQKGSPCIYYGTEMGMTGGNDPDCR KPMDWSKEDGPVWQRVHELIKFRLDHDETFGKGTIKLHVTKNGLIEVDRDGIESVKAYFNTTDHDVKIDCKDSFSQDYQN GVLAPKGFVITVR |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SPN23F_09660 | YP_002510949.1 | alpha-amylase | Not tested | PPI-1 | Protein | 1e-128 | 45 |
