Name : R0052_10880 (R0052_10880) Accession : YP_006656675.1 Strain : Lactobacillus helveticus R0052 Genome accession: NC_018528 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 1.17.4.1 Position : 1925091 - 1927259 bp Length : 2169 bp Strand : - Note : COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit DNA sequence : ATGACTGATAATCTTAATCATGATTCATATATTTCTTTAAATGCACTTACTAAATTTAAAGATGAAAAAGGAAATTATAA TTTTAAAGCTGACAAGGAAGCTACTAAGCAATATCTTGAAAATCATATTGAACCAAGAATGAAAAAGTTTGCTTCTTTAG AAGAAAAATTAGCTTATTTAGTTGATAATAATTACTATGATAAAAAAGTTCTAGATTTATATACACCTAAATTTATTAAA GAAATTTTCAAATTAGCTTATGCACAAAATTTTAGCTTTTTGAACTTTATGGGTGCAGCTAAATTCTATAAAGCATATGC CTTAAAAACAAACGATAATAAACAATTTTTAGAACGTTTTGAAGATCGGGCTGTTATGAATGCTTTATTTTTAGCTGATG GCAATGAAGAACTGGCCTTGAATTTAGTTAAAGATATTATTAGTAATCGTTTCCAGCCAGCAACTCCGACTTTCTTGAAT GCAGGTAAAAAGAGACGTGGTGAATATATTTCATGTTATTTGCTCAGAGTTGAAGACAATATGGAATCAATTTCACGAGC AATAAGCACAAGTCTGCAATTATCTAAACGTGGTGGTGGTGTTGCTCTATGCTTAACTAATTTGCGTGAATTAGGTGCAC CTATTAAAAAAATGAAGAATTTATCTAGTGGGATAATTCCTGTAATGAAATTACTAGAAGATTCATTTTCTTATGCCAAT CAATTAGGGCAAAGACAAGGTGCCGGTGCAGTTTATTTAAGTGCCCATCATCCCCAGATTATGCAATTTTTAGATACTAA ACGAGAAAACGCTGACGAAAAGGTAAGAATTAAATCTTTATCACTTGGCGTAGTGATTCCAGATATTACTTTTGAACTAG CCAAAGAAAATAAAAAGATGGCTTTGTTTTCACCATATGATATTAAACGTGAATATGGTAAACCAATGTCAGATATTTCA ATTACTAAAGAATACCAAAATCTCCTTAATAATCCATGTATTAAAAAGACATTTATCAGTGCTAGAAAATTCTTCCAAAC TATTGCTGAAGTTCAATTTGAATCAGGGTATCCTTATATTATGTATGAAGATACTGTCAATCGAAGAAACCCACAAAAGA AATTGGGGCGGATCGTGATGTCTAATTTATGTTCAGAAATTGCTCAGGTTAATACGCCAAGTACCTATAATGAAGACTTA AGTTTTAATAAGACGGGCTACGATGTTTGTTGTAATTTAGGATCACTTAATATTGCAGCAGCAATGAATAGCGCTGACAA GTTAGGTGGTTTGGTTTCTGATAGTGTTCAAGCGCTTAATCGTGTTGCCAGGTCTTCAGATTTAGATTGTGCTCCTTCAA TTAAAAAGGGAAATAAAGCTAATCGAGCAATCGGTCTAGGAGCAATGAATTTACATGGCTTTTTAGCAACTAATCATATT TATTATGATTCACCAGAAGCAGTTGAATTTACAGGAATTTTCTTTTATACAATTGCATACCATGCATTTAAAGAATCAAA TAAATTAGCTGAAAAGTATGGTGCTTTTAAAGGATTCAAAGATTCATCATATGCTAGTGGTGATTATTTCAAAAAATTTA TTGATGAGGAAGTCTCACCGAAAACAGACAAGATTAAAGAAATTGTAGCTAAATATAAATTAGTTATTCCAACTAAAGAA GATTGGGAAGAATTGATTACTAAAATTAAAAAGACAGGTATAGCTAATGCTAACTTATTAGCAGTTGCACCTACTGGATC AATTAGTTATTTATCTTCATGTACACCAAGTTTGCAGCCAGTAGTAGCTCCTGTTGAAACACGCAAAGAGGCTGATTTGG GTCGAATTTATGTACCAGCTTATAAGATTAATAAAGACAATTATGAGTATTACGAAAAGGGTGCATATGAAGTAGGACCT AATGCTATTATTGATATTACAGCTGCTGCACAAAAGTATGTTGATCAATCAATTTCGTTAACTTTATTTGTTGAAGATAA TGCAACAACAAGAGATTTAAATAAGGCTTATATTTATGCCTTTAAAAAGCGATGCAACTCAATTTATTATGTTAGAGTAA GAGAAAAAGTTTTAGCTGGTAGTGAGAACTTGACTGCAGACGAATGTTTAATTCAAAATGGTGCAGAATGCCAGAAATGT ATGATTTAG Protein sequence : MTDNLNHDSYISLNALTKFKDEKGNYNFKADKEATKQYLENHIEPRMKKFASLEEKLAYLVDNNYYDKKVLDLYTPKFIK EIFKLAYAQNFSFLNFMGAAKFYKAYALKTNDNKQFLERFEDRAVMNALFLADGNEELALNLVKDIISNRFQPATPTFLN AGKKRRGEYISCYLLRVEDNMESISRAISTSLQLSKRGGGVALCLTNLRELGAPIKKMKNLSSGIIPVMKLLEDSFSYAN QLGQRQGAGAVYLSAHHPQIMQFLDTKRENADEKVRIKSLSLGVVIPDITFELAKENKKMALFSPYDIKREYGKPMSDIS ITKEYQNLLNNPCIKKTFISARKFFQTIAEVQFESGYPYIMYEDTVNRRNPQKKLGRIVMSNLCSEIAQVNTPSTYNEDL SFNKTGYDVCCNLGSLNIAAAMNSADKLGGLVSDSVQALNRVARSSDLDCAPSIKKGNKANRAIGLGAMNLHGFLATNHI YYDSPEAVEFTGIFFYTIAYHAFKESNKLAEKYGAFKGFKDSSYASGDYFKKFIDEEVSPKTDKIKEIVAKYKLVIPTKE DWEELITKIKKTGIANANLLAVAPTGSISYLSSCTPSLQPVVAPVETRKEADLGRIYVPAYKINKDNYEYYEKGAYEVGP NAIIDITAAAQKYVDQSISLTLFVEDNATTRDLNKAYIYAFKKRCNSIYYVRVREKVLAGSENLTADECLIQNGAECQKC MI |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
cur_1481 | YP_001800875.1 | ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 58 |