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Name : R0052_06185 (R0052_06185) Accession : YP_006655878.1 Strain : Lactobacillus helveticus R0052 Genome accession: NC_018528 Putative virulence/resistance : Unknown Product : trehalose 6-P hydrolase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1085349 - 1087010 bp Length : 1662 bp Strand : - Note : COG0366 Glycosidases DNA sequence : ATGAATGATTTAGGCAAAAAAGTTATTTACCAAATTTATCCCAAATCTTTTTATGACTCTAATGGTGATGGAATTGGCGA TATTCCAGGCATTATTCAAAAAATTGACTATATTAAGAAACTTAATGTTGATATGCTTTGGTTTAATCCATTTTTTGTAT CGCCGCAGAATGACAGCGGCTATGATATTGCAGATTACTATAATATCGATCCTCGCTTTGGTACGATGGCTGATTTTGAA GAATTGGTTGCTAAATTAAAGGAAATCGGTGTTGGCGTCATGTTAGATATGGTGCTTAATCACTGTTCTACTGAGAATAT TTGGTTTAAAAAAGCATTGGCAGGGGATGAAAAGTACCGCAAGTTTTTTTATTTGAGAAAGGCTAAGCCAGATGGCAGCG TACCTAATAATTGGCAAAGCAAATTCGGTGGTTCTGCCTGGGCCAAATTTGGTGATACAGATTATTATTACCTTCATTTA TATGATCCAACTCAGGCTGACCTTGATTGGCATAATCCTGAAGTTAGAAAAGAGTTGTTCAAGGTAATTAACTTCTGGCG CAGCAAGGGCATACATGGCTTCCGCTTTGATGTAATTAATGTTATTGGCAAGGATGAAGAATTGGTTGATTCAACTGATC CAGTTGAAGAAAAAAGTTTGTACACAGATACTCCTGTAGTTCATAAGTATTTAAAGGAAATGAACGCTGCAACTTTTGGT CAAGATCCCGATTCTGTAACAGTAGGAGAAATGTCATCAACCACAATTGCTAATTCAATTGAATACTCCAAGCCAAGTGA ACATGAATTATCCATGGTCTTTACTTTCCATCATTTGAAAGTTGATTATAAAGATGGTGAAAAATGGTCTAAGATGCCAT TTGATTTTATGAAGCTCAAGGAATTATTTACTGAATGGCAAGAAAAGATGGACCAAGGTGGGGGTTGGAATGCGCTATTT TGGAATAATCATGATCAACCTTGGGCGTTGAATCGTTTCGGTAATACTGGAAAGTATCGTGAAAAGTCCGCAGAGATGCT TGCAACTGCAACTCATTTAATGCGTGGTACGCCATACATTTATATGGGTGAGGAAATCGGAATGATGGATCCAGATTATT CATCTATGAATGATTACGTTGATGTTGAAGCAAAAAATGCATTTAAAGAATTAACGGCAAAAGGCATGAGTGAAAAAGAC GCTTTTGAAATCATTAAGACCAAGGCAAGAGATAATTCACGTGTGCCAATGCATTGGGATGATAGTCAATATGCTGGCTT TAGCGATGTAAAGCCATGGCTGATGCCAACTGATCAAAAGCAAGTTAATGTAGAGAAAGAACTATCAAGTGGCGAAATTT TTGACTATTATCAAAAACTAATTAAGTTGCGTAAGAATGAAAAGTTAATTTCTGATGGGCATATTAAGATGTTCTTGAAG GATCATCCACAAGTTTTTGCATATGAACGCTTCTTAGATAATAGTGATAAAAAATTATTAGTCTTTACTAACTTCTATGG CAAGGAATGTCAGGCTAAATTACCTAAAGAATATGTTAATAAGAACTATCAAGTTTTAATTAGCAATTATGAACATAACA GTAACCAATTTAAACAAGAGATCATCTTAAAGCCGTATGAGGCTTTAGCAGTTGTGATTTAG Protein sequence : MNDLGKKVIYQIYPKSFYDSNGDGIGDIPGIIQKIDYIKKLNVDMLWFNPFFVSPQNDSGYDIADYYNIDPRFGTMADFE ELVAKLKEIGVGVMLDMVLNHCSTENIWFKKALAGDEKYRKFFYLRKAKPDGSVPNNWQSKFGGSAWAKFGDTDYYYLHL YDPTQADLDWHNPEVRKELFKVINFWRSKGIHGFRFDVINVIGKDEELVDSTDPVEEKSLYTDTPVVHKYLKEMNAATFG QDPDSVTVGEMSSTTIANSIEYSKPSEHELSMVFTFHHLKVDYKDGEKWSKMPFDFMKLKELFTEWQEKMDQGGGWNALF WNNHDQPWALNRFGNTGKYREKSAEMLATATHLMRGTPYIYMGEEIGMMDPDYSSMNDYVDVEAKNAFKELTAKGMSEKD AFEIIKTKARDNSRVPMHWDDSQYAGFSDVKPWLMPTDQKQVNVEKELSSGEIFDYYQKLIKLRKNEKLISDGHIKMFLK DHPQVFAYERFLDNSDKKLLVFTNFYGKECQAKLPKEYVNKNYQVLISNYEHNSNQFKQEIILKPYEALAVVI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 1e-91 | 42 |
