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Name : PCC21_013290 (PCC21_013290) Accession : YP_006645985.1 Strain : Pectobacterium carotovorum PCC21 Genome accession: NC_018525 Putative virulence/resistance : Unknown Product : EpsC Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1519478 - 1521652 bp Length : 2175 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGCAGAGAAAATTTCAGTAAAAACAGCCGAAACAAATTCGGATGAGATTGATTTAGGTCGTTTGTTGGGAACACTGCT GGATAATCGCTGGTTAATTATTGGTGTTACGGCAGTTTTCACTATTATCGGTATTCTTTATGCCACGTTTGCGACGCCGA TTTATAAAGCAGATGCGCTAGTTCAGGTAGAGCAAGGTTCAGGTAACGCGCTATTGAAAGATATCTCTAGCTCTTTACCT GATTCAAAACCTGAGTCAGCTGCCGAAATCGAAATTATAAAATCACGGATGGTTGTCGGTAAAACAGTAGATGATTTATC GCTGAGCATTGTTGTACAACAGAAATATTTTCCTATTTTTGGTAAAGGTTTTGCCCGCTTGATGGATGAGAAACCTGGAA GAATTGCTGTCTCTAGGTTGGAAGTACCCAAGTCGTGGCAAGATGAGGCAATTGAATTACGTATTCTTGATTCACAGACG TATGAAATTGAAGCTGGTGATACAGTAAAATTTGAAGGTAAAGTTGGACAAATAGCGAAGCACGATAATATTTCTTTATT GGTCAGCGATATTCAAGCAGAGGCTGGTACTGTTTTTCGTCTTCAGAAATTAAATTCACTTACAGCAATCAATAACATAT TAAGTAAGTTTATAGTCGCTGATAAAGGCAAGGATACAGGTGTATTAGCTCTCAGCTTTGAAGGCGAAGATCCCGAACTA ACCAATAAAATATTAAATAGCATTAGCCATAATTATTTACAGCAAAACGTCGAGAGAAAATCAGAAGAAGCAGGGAAGAG CCTTGAGTTTCTTAAAGAGCAACTTCCGGATGTACGTTTAAATCTTGATAATGCTGATGATAAATTAAACACCTATCGTC AGGAAAATGAGTCTGTTGATTTATCGCTAGAAGCCAAAGCCGTTCTGGATACGATGGTTGCGATTGAAACACAGTTAAAC GAGCTAACGTTTAAAGAAGCAGAAGTATCAAAGCTCTATACTAAACAGCATCCAACTTATCGTTCATTGATGGAAAAACG AAAAACGCTGGAAGATGAGCGTGAAAAGATCAATAAGCGTGTTGCTGCTATGCCAAAAACCCAGCAGGAAATATTACGCT TAATGCGAGATGTTAATGTTGGGCAAGAAGTGTACATGCAATTGCTGAATAAACAGCAGGAACTTAGTATCAATAAAGCA AGTACAGTGGGTAATGTTCGCATAATTGATCCCTCTGCTATTCAGCTAAGCCCGGTAAAACCCAAAAAAGTTCTGGTTGT ATTACTAGCAATGTTGTTGGGCGGTATGATATCAACGGCATTTGTCGTGCTCAGAGCGGTGCTGCATAAAGGCATTGAAA GCCCTGAACAGCTTGAAGAAATGGGTATAAATGTCTATGCAAGTGTACCTTTGTCTGAATGGCAACAGAAGAAAGACCGG GTATTATTAACACGCTCGAATAAAAGCAACACGCGGTCTACTGAATTACTCGCGATTGGAAATCCTACCGACCTTGCTAT TGAGGCGATTAGAAGTCTACGTACTAGCCTGCATTTTGCGATGATGGAGGCGAAGAACAATGTATTGATGATTTCTGGTG CTAGCCCAGCAATTGGTAAAACGTTTATCAGTGCTAACCTTGGTGCCGTTATTTCTCAATCTGGCCAACGCGTTCTTATT GTTGACTGTGATATGCGTAAAGGGTATGCCCATGAACTGATGGGAACGCAGAGTGTTGATGGCTTATCGGACATTTTATC TGGGCAGATAGCCGTAGAGAAAAGCATTCGAAAAACGGCAGTGGAAAATATGGATTTTATTCCTCGCGGACAAATTCCAC CTAATCCGTCTGAACTTTTAATGCATAATCGGTTCCCAGAATTTATTAAGTGGGCTGCGGAGCATTACGATATTGTATTA TTAGATACACCGCCAATACTCGCTGTAACCGATGCTGCTATTATTAGCCGTCATGCAGGGACATCCCTCTTAGTCGCACG TTTTGAAGTGAATACACTCAAAGAAATTGAGGTAAGTATTCGTCGCTTTGAACAGAATGGTGCAGAAATAAAAGGTGTCA TTCTGAATGCCATCGTGAAACGTGCAGCAAGCTATTATGGCTATGGGAATTATCACTATTATACGTATGACTATAAATCA GAGAAAAATAGCTAA Protein sequence : MAEKISVKTAETNSDEIDLGRLLGTLLDNRWLIIGVTAVFTIIGILYATFATPIYKADALVQVEQGSGNALLKDISSSLP DSKPESAAEIEIIKSRMVVGKTVDDLSLSIVVQQKYFPIFGKGFARLMDEKPGRIAVSRLEVPKSWQDEAIELRILDSQT YEIEAGDTVKFEGKVGQIAKHDNISLLVSDIQAEAGTVFRLQKLNSLTAINNILSKFIVADKGKDTGVLALSFEGEDPEL TNKILNSISHNYLQQNVERKSEEAGKSLEFLKEQLPDVRLNLDNADDKLNTYRQENESVDLSLEAKAVLDTMVAIETQLN ELTFKEAEVSKLYTKQHPTYRSLMEKRKTLEDEREKINKRVAAMPKTQQEILRLMRDVNVGQEVYMQLLNKQQELSINKA STVGNVRIIDPSAIQLSPVKPKKVLVVLLAMLLGGMISTAFVVLRAVLHKGIESPEQLEEMGINVYASVPLSEWQQKKDR VLLTRSNKSNTRSTELLAIGNPTDLAIEAIRSLRTSLHFAMMEAKNNVLMISGASPAIGKTFISANLGAVISQSGQRVLI VDCDMRKGYAHELMGTQSVDGLSDILSGQIAVEKSIRKTAVENMDFIPRGQIPPNPSELLMHNRFPEFIKWAAEHYDIVL LDTPPILAVTDAAIISRHAGTSLLVARFEVNTLKEIEVSIRRFEQNGAEIKGVILNAIVKRAASYYGYGNYHYYTYDYKS EKNS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| orf41 | AAO18066.1 | Orf41 | Not tested | TTSS locus | Protein | 2e-171 | 52 |
