Gene Information

Name : Desmer_4354 (Desmer_4354)
Accession : YP_006624037.1
Strain : Desulfosporosinus meridiei DSM 13257
Genome accession: NC_018515
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : ammonium transporter
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 4564794 - 4566023 bp
Length : 1230 bp
Strand : -
Note : PFAM: Ammonium Transporter Family; TIGRFAM: ammonium transporter; TC 1.A.11

DNA sequence :
ATGGATACGGGAGATACAGCCTTTATACTAGTATCCTCAGCTATGGTTTTGCTGATGACCCCTGGTTTGGCGCTTTTCTA
TGGAGGTATGGTTCGTAAAAAGAATGTTCTTGGGACATTTATGCATAGTTGGATTACTATCGGACTTATTTCGCTGCAAT
GGATTTTAATAGGGTTCACCTTAGCTTTTGGAACTGATCAACATGGTTTAATTGGAGGGCTAGATTGGTTGGGTTTAAAT
GGAGTTGGAATGGATCCTAATCCAGACTATGCTGCCACTCTTCCTGCAATTGTCTTTATGGGATTTCAAATGATGTTTGC
TGTAATAACCCCTGCTTTAATTAGCGGCTCAATTGCGGAACGGATGCGTTTTCCAGCATTTATATTATTTATTCTTTTAT
GGGCAACCTTTGTTTATGATCCAGTAGCACACTGGGTTTGGGGTATTGGCGGGTTCTTAAGAAATCTTGGAGCACTTGAT
TTCGCAGGAGGAAATGTGGTTCATATTAGCTCAGGATACTCAGCCTTAATTGCTGCCTTAGTCCTTGGAAAGCGTAAAGG
CCTGGGTAAAGAATCCATGGCACCCCATCACCTGCCAATGACTGTTTTAGGTGCTGGGCTCCTGTGGTTTGGCTGGTTTG
GCTTTAATGCCGGGAGTGCCTTGGGTGCAAATGGGTTAGCAGGTATGGTCTTTGTTAATACGAATACAGCCGCCGCTGCA
GCTGCAGTCGCGTGGGCCTTAGTAGAACGAATGCATAGGGGAAAAACCACGATGCTTGGTGTAGCCAGTGGAGCTATTAG
CGGTTTAGTTGCTATTACTCCGGCTTGCGGATTCGTAACCCCCCTCGCCTCTATAGTAATAGGTTTAATTGGCGGTTTAG
TTTGTTACATTGCTATCAGTATACTCAAAGCAAAATTCGGCTATGATGACGCGCTTGATGCTTTTGGATGTCATGGAATC
GGAGGCACCTGGGGAGCTCTGGCAACAGGACTCTTTGCGACGAAAACAATCAATTCCGCCGGCGCTGATGGACTGCTTTA
CGGAAATCCTGCCCAGTTAGGAATCCAAGCGACAAGTGTTTTAGTGACAGTGGTGTTTGCTATCGCGGCTACATTCATAA
TCTTAAAAGTTATTGGTCTGGTAACCAAGCTACGGGTAAATGAAGAACAAGAGGCCAATGGCTTAGATTTATCACTACAC
GGAGAAACTGCTTATTCAGAGTTTATTTAA

Protein sequence :
MDTGDTAFILVSSAMVLLMTPGLALFYGGMVRKKNVLGTFMHSWITIGLISLQWILIGFTLAFGTDQHGLIGGLDWLGLN
GVGMDPNPDYAATLPAIVFMGFQMMFAVITPALISGSIAERMRFPAFILFILLWATFVYDPVAHWVWGIGGFLRNLGALD
FAGGNVVHISSGYSALIAALVLGKRKGLGKESMAPHHLPMTVLGAGLLWFGWFGFNAGSALGANGLAGMVFVNTNTAAAA
AAVAWALVERMHRGKTTMLGVASGAISGLVAITPACGFVTPLASIVIGLIGGLVCYIAISILKAKFGYDDALDAFGCHGI
GGTWGALATGLFATKTINSAGADGLLYGNPAQLGIQATSVLVTVVFAIAATFIILKVIGLVTKLRVNEEQEANGLDLSLH
GETAYSEFI

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
BJAB07104_00287 YP_008207752.1 Ammonia permease Not tested AbaR25 Protein 9e-74 56
BJAB0868_00291 YP_008211617.1 Ammonia permease Not tested AbaR26 Protein 9e-74 56