Gene Information

Name : Desmer_0312 (Desmer_0312)
Accession : YP_006620244.1
Strain : Desulfosporosinus meridiei DSM 13257
Genome accession: NC_018515
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : ammonium transporter
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 292956 - 294218 bp
Length : 1263 bp
Strand : +
Note : PFAM: Ammonium Transporter Family; TIGRFAM: ammonium transporter; TC 1.A.11

DNA sequence :
ATGACAACTTTAGATACTGGGGATATATCATTCCTAGTTGTTTGTACTCTATTAGTTTTTCTGATGACACCTGGTCTAGC
ACTATTCTATGGAGGAATGGTTAGAAAAAGAAACGTTCTTTCAATCATGATGCAAAGCTATGCAGCTATGGGGATAGTCA
CAGTAATTTGGGTATTATTCGGCTACTCATTAGCTTTTGGATCAGATTACGGTCATATTATTGGTGGTCTTGACTGGTTG
GGACTTAAGGGAGTTGGTCTCTCACCTAACCCTGATTATGCTCCAACTATCCCACATTTATTATTCTTTTTGTTCCAACT
AATGTTTGCCATTATCACTCCGGCAGTTATAAGTGGAGCAACTGCAGAGCGCATGCGTTTTACGGCATTTGTACTTTTTA
TAATTTTCTGGAGCACATTTGTCTATATACCTTTAGCCCATTGGGTCTGGGGTGTTGGCGGCTGGATGCGTAATTTAGGA
GTGCTTGATTTTGCAGGCGGCACTGTTGTGGAAGTAGCTTCCGGTGTATCCGGCTTGGTAGCAGCTTATGTTTTAGGTAA
GCGCTTAAAGATTGGGTATGAATGGAACATTCCTCATCATATGCCTAATGTTCTCTTTGGTGGGGGGCTATTATGGTTCG
GTTGGTTTGGATTTAATTCGGGAGGAGCAATGGGTGCAAATGGTGTGGCGGTGCTTGCCTTAGGTACAACACAAATTGCA
GGGGCAGCTGGAATGATTGGCTGGGCTATGCTCGAATGGCTTCATCGTCGTCAAATTACAGTTTTTGGCGCGGTCAGTGG
GATTATCTCTGCGCTTGTGGCTATCACCCCGGCAGCAGGTTATGTTTCAACAGTCAGTGCACTACTTATAGGGTTTGTTG
CAGGTGGAATCTGCTATTTAGCAGTTAGTATTTTAAAAGCAAAATTAGGATATGATGATGCTTTAGATGTTTTTGGAATC
CACGGAGTTGGAGGGACTTGGGGCACCATTGCAACAGGAATATTTGCCGACTTAAGCCTTAATCCCCAAGGCAAAAATGG
TTGGATTAATGGGGGTGGTTTTGAACCCGTATTAATCCAGTTATCTGCAGTTATAGCTACTTATCTATTTGTAGGGATAA
TGACATTCGTTATCTTGAAGGGTATTGCCATAATAACTCCTCTTAGAGCAAGCGATGAGGAGCAAGTCAATGGCTTAGAT
TTAACTCAGCATAGAGAAAAGGCCTATCCTGATTTTGAATTAAGTGAAAATGTTTATATATAG

Protein sequence :
MTTLDTGDISFLVVCTLLVFLMTPGLALFYGGMVRKRNVLSIMMQSYAAMGIVTVIWVLFGYSLAFGSDYGHIIGGLDWL
GLKGVGLSPNPDYAPTIPHLLFFLFQLMFAIITPAVISGATAERMRFTAFVLFIIFWSTFVYIPLAHWVWGVGGWMRNLG
VLDFAGGTVVEVASGVSGLVAAYVLGKRLKIGYEWNIPHHMPNVLFGGGLLWFGWFGFNSGGAMGANGVAVLALGTTQIA
GAAGMIGWAMLEWLHRRQITVFGAVSGIISALVAITPAAGYVSTVSALLIGFVAGGICYLAVSILKAKLGYDDALDVFGI
HGVGGTWGTIATGIFADLSLNPQGKNGWINGGGFEPVLIQLSAVIATYLFVGIMTFVILKGIAIITPLRASDEEQVNGLD
LTQHREKAYPDFELSENVYI

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
BJAB07104_00287 YP_008207752.1 Ammonia permease Not tested AbaR25 Protein 2e-66 47
BJAB0868_00291 YP_008211617.1 Ammonia permease Not tested AbaR26 Protein 2e-66 47