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Name : Desmer_1090 (Desmer_1090) Accession : YP_006620983.1 Strain : Desulfosporosinus meridiei DSM 13257 Genome accession: NC_018515 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate transport Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1125244 - 1126977 bp Length : 1734 bp Strand : + Note : PFAM: L-lactate permease; TIGRFAM: L-lactate transport DNA sequence : TTGACCTATCTACAGAATTATAACCCGACAGGTAACTTTTGGTTCTCTGTATTCTTAGCAGCTGTACCTATTCTGACTTT ACTCTACTTTTTAGCCCTCCACCCTCATAAAGCTAAAAACGGTGAAAGAATCTTAGGAATTTATGCCCCCTATGCAGCTG CTATTGCAGTTGTTGTTACTTTTTTCATATGTGTTTTTGTTATGAAAATGCCTGCCACCTCAACTGCCGCGGCCTTTGGG TATGGTGTGATAAGCGGATTGTTCCCTATTGGCTGGATTGTTTTCGGGGCAATTTTCTTATACACAATGACAGTTGTTAC CGGTAGGTTCGAAATAGTTAAAGACTCAATTGCCGGAATCACGCCGGATCGACGTTTACAGGCCCTGCTCGTTTCCTTTA GCTTCGGTGCCTTTATCGAAGGGGCTTCGGGTTTTGGTACTCCCGTAGCAGTGGCTGGTGCTATCATGGTTGGTTTAGGT TTCCGCCCCTTGACAGCTGCAGTTGTCTGCTTGATTGCCAATACAGCACCGGTTGCGTGGGGAGCTATCGGAACACCAGT ACTCACTCTTGCAAAAGTCACTGGTATCCCGGACGGCATGATTACTATGATGGCAGGCAGACAATTACCGTTTTTCTCAA TCCTCATTCCCTTCTGGTTAGTCGCAACACTGGTAATAATGGAAAAAGGCAAACTTAAGGAAGTCTTTGAAGTATGGCCT GCAATTCTCGTTACTGGAGCTTCCTTTGCTGTTACCCAGTTCATGATGGCCGAGGCTGGAATGACGATGCTTGTAGATAT CGGATCGGGAATTATGAGTATTGTTATCACCTCAATCTTCTTGAAAATATGGAAACCTAAAAATGTTATTACCAATGAAA TGGCTTATGCAAAACTAGAGGGAAGAGATCCAGGCAAACCGAAAGTTATCCCAAAACATCCTCTACCCGTTCTTCTTCAG GCTTGGATGCCTTGGGTATTCTTGGCTATCTTTGTAGCCATGTGGGGTGTCCCCAGTATCAAGGCTTGGTTGACCTCTCT CTTTAATCCTAGTTTTAACATTCCCTATCTTCATGGCTTAGTGTTTAAAACAGCACCGGTAACTGCTGGAGCTGTGGCAA AAACCGGAGAGGCTGCTGTATTTAGCTTCAATATATTTACAATGGCAGGAACAGGGATTCTAATCGCAGCGTTTATTACC GGAATCTTATTCCTCAGAGTCACTGCAGCTCAGTGGAAAGAAATTCTTGTTACGACAATTGTCCGTTTGAAAATTCCTCT TTCTGTTATCTCTTTAGTTATTGGCTTAAGTTACATGACAAAATATGCAGGAACTGACGTTATCCTTGCTTTAGCCTTTG CGAAAACAGGGACATTCTATCCCTTCTTTGCTGTTATGATTGGATGGCTGGGGGTTTTCCTTACCGGTAGTGACACAGCG TCAAACTCGCTCTTCGGTAACCTTCAGTTAGTAACCGCTCAGCAGTTGCATCTTGATCCTCTCCTCATGGTTACTGCTAA CAGTACAGGTGGAGTTATGGGTAAAATGATCGATGCTCAGAGTATTACGGTTGCGACGGCTGCTTGCTATGCTGACGCTG ACGAGGGGGTCAGAAATATCGGAGTTATTTTCCGGAAAGTATTCTGGCACAGCGTTGTGTTAGCAATGTTAATGGGTGTT TTAGTGTGGCTGCAAGCCTACGTATTCACCTGGATGATCCCAGTAATGAAATAA Protein sequence : MTYLQNYNPTGNFWFSVFLAAVPILTLLYFLALHPHKAKNGERILGIYAPYAAAIAVVVTFFICVFVMKMPATSTAAAFG YGVISGLFPIGWIVFGAIFLYTMTVVTGRFEIVKDSIAGITPDRRLQALLVSFSFGAFIEGASGFGTPVAVAGAIMVGLG FRPLTAAVVCLIANTAPVAWGAIGTPVLTLAKVTGIPDGMITMMAGRQLPFFSILIPFWLVATLVIMEKGKLKEVFEVWP AILVTGASFAVTQFMMAEAGMTMLVDIGSGIMSIVITSIFLKIWKPKNVITNEMAYAKLEGRDPGKPKVIPKHPLPVLLQ AWMPWVFLAIFVAMWGVPSIKAWLTSLFNPSFNIPYLHGLVFKTAPVTAGAVAKTGEAAVFSFNIFTMAGTGILIAAFIT GILFLRVTAAQWKEILVTTIVRLKIPLSVISLVIGLSYMTKYAGTDVILALAFAKTGTFYPFFAVMIGWLGVFLTGSDTA SNSLFGNLQLVTAQQLHLDPLLMVTANSTGGVMGKMIDAQSITVATAACYADADEGVRNIGVIFRKVFWHSVVLAMLMGV LVWLQAYVFTWMIPVMK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 8e-89 | 47 |
