|
Name : serS (B186_042) Accession : YP_006607935.1 Strain : Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-B Genome accession: NC_018507 Putative virulence/resistance : Unknown Product : seryl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 6.1.1.11 Position : 55165 - 56430 bp Length : 1266 bp Strand : + Note : PFAM: Seryl-tRNA synthetase N-terminal domain; tRNA synthetase class II core domain (G, H, P, S and T); TIGRFAM: seryl-tRNA synthetase DNA sequence : ATGTTAGATATTAAATTAATTTGCAACAATTTTAATAATGTTGTTAAAAAATTAGCCAGCCGTGGTTATGAATTAGATAT TAAAAAAATTAAAACGTTGCTAGAAATACGCAATAAGTTTAAAACTAATACTGAAACTTTACAAAATAAACGCAATATTA TATCTAAAACTATAGGAAACAACAAGAATTATATATTAAAAGTACAAAAGTTATTTGTAAAAGTAAAAAAAATAAATCAT AAACTTCATAAAAATATTTTATGTTTAGAAGTAACCAACAAAAAAATTTATAATATTTTATTTAAAATACCAAACTTACC ACATAATAGTGTACCAATTAAAACCAATATAGAGATAATACGTTGGGGAGTTCCTAAATCATTTAACTTTTCCATACGTG ATCATATTAAGATAGGCTTATTAAATGGTGATATTGATTTTGAATTAGCAACTAAAATAACTGGTTCTAATTTTACTTTA ATACGTGGAAATTTAGCTAAATTACATCGTGCTTTAATACAATTTATGTTAGATAAGCAAATTAATGATCATGGTTATGA AGAAATGTATGTGCCATATATAATTAATAGAACTTCTTTAGTAGGTACAGGTCAATTACCTCAATTTAATAAAAATGTTT TTGAACTTGAAGGAGAAAATGAATATTTTCTTATTCCTACAGCTGAAGTCCCTTTAGTTAATAGTGTCAGTGGTAAACTT TTCAATGTTAATGATTTACCAATTAAATTAACAGCACATTCTCCTTGTTTTAGAAACGAACCTGTATCTTATGGAACTGA TTCTCGTGGTATGTTGAGACAGCTACAGTTTGATAAAATAGAATTAGTTCAAATAGTACATCCTGAAAAATCTTATGTTG TATTAGAAGATATGACTAACCATGCTGAAGAAATTTTAAAAGCATTAAATTTGCCTTATAGAGTTATAAGTTTATGTAAG GAAGATATTAGTTTTTGTGCATCTAAAACTTATGATATAGAAGTTTGGATTCCTAGTCTTGAAACTTATTTAGAGATTTC ATCGATATCTAATTGTGAGGATTTTCAAGCAAGAAGAATTAAAACTAGATTTCGTATTAATAAAGACAAAGCAAAGCCTA AATTTGTACATACACTTAATGGCTCTGGACTAGCTGTTGGTCGTTGTTTGTTAGCCGTATTGGAATATTATCAAAACGAA GATGGCTCTATTACAGTTCCAGATAGTTTGCGCTCTTATATGTGTGGTATTAACCGTCTTTATTAG Protein sequence : MLDIKLICNNFNNVVKKLASRGYELDIKKIKTLLEIRNKFKTNTETLQNKRNIISKTIGNNKNYILKVQKLFVKVKKINH KLHKNILCLEVTNKKIYNILFKIPNLPHNSVPIKTNIEIIRWGVPKSFNFSIRDHIKIGLLNGDIDFELATKITGSNFTL IRGNLAKLHRALIQFMLDKQINDHGYEEMYVPYIINRTSLVGTGQLPQFNKNVFELEGENEYFLIPTAEVPLVNSVSGKL FNVNDLPIKLTAHSPCFRNEPVSYGTDSRGMLRQLQFDKIELVQIVHPEKSYVVLEDMTNHAEEILKALNLPYRVISLCK EDISFCASKTYDIEVWIPSLETYLEISSISNCEDFQARRIKTRFRINKDKAKPKFVHTLNGSGLAVGRCLLAVLEYYQNE DGSITVPDSLRSYMCGINRLY |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| serS | YP_003446791.1 | seryl-tRNA synthetase | Not tested | The aminoglycoside resistance gene cluster | Protein | 7e-82 | 44 |
