Gene Information

Name : B186_293 (B186_293)
Accession : YP_006608147.1
Strain : Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-B
Genome accession: NC_018507
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : homoserine dehydrogenase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : 1.1.1.3
Position : 350140 - 351414 bp
Length : 1275 bp
Strand : +
Note : PFAM: Homoserine dehydrogenase, NAD binding domain; Homoserine dehydrogenase

DNA sequence :
TTGATACGAATAGGTATTTGTGGATTAGGAACTGTAGGTGGAGGGACTTTTAATCTTTTAAAAAAAAATTATAATGAAAT
TTTTCGGAGAATAGGTAGTCAATTTATTATAGAACAGATAGGTACACGTAGTGATAATCCAATTTGTAATTTAACAGGTA
TTAAAGTAACGAGAAATATTTTTGAAGTTGTGCGAAATCCTAATGTTGATGTAGTTGTTGAATTAATAGGGGGGTGTAAT
ATAGCTAGAAAACTTGTATTAGAAGCTATTAATAATAAAAAACATGTTGTTACAGCAAACAAAGCAATGATTGCAATACA
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ATAAAACATTTAGGACTTTCTAAACGAAAGAAAACTGGAATAGAATTAAGAGTACACCCTGTTCTACTTCCAAAAAACAG
ATTATTATCTAATGTACATGGAGTAACAAACGCTATTGAAATAAATGGTGATGCTGTTGGATCAACATTGTTTTATGGCA
TAGGGGCTGGTTCAGAACCTACCGCTTCAGCCATAATATCTGATTTGTTAGATGTATCTAGAAATAAATTAACAGAACAT
ATTAATCGTACTCCTTATTTAGCTTTTAGTACTATGGCAACGGTATCTATTTTACCAATAGATCAAGTAATTACAGATTA
TTATTTGAGATTTATGCTTATTAGTTTCAATATGATAGGACATGTAGTAAATATATTTTATAAACTAGGAATTAGAATAA
AACATTTATTGCTAAAAAAACAGGAAAGTTCATTTGTTATTATTTTATTAACTTATAGTACAAAAGAAGCAAATATGAAT
TTAGCGATCGGTAAACTAGAATCTACAAATGTTATTCTAGGACATATTACTAGAGTAAGGGTTGAAAACGTTTAA

Protein sequence :
MIRIGICGLGTVGGGTFNLLKKNYNEIFRRIGSQFIIEQIGTRSDNPICNLTGIKVTRNIFEVVRNPNVDVVVELIGGCN
IARKLVLEAINNKKHVVTANKAMIAIHGKEIFCAAKKRGVMVAFEAAVAGGIPIIKCIREGLCANRIYSIAGIINGTVNY
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IKHLGLSKRKKTGIELRVHPVLLPKNRLLSNVHGVTNAIEINGDAVGSTLFYGIGAGSEPTASAIISDLLDVSRNKLTEH
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LAIGKLESTNVILGHITRVRVENV

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
BJAB07104_00305 YP_008207770.1 Homoserine dehydrogenase Not tested AbaR25 Protein 2e-79 47
BJAB0868_00309 YP_008211635.1 Homoserine dehydrogenase Not tested AbaR26 Protein 2e-79 47