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Name : lysS (CM5_00750) Accession : YP_006601152.1 Strain : Mycoplasma genitalium M2288 Genome accession: NC_018498 Putative virulence/resistance : Virulence Product : lysyl-tRNA ligase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 6.1.1.6 Position : 160949 - 162421 bp Length : 1473 bp Strand : + Note : COG1190 Lysyl-tRNA synthetase (class II) DNA sequence : ATGAGTGATCGTTTAAATGATCAAGCCCAACATCGCTTGCAGAAACTTTTAAGGTTAAAACAAACTAATAATGACCCTTA TTTAGTAACAAAAACTAGTCTAACCCATTCTTCAAAAAGCTTTCAAGTTGAATTTGAAAAATGTGCAGAAGAAGAGTTGA AGAAAAAAACAACTGTCTCACTAGCTGGAAGGATCATTGCTATTAGACAAACCTTTTTAATTATTCAAGATTTTGATGGT CAAGTCCAACTTTACATCAATAAAAAAATCCATCCTAAGTTATTTGATTACTTTAATGAATTTGTTGATATTGGTGATCA AATTGTTGTTAGTGGTAAGCCAATGTTAACTAAAACAAAGGTATTAACTTTAGCTGTTGAAGAGATGAAAATCATTGCTA AGTGTTTATTGGTTCCACCTGAAAAGTGACATGGACTTACTGATATTGAAACCCGTGCTCGCAAGCGCTTTCTTGATCTT ACCTATAACTTAGCAATGCGTGATGTTTTTCTGAAACGCACTAAGATTATTAAATCAATCCGTAGCTTTCTTGATCAAAA TGGTTTTATTGAGGTTGAAACCCCCACTTTACAAGCTGTTTTAGGAGGAGCTAATGCTAAACCCTTTAAAACCCATTACA ATGCTTTAAAAGCGGATTTTTATCTCAGAATTGCTAATGAAATAGCATTAAAAAAACTCATTATTGGTGGATTTAATAAG GTTTATGAAATGGGTAAAATGTTCCGCAATGAAGGGGTTGATACTACCCACAATCCTGAGTTTACCAGTATTGAAATATA TCAAGCTTATGCAGATTTTGAAGTCATGCTTGTGCTTGTTGAAAAGATGATTCAATCACTTTGTGAAAGCTTAAACCAAT TTAGCTTTAACTGAAATAACAAAACGATTAATCTAAAAACACCATTTCATAAGATAACAATGGTTGAACTTATTAAGAAA GTTACAGGGATCGATTTTAATTCAGTAAAAGATGATCAATCTGCCATTTTATTAGCAGAAAAACACCATGTTAAACTAGC AAAACACCAACAAAATAAGCAACACATCATTAATTTGTTTTTTGAACAATTTTGTGAACAAACATTAATTGAACCTACCT TTGTAACCCATTATCCAAAAGCAGTTTCTCCTCTAGCAAAACAAGATCCTTCAAATCCTGAATTCACCCAACGATTTGAA CTTTTTATTAATGGTAAAGAGATTGCTAATGCTTACAGCGAGCTAAACGATCCTTTAGAACAAAGAAAAAGGTTTGAACA ACAACTTGAAGAAAAACAGCTTGGTAATGATGAGACAAGTGAACTTGATGAATCGTTTTTAGAAGCATTAAGTTTTGGGA TGGTAAACACTGCTGGGCTTGGGATAGGTATTGATCGTTTGGTAATGTTGTTATGTGAATGTAATTCTATCCGTGATGTT GTTTTCTTCCCCCAGTTACGTGAACATAAATAG Protein sequence : MSDRLNDQAQHRLQKLLRLKQTNNDPYLVTKTSLTHSSKSFQVEFEKCAEEELKKKTTVSLAGRIIAIRQTFLIIQDFDG QVQLYINKKIHPKLFDYFNEFVDIGDQIVVSGKPMLTKTKVLTLAVEEMKIIAKCLLVPPEKWHGLTDIETRARKRFLDL TYNLAMRDVFLKRTKIIKSIRSFLDQNGFIEVETPTLQAVLGGANAKPFKTHYNALKADFYLRIANEIALKKLIIGGFNK VYEMGKMFRNEGVDTTHNPEFTSIEIYQAYADFEVMLVLVEKMIQSLCESLNQFSFNWNNKTINLKTPFHKITMVELIKK VTGIDFNSVKDDQSAILLAEKHHVKLAKHQQNKQHIINLFFEQFCEQTLIEPTFVTHYPKAVSPLAKQDPSNPEFTQRFE LFINGKEIANAYSELNDPLEQRKRFEQQLEEKQLGNDETSELDESFLEALSFGMVNTAGLGIGIDRLVMLLCECNSIRDV VFFPQLREHK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | CAD66193.1 | putative lysil-tRNA synthetase LysU | Not tested | PAI III 536 | Protein | 1e-80 | 41 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| lysS | YP_006601152.1 | lysyl-tRNA ligase | VFG1668 | Protein | 6e-81 | 41 |
