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Name : lysS (CM1_00770) Accession : YP_006600652.1 Strain : Mycoplasma genitalium M6320 Genome accession: NC_018497 Putative virulence/resistance : Virulence Product : lysyl-tRNA ligase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 6.1.1.6 Position : 160930 - 162444 bp Length : 1515 bp Strand : + Note : COG1190 Lysyl-tRNA synthetase (class II) DNA sequence : TTGCTTAAAATTAAGATAAATAATTTTCCAATTTTGTTTTCAATGAGTGATCGTTTAAATGATCAAGCCCAACATCGCTT GCAGAAACTTTTAAGGTTAAAACAAACTAATAATGACCCTTATTTAGTAACAAAAACTAGTCTAACCCATTCTTCAAAAA GCTTTCAAGTTGAATTTGAAAAATGTTCAGAAGAAGAGTTGAAGAAAAAAGCAACTGTCTCACTAGCTGGAAGGATCATT GCTATTAGACAAACCTTTTTAATTATTCAAGATTTTGATGGTCAAGTCCAACTTTACATCAATAAAAAAATCCATCCTAA GTTATTTGATTACTTTAATGAATTTGTTGATATTGGTGATCAAATTGTTGTTAGTGGTAAGCCAATGTTAACTAAAACAA AGGTATTAACTTTAGCTGTTGAAGAGATGAAAATCATTGCTAAGTGTTTATTGGTTCCACCTGAAAAGTGACATGGACTT ACTGATATTGAAACCCGCGCTCGCAAGCGCTTTCTTGATCTTACCTATAACTTAGCAATGCGTGATGTTTTTCTGAAACG CACTAAGATTATTAAATCAATCCGTAGCTTTCTTGATCAAAATGGTTTTATTGAAGTTGAAACCCCCACTTTACAAGCTG TTTTAGGAGGAGCTAATGCTAAACCCTTTAAAACCCATTACAATGCTTTAAAAGCGGATTTTTATCTCAGAATTGCTAAT GAAATAGCATTAAAAAAACTCATTATTGGTGGATTTAACAAGGTTTATGAAATGGGTAAAATGTTCCGTAATGAAGGGGT TGATACTACCCACAATCCTGAGTTTACCAGTATTGAAATATATCAAGCTTATGCAGATTTTGAAGTCATGCTTGTGCTTG TTGAAAAGCTGATTCAATCACTTTGTGAAAGCTTAAACCAATTTAGCTTTAACTGAAATAACAAAACGATTAATCTAAAA ACACCATTTCATAAGATAACAATGGTTGAACTTATTAAGAAAGTTACAGGGATCGATTTTAATTCAGTAAAAGATGATCA ATCTGCCATTTTATTAGCAGAAAAACATCATGTTAAACTAGCAAAACACCAACAAAATAAGCAACACATCATTAATTTGT TTTTTGAACAGTTTTGTGAACAAACATTAATTGAACCTACCTTTGTAACCCATTATCCAAAAGCAGTTTCTCCTTTAGCA AAACAAGATCCTTCAAATCCTGAATTCACCCAACGATTTGAACTTTTTATTAATGGTAAAGAGATTGCTAATGCTTACAG TGAGCTAAACGATCCTTTAGAACAAAGAAAAAGGTTTGAACAACAACTTGAAGAAAAACAGCTTGGTAATGATGAGACAA GTGAACTTGATGAATCGTTTTTAGAAGCATTAAGTTTTGGGATGGTAAACACTGCTGGGCTTGGGATAGGTATTGATCGT TTGGTAATGTTGTTATGTGAATGTAATTCTATCCGTGATGTTGTTTTCTTCCCCCAGTTGCGTGAACATAAATAG Protein sequence : MLKIKINNFPILFSMSDRLNDQAQHRLQKLLRLKQTNNDPYLVTKTSLTHSSKSFQVEFEKCSEEELKKKATVSLAGRII AIRQTFLIIQDFDGQVQLYINKKIHPKLFDYFNEFVDIGDQIVVSGKPMLTKTKVLTLAVEEMKIIAKCLLVPPEKWHGL TDIETRARKRFLDLTYNLAMRDVFLKRTKIIKSIRSFLDQNGFIEVETPTLQAVLGGANAKPFKTHYNALKADFYLRIAN EIALKKLIIGGFNKVYEMGKMFRNEGVDTTHNPEFTSIEIYQAYADFEVMLVLVEKLIQSLCESLNQFSFNWNNKTINLK TPFHKITMVELIKKVTGIDFNSVKDDQSAILLAEKHHVKLAKHQQNKQHIINLFFEQFCEQTLIEPTFVTHYPKAVSPLA KQDPSNPEFTQRFELFINGKEIANAYSELNDPLEQRKRFEQQLEEKQLGNDETSELDESFLEALSFGMVNTAGLGIGIDR LVMLLCECNSIRDVVFFPQLREHK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | CAD66193.1 | putative lysil-tRNA synthetase LysU | Not tested | PAI III 536 | Protein | 5e-81 | 41 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| lysS | YP_006600652.1 | lysyl-tRNA ligase | VFG1668 | Protein | 3e-81 | 41 |
