Gene Information

Name : Desde_2836 (Desde_2836)
Accession : YP_006430933.1
Strain : Desulfitobacterium dehalogenans ATCC 51507
Genome accession: NC_018017
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : L-lactate transport
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 2850009 - 2851739 bp
Length : 1731 bp
Strand : -
Note : PFAM: L-lactate permease; TIGRFAM: L-lactate transport

DNA sequence :
ATGGCGGAGTATTTTCAAAATTATAACCCCACGGGTAATGTGTGGCTATCGACGTTCTTAGCAGCGCTGCCTATTATTGT
ATTACTCTATTTGCTCGCTTTACATCCGCACAAGGATAAACAAGGTAATAAGCAGCTTGGAATCTTTGCTCCCTATGCAG
CTATTACTGCGGCCATAGTAGCTATTTTAGTGGCTATCTTTATGATGAAGATGCCTGTTCCAACCACTTTAGCTGCCTTT
GGTTATGGTGCGTTAAGTGGCCTGTTCCCAATCGGATGGATTATCTTTGCTGCTATTTTCCTTTATAATACTACTTTAAT
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TCAGCTTTGGTGCTTTCATTGAAGGTGCTTCCGGTTTCGGTACTCCGGTTGCTGTGTCCGGTGCTATCATGGTGGGCTTG
GGCTTCCGTCCGATGACAGCTGCGGTAATCTGCTTGATCGCTAATACTGCTCCTGTTGCTTGGGGAGCTATCGGTACACC
AATTCTTACCTTGGGTCAAGTTACAGGAATTCCAGCTGAGCTGATCAGTATGCAAGCTGGACGTCAACTTCCTTTCTTCT
CCGTTATCGTTCCTTTCTGGCTCGTTGCTACCCTCGTCTTCATGGATAAAGGATCCTGGAAAGATGTCTGGGAAGTATGG
CCCGCAACCTTAGTTTCCGGCCTTTCCTTCGCTATCACCCAGTTCGCTATGTCCCAAGCTGGAAACGTTATGCTTGTCGA
TATCGGTTCCGGTATCGTAAGTATGGTTGTAACCGCACTCTTCTTAAAAGTATGGTCTCCCAAGAATATCATGGGTCACG
AAGATGCCCATGAGAACAAAGGTGCTGCTACCCAGCTGAATAAGAAGAAGCTGGAGGTTCCCAAGCACAGCATGAAGGAA
CTCATCACCGCTTGGATGCCTTGGGCTTTCCTTGCTATCGCAGTATTCTTCTGGGGTATGGGTGATGTTAAGACCTTCTT
GAATGGGATCTTTAATCCAAAATTCCCTGTGCCTTTCCTTGATGGAATGGTTCACCATACCGCACCGGTCGGTTCACCTG
ATACACCGATGGCTGCAGTCTACAGCTGGAATATCCTAACCATGGCTGGTACAGGAATTATGTTGGCTGCAATTCTTTCC
AATATTTTTGTCCTGAGACTCTCTGCAGCTCAATGGGCTCAAGCCTTCAATATGACAGCTAAACGGATGGTTGTTCCCAT
CACCGTTATCTGCTCCGTATTAGGATTAGGTTACCTGACACGTTATGCAGGAACCGATGCTATCCTCGGTTTGGCCTTCA
CTAAGACAGGATCAGCCTATCCCTTCTTTGCTTCCATGCTCGGTTGGCTAGGGGTGTTCCTGACGGGTAGTGATACATCC
TCCAACGCTATGTTCGGTGGACTCCAAAAAATTACTGCTGAACAGCTTGGCTTGAACCCTGTCCTCATCGTTACCGCAAA
CAGTACCGGTGGTGTTATGGGTAAAATGATCGATGCTCAAAGTATCGTGGTTGCTACCGTTGCTTGCTATGAGAACCATC
AAGAAGGTATGGCTGCCGTTGGACCAATCTTCCGTGCAGTTATCTGGCATAGTATTGCACTAGCCGTTCTGCTCAGCGGA
CTGGTCTGGGCTCAAGCGTATATCTTCCCATGGATGCAGGTTACTATGTAA

Protein sequence :
MAEYFQNYNPTGNVWLSTFLAALPIIVLLYLLALHPHKDKQGNKQLGIFAPYAAITAAIVAILVAIFMMKMPVPTTLAAF
GYGALSGLFPIGWIIFAAIFLYNTTLITGKFEILKNSVASLSPDRRLQALLIAFSFGAFIEGASGFGTPVAVSGAIMVGL
GFRPMTAAVICLIANTAPVAWGAIGTPILTLGQVTGIPAELISMQAGRQLPFFSVIVPFWLVATLVFMDKGSWKDVWEVW
PATLVSGLSFAITQFAMSQAGNVMLVDIGSGIVSMVVTALFLKVWSPKNIMGHEDAHENKGAATQLNKKKLEVPKHSMKE
LITAWMPWAFLAIAVFFWGMGDVKTFLNGIFNPKFPVPFLDGMVHHTAPVGSPDTPMAAVYSWNILTMAGTGIMLAAILS
NIFVLRLSAAQWAQAFNMTAKRMVVPITVICSVLGLGYLTRYAGTDAILGLAFTKTGSAYPFFASMLGWLGVFLTGSDTS
SNAMFGGLQKITAEQLGLNPVLIVTANSTGGVMGKMIDAQSIVVATVACYENHQEGMAAVGPIFRAVIWHSIALAVLLSG
LVWAQAYIFPWMQVTM

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
glcA CAE85240.1 GlcA protein, putative glycolate permease Not tested PAI V 536 Protein 2e-87 47