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Name : LLNZ_01560 (LLNZ_01560) Accession : YP_006355738.1 Strain : Lactococcus lactis NZ9000 Genome accession: NC_017949 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transcription accessory protein TEX Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 286158 - 288299 bp Length : 2142 bp Strand : + Note : COG2183 Transcriptional accessory protein DNA sequence : GTGGAAAATGTTAAAAAAATTGCTGAATTATTGAATATCAAAAATTCACAAGTTGAAAAAGTATTAGAATTGACGGCTGA GGGGAACACGGTTCCTTTTATTGCTCGTTATCGTAAGGAAGCAACAGGTTCACTTGACGAAGTTGAAATCAAAAAAATTA TTGATGAAGATAATTTACTGACCAAACTTTCAGAACGTAAAACGGCTGTTTTGTCAAAAATTGAGGAGCTTGGCAAGTTA ACTGACAGTTTGAGATCACAAATTTTATCGGCCGAAAAACTAACAGAAGTCGAAGATTTGTATTTGCCTTACAAAGAAAA ACGGCGCACCAAAGCAACGATTGCTAAGGAAAATGGTCTTTTTCCATTGGCACAATTAATTGTAAAAAATTCAGCGAATC TTGAAGAAGAAGCTGAAAAATTTGTCAATGAGAATTTTACAAGTCCTCAAAAAGCTTTAGAAGGTGCCGTGGATATCTTG TCAGAAGCGATTTCTGAAGATGCGCGGTTGCGTTCATGGCTGACTGGTGAAATCAAAAACAATAGTTTACTGACAAGTAG TTTGAAAAAAGATGCCGTTGATGAAAAGCAAGTTTTTCAAATGTATTATGAATTCTCAGAAAAAGTTTCAGAATTACCAA ATTATCGTGTATTGGCTTTAAACCGTGGTGAAAAATTGGGGATTCTGTCAGTAAAATTTGAAAATAACGAAGACAAAATT TTACGTTATTTTGCCGCCCGTTTTGCTGCTCAAAATAATTTAATGATGCAAGTGGCCATTAAAGATGCCGTCAAGAAAAA ATTGATTCCGGCTATGGAACGAAGTATTCGAGGCGAGCTGACAGAAAAAGCTGAAGCATCTGCTATTGAAGTTTTTGGCG AAAATTTGAAAAATCTTTTATTGGTTGCACCGCTTAAAGGCCGTGTAGTCATGGGATTTGACCCTGCTTACCGTACTGGA GCAAAGCTTGCTATTGTTGATGAGACAGGTAAATTATTGATGACAACTGTCATTTATCCTGTCAAACCAGCAAATGCAGG ACAAATTGCTCAAGCGAAAAAAAATTTAGCAAAATTTATTCGTGAATATGGTGTAAATATGATTGCCATTGGGAATGGAA CTGCCAGCCGCGAATCTGAAAGTTTTGTTTCTGAAGTCCTCAAAGAAAATAATTTTTCTGATGTTTATTATGTGATTGTC AGTGAATCTGGAGCCTCTGTTTATTCAGCAAGTGAATTGGCACGTGAAGAATTCCCAGAATTGACTGTTGAAAAGCGGTC AGCAATTTCGATTGCACGCCGTTTGCAAGATCCATTGGCTGAACTTGTAAAAATTGAACCAAAAGCCATCGGTGTGGGTC AATATCAACATGATGTTTCTGAGAAAAAATTGACAGAAAATCTAGATTTTGTTGTTGAAACAGTCGTTAACCAAGTTGGT GTTAATGTCAATACAGCCAGTCCTAGTTTGCTTTCACACGTTGCGGGCCTTAATAAAAGTTTGGCACAGAATGTAGTAAA ATATCGTGAAGAAAATGGCGCACTCAAAACAAGAGCGGAACTAAAAAAAGTCCCACGTTTGGGAGCTAAAGCATTTGAAC AAGCGGCAGGTTTCTTAAGAATTCCAGAAGGTAAAAATTTCCTTGACAATACCGGTGTTCACCCAGAATCTTATAAAGTG ACGGAACAACTTTTGGCTGAAATTGCTGCTGGACCTGCTGTCAGTAATGAAGAATTACTGACCAAACTTTCGTCAGTAAA TATTCCTGAAATGGCTGAAAAACTTGGTCTTGGTCAGGAAACATTGACCGATATTATTAATGATTTGAAAAAACCTGGTC GTGATTTACGTGATAGCTTTGATGCACCGATTCTTCGTCAAGATGTCTTGTCTGCTGGAGATTTACAAATTGGTCAGCAA CTTGAAGGTGTGGTCCGTAATGTTGTTGATTTTGGTGCCTTTATTGATATCGGAATTAAAAATGACGGCTTGGCACACGT TTCTGATTTGAGCAAATCATTTGTCAAAAATCCAAGTGATGTGGTCGCTGTTGGACAAATTGTAACGGTTTGGGTCAAAT CTCTTGATTTACAAAGAGGAAAAATTAATTTGACCCTAGTGAATCCTCGCGAAGAAGATTAA Protein sequence : MENVKKIAELLNIKNSQVEKVLELTAEGNTVPFIARYRKEATGSLDEVEIKKIIDEDNLLTKLSERKTAVLSKIEELGKL TDSLRSQILSAEKLTEVEDLYLPYKEKRRTKATIAKENGLFPLAQLIVKNSANLEEEAEKFVNENFTSPQKALEGAVDIL SEAISEDARLRSWLTGEIKNNSLLTSSLKKDAVDEKQVFQMYYEFSEKVSELPNYRVLALNRGEKLGILSVKFENNEDKI LRYFAARFAAQNNLMMQVAIKDAVKKKLIPAMERSIRGELTEKAEASAIEVFGENLKNLLLVAPLKGRVVMGFDPAYRTG AKLAIVDETGKLLMTTVIYPVKPANAGQIAQAKKNLAKFIREYGVNMIAIGNGTASRESESFVSEVLKENNFSDVYYVIV SESGASVYSASELAREEFPELTVEKRSAISIARRLQDPLAELVKIEPKAIGVGQYQHDVSEKKLTENLDFVVETVVNQVG VNVNTASPSLLSHVAGLNKSLAQNVVKYREENGALKTRAELKKVPRLGAKAFEQAAGFLRIPEGKNFLDNTGVHPESYKV TEQLLAEIAAGPAVSNEELLTKLSSVNIPEMAEKLGLGQETLTDIINDLKKPGRDLRDSFDAPILRQDVLSAGDLQIGQQ LEGVVRNVVDFGAFIDIGIKNDGLAHVSDLSKSFVKNPSDVVAVGQIVTVWVKSLDLQRGKINLTLVNPREED |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| NMB0075 | NP_273139.1 | transcriptional accessory protein Tex | Not tested | IHT-A | Protein | 1e-138 | 46 |
