Gene Information

Name : virD4-1 (MWE_p10)
Accession : YP_006331085.1
Strain :
Genome accession: NC_017919
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : VirD4 coupling protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 8192 - 9919 bp
Length : 1728 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGAGAGAAAAATTCAAAACATTAAGAGATAAATTTAAGGATAAAACCAGTAATTTATTCCATAAGCTTAATAGCATTCA
AAAAGATTATTACACTAAAACTTTCCCTAAGGCTTGCAAAGATGTCTTTACGCTAGGTTCTTCTAAAAGTTATCCTATAA
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CTCTTGTGTGGTGTTAGATATTAAAGGAGAGTTGTTTGATTTAACGGCTGGTTACAGACAACAAGTTCTAAAAAATAAAA
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TTGCAAGCGCTCCTATAAAAAATTATGTCCCCTTAATCAATCCACAAAGCCGATTTTATACTGAATTATATGAATGTCAA
AGCGCAGATAATGGTTTTGTTAAAGAGAATGGGCGTTATATGGCTAAAGTAGAAAATGGCGTTAAAAAAATGAAACCTAA
TGTCAATGTGGAATTGCTATGGTATAAACAAGTAGCCGAACAAGTCTATACTGACCCAGAAAATCCTAAAAATTATGATG
GATCTGTGAATAATTTAGAAAAAGACGATCAAGGCAATATTATAATGAAAGAGGGCATGTTAGATCCTATTATTAGAAAC
GAAGCGAACAAATGGGCTAAGGCGAATGACAAAGAGTTTGCGAGCATTAAATCAGTTTATAGCCGTTTTATGCAAGTCTT
TACAAGCTATCAAGTTAAAAGCGCTACAGATAGCATGAGTTTTGAATACGAGGATTTAAGGGCTGACAATATTTCACTCT
ATATTAAAATCGCTCAAACAGATATTGACACACTCGCACCGCTTATCCGTATCCTTTTGGAAAGTATTGCTAAAAATCTT
TTATTGAAAGAGAGTAAGAAATTTGAAGAAAGAGTTTATCTGTTTTTAGATGAATTTGTGCGTTTTGGTAAATTGCCTTT
TTTATTAGAAATGCCAGCATTAAGTAGGAGCTATGGTGTGGTTTTAATTTTTATCACGCAATCCAACGCTCTTATTGAAA
AATATTATGGTAGAGAAGATGCAAGAATTGTTAATAGCACCGTGGCTTACAAAATAATTTTCAAAATGGATGATTTAGAA
TATGCTAAACAGGTGAGCGAAGAAGTCGGTAAGATGACTAGAAAAACACGAAGCCACTCTACAGAAAAAGGACAACTCAT
TACCGGAGGGACTTCTAGTATAGGTAAAGAGGCGTGGGATTTATTGAGCGCGCAAGATATTATGAATATTGATAAAGATG
AAGTGATCGTTTTAGTAAGCGGTCATAAGGCTAAACCCTTAAAATTAAAAGCGAATTATTATTTCAAAAACAAAGAATTA
CTCTCTCGTATTAACTGGGAAGTCAAGCCCAATGAAGAAGTGTTTTGA

Protein sequence :
MREKFKTLRDKFKDKTSNLFHKLNSIQKDYYTKTFPKACKDVFTLGSSKSYPITLNFNKGFCVGLYKGLNSLKPTYYDAP
LSTLIIAPPGSGKTAAVAVPNLLSVPSSCVVLDIKGELFDLTAGYRQQVLKNKIFVFDPLGNDNTLKFNPFDKRIVEKLD
FNRKRRLVDEVGNTIFAEDGANKDPHWTQQAKNLFVFYALYDLCVHNTSTFFEIASAPIKNYVPLINPQSRFYTELYECQ
SADNGFVKENGRYMAKVENGVKKMKPNVNVELLWYKQVAEQVYTDPENPKNYDGSVNNLEKDDQGNIIMKEGMLDPIIRN
EANKWAKANDKEFASIKSVYSRFMQVFTSYQVKSATDSMSFEYEDLRADNISLYIKIAQTDIDTLAPLIRILLESIAKNL
LLKESKKFEERVYLFLDEFVRFGKLPFLLEMPALSRSYGVVLIFITQSNALIEKYYGREDARIVNSTVAYKIIFKMDDLE
YAKQVSEEVGKMTRKTRSHSTEKGQLITGGTSSIGKEAWDLLSAQDIMNIDKDEVIVLVSGHKAKPLKLKANYYFKNKEL
LSRINWEVKPNEEVF

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
virD4-1 YP_002301090.1 VirD4 coupling protein Virulence cag PAI Protein 0.0 99