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Name : tcrB (Spaf_0448) Accession : YP_006309272.1 Strain : Streptococcus parasanguinis FW213 Genome accession: NC_017905 Putative virulence/resistance : Resistance Product : TrcB Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 466220 - 468334 bp Length : 2115 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAATAATGACAACATGGATAAGTTAAAACACGAGCATGGAATCACAGATGAACATGGATACCATAAGGATCAACATCA AGTACATCATGCTGGGCATGATCACTGCGGGCACAGTGGGCATGACCACAGCGGGCACAGTGGACATGATCACAGCGGAC ACAGTGGGCATGCCCACCATCATCACGGAAGCTTTAAGGAACTTTTCTTAAAGTCATTGCCACTAGGAATCATTATTATG CTCTTAGTCCCTTTGCATGGATTTGAACTACCATTCCAGTTTACTTTTCCATATTCTGATATTGTAGTATCTATTTTATC TACTATATTAATTATTTATGGTGGACGTCCATTCTATCAAGGTGCAGTTGACGAATTTAAACAAAAAGAACCTGGAATGA TGGCACTCGTTTCTTTAGGTTTAAGTGTTTCATATTTATACAGTATTTATGCTGTGATCATTACCTACGTAACGGGCGAA CACGTGATGGACTTTTTCTTTGAATTTGCTTCATTACTATTAATCATGCTATTAGGTCACTGGATTGAGATGAAAGCTAT TGGAGAAGCAGGAGACGCACAAGCAGAATTGGCTAAGTTAGTGCCGAAAGATGCTCACGTTGTATTAGAAGACGATTCAA TTGAAACACGACCAGTTGCTGACTTACAGGTAGGTGATTTAATTCGTGTTCAAGCCGGAGAAAATGTGCCAGCAGACGGG ATTATCGAGCGTGGCGAATCACGTTTAAATGAAGCTCTTTTGACTGGAGAATCAAAAGCAGTTAAAAAAGGCCCTGGCGA TGAAGTAATCGGGGGCTCAACAAATGGAGAAGGGGTTCTTTATATTAAAGTGAATGAGACAGGTGATCAATCCTTCATCT CTCAAGTTCAGAATTTAATCAGCCAAGCTCAAAGTCAGCCTTCCAGAGCAGAAAATATTGCTCAAAAGGTTGCAGGGTGG CTCTTCTATATTGCTGTTATTGTCGCGCTAATTGCTTTTGTAGTGTGGATGATTATTGGAGATATCCCAACGGCAGTTAT ATTTACTATTACTACATTAGTTATTGCTTGTCCGCACGCATTGGGTCTGGCTATTCCATTGGTAACCGCCCGTAGCACAA GCTTAGGAGCTAGCCGTGGCTTACTAGTAAAAGACCGCCAAGCCTTAGAAATAGCTCAAGATGCAGATGTGATTATTTTA GATAAAACGGGTACTTTAACAACTGGTGAATTTAAAGTATTAGATGTAAAACTTCTTAATGACAAATATACAAAAGAGGA AATCATTGCCTTATTGGCAGGTATTGAAGGAGGATCTAGCCACCCAATTGCTCAATCAATTATAAGTTTCGCCGAGCAGC AAGATATACGTCCAGCATCTTTTGATTCGATTGATGTGATTTCCGGTGCTGGAGTAGAGGGTAAAGCAGGTGAGCACCGT TACCAATTAATCAGTCAAAAAGCCTATGGACGTAATCTTGATATGGATATTCCAAAAGGAGCAACTCTTAGTGTCTTAGT AGAAAACGATGATGCCATTGGTGCTGTAGCTTTAGGGGACGAATTAAAACCAACGAGTAAAGAGTTAATTAAAGCTCTTA AAAAGAACAATATTCAACCAATTATGGCAACAGGTGATAATGAAAAAGCGGCTCAAGGCGCAGCAGAAGTTTTAGGGATT GAATATAGATCAAATCAATCTCCACAAGACAAATATGAGTTGGTTAAAACACTTAAAGATGAAGGAAAGAAAGTTATCAT GGTAGGTGATGGTGTAAATGATGCTCCTTCACTTGCCTTAGCAGATCTTGGTATAGCTATAGGTGCTGGAACTCAAGTTG CATTGGATTCAGCTGATGTCATATTGACTCAATCCGATCCAGGAGATATTGAATCATTCATTGAATTAGCACACAAAACA ACTCGTAAAATGAAACAAAACCTATTTTGGGGAGCTGGTTATAACTTTATAGCTATCCCTCTAGCTGCAGGAATTTTGGC TCCTATTGGTATCACATTAAGCCCTGCATTAGGAGCAATCCTAATGTCTGTGTCAACAGTCATCGTCGCCATTAATGCGA TGTTATTAAGTTTATATCCAAAAAATAACGGTTAA Protein sequence : MNNDNMDKLKHEHGITDEHGYHKDQHQVHHAGHDHCGHSGHDHSGHSGHDHSGHSGHAHHHHGSFKELFLKSLPLGIIIM LLVPLHGFELPFQFTFPYSDIVVSILSTILIIYGGRPFYQGAVDEFKQKEPGMMALVSLGLSVSYLYSIYAVIITYVTGE HVMDFFFEFASLLLIMLLGHWIEMKAIGEAGDAQAELAKLVPKDAHVVLEDDSIETRPVADLQVGDLIRVQAGENVPADG IIERGESRLNEALLTGESKAVKKGPGDEVIGGSTNGEGVLYIKVNETGDQSFISQVQNLISQAQSQPSRAENIAQKVAGW LFYIAVIVALIAFVVWMIIGDIPTAVIFTITTLVIACPHALGLAIPLVTARSTSLGASRGLLVKDRQALEIAQDADVIIL DKTGTLTTGEFKVLDVKLLNDKYTKEEIIALLAGIEGGSSHPIAQSIISFAEQQDIRPASFDSIDVISGAGVEGKAGEHR YQLISQKAYGRNLDMDIPKGATLSVLVENDDAIGAVALGDELKPTSKELIKALKKNNIQPIMATGDNEKAAQGAAEVLGI EYRSNQSPQDKYELVKTLKDEGKKVIMVGDGVNDAPSLALADLGIAIGAGTQVALDSADVILTQSDPGDIESFIELAHKT TRKMKQNLFWGAGYNFIAIPLAAGILAPIGITLSPALGAILMSVSTVIVAINAMLLSLYPKNNG |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SH0105 | YP_252020.1 | hypothetical protein | Not tested | SCCmec | Protein | 1e-89 | 47 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| tcrB | YP_006309272.1 | TrcB | BAC0383 | Protein | 0.0 | 83 |
| tcrB | YP_006309272.1 | TrcB | BAC0079 | Protein | 1e-118 | 50 |
| tcrB | YP_006309272.1 | TrcB | BAC0629 | Protein | 2e-88 | 45 |
