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Name : ABTJ_03504 (ABTJ_03504) Accession : YP_006291357.1 Strain : Acinetobacter baumannii MDR-TJ Genome accession: NC_017847 Putative virulence/resistance : Unknown Product : general secretion pathway protein D Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 3619508 - 3621784 bp Length : 2277 bp Strand : - Note : PFAM: Bacterial type II/III secretion system short domain; Bacterial type II and III secretion system protein; TIGRFAM: general secretion pathway protein D DNA sequence : ATGGCTTTATTGAATCATCAACGTCCACTTTGGGCATTACTTGCAGCAGCCCCATTGATTGCGACAGTAAGTAGCAGTGC CTATGCCCAAACATGGAAGATCAATTTACGTGATGCTGACTTAACTGCCTTTATTAATGAAGTTGCAGACATTACAGGAA AGAACTTCGCTGTAGATCCGAGAGTACGTGGTAATGTCACGGTTATTTCTAATAAGCCATTAAATAAAGATGAAGTTTAT GACCTATTTCTTGGGGTCTTAAATGTAAACGGGGTGGTTGCAATTCCTTCTGGTAATACCATTAAGCTTGTACCGGATAG CAATGTTAAAAACTCGGGAATTCCTTATGATTCTAGAAATAGGGTCCGTGGTGATCAAATCGTTACACGTGTGATTTGGC TGGAAAATACTAATCCAAATGACTTAATTCCAGCACTCCGTCCCTTAATGCCACAATTTGCACATATGGCGGCAATTGCA GGAACCAATGCACTTATTGTTTCTGATAGAGCTGCGAATATTTATCAACTTGAAAATATTATTCGTAACTTGGATGGAAC TGGGCAAAATGATATTGAAGCGATCACGCTTCAGTCGAGCCAAGCAGAAGAAATTATTACCCAGCTTGAAGCGATGAGCG CAACAGGCGCATCTAAAGATTTTAGTGGTGCCCGTATTCGTATTATTGCTGATAATCGGACAAACCGTATTTTAATAAAA GGTGATCCGCAAACACGTAAACGTATTCGTCATATGATTGAGATGCTGGATGTACCTTCGGCAGATCGTTTAGGTGGCTT AAAAGTTTTCCGTTTGAAGTATGCCAGTGCTAAAAACTTGTCTGAAATTTTGCAAGGCTTAGTCACAGGACAGGCAGTAT CTTCATCGAATAATAGTAATAATTCATCTAACTCATCGAATCCGATTAATAGTTTAATTGGTAATAACCAGAATTCTGGT TCAAATACATCGGGTTCAAATGGTGCCTCAATTTCAACTCCTGCAATTAACCTAAACGGTAATTCGAACAGTAGTAATCA GAATAATATCACCAGCTTTAATCAAAACGGTGTGAGTATTATTGCAGATAATGCTCAGAACTCATTAGTAGTTAAAGCTG ATCCCCAATTAATGCGTGAAATTGAATCAGCGATTCAACAACTAGATGTTCGTCGTCAACAAGTGCTTATTGAGGCCGCA ATTATTGAAGTCTCTGGAGATGATGCAGATCAACTTGGAATTCAATGGGCACTCGGTGATTTATCTAGTGGGATTGGTTT ACTTAGCTTTAGTAATGTAGGGGCGAGTTTATCTTCTATCGCTGCTGGTTATTTATCGGGTGGTTCGGCTGGAGCTGCAT CTGCTATCGCTAATGGAGCTAATAAAGGTAATGGTGCAACTTTAGGATTGGGCAATTTTGATAATTCTCGTAAGGCATAT GGTGCACTAATTCAGGCTCTCAAAACCAATACTAAATCAAACTTACTTTCGACACCGTCCATTGTGACGATGGATAATGA AGAAGCTTATATTGTTGTAGGTCAGAACGTTCCATTTGTCACAGGGTCGGTTACTACCAATAGTACAGGTATCAATCCCT ATACAACTGTTGAGCGTAAAGATGTCGGTGTGACCTTGAAAGTTGTTCCACATATCGGTGAAGGGGGTACTGTTCGTTTA GAAGTAGAGCAAGAAGTTTCTGCTGTTCAAGATAGCCGTGGGCAAGCAGCTGACTTGGTGACAAGTAAACGCGCTATTAA AACAGCTGTTTTAGCCGAGCATGGGCAGACTGTGGTGCTAGGTGGTTTGGTGTCGGATGACACTTCGCTTTCAAGACAAG GTATACCTGGTTTAAGTAGTATTCCTTATGTTGGGCGATTGTTCCGATCAGATAACAGAAGCAATGTAAAACGTAACCTT CTCGTTTTTATTCACCCAACAATTGTGGGCGATGCAAATGATGTACGCCGTTTATCTCAGCAGCGCTATAATCAACTTTA TAGCTTGCAATTGGCTATGGATAAAAATGGCAACTTTGCAAAATTACCTGAGCAAGTTGATGATATTTATAACCAAAAAA TGACCCCGCCGAGTATTGCCTCCAAGCCAAAAAATTACCAACAGGTTCCATCAGGTGGTAAAAGTTCGACCATAACTACG CCGGTAGCTGTAGAACCTACCGTCCAAAAGCAAACCCTACAGTTGCCTGATCCTGAAATTAATCGTACTAAAAATACAGT AACAACAACGACACTGCGTCCAAGCACAGCGCCGTAG Protein sequence : MALLNHQRPLWALLAAAPLIATVSSSAYAQTWKINLRDADLTAFINEVADITGKNFAVDPRVRGNVTVISNKPLNKDEVY DLFLGVLNVNGVVAIPSGNTIKLVPDSNVKNSGIPYDSRNRVRGDQIVTRVIWLENTNPNDLIPALRPLMPQFAHMAAIA GTNALIVSDRAANIYQLENIIRNLDGTGQNDIEAITLQSSQAEEIITQLEAMSATGASKDFSGARIRIIADNRTNRILIK GDPQTRKRIRHMIEMLDVPSADRLGGLKVFRLKYASAKNLSEILQGLVTGQAVSSSNNSNNSSNSSNPINSLIGNNQNSG SNTSGSNGASISTPAINLNGNSNSSNQNNITSFNQNGVSIIADNAQNSLVVKADPQLMREIESAIQQLDVRRQQVLIEAA IIEVSGDDADQLGIQWALGDLSSGIGLLSFSNVGASLSSIAAGYLSGGSAGAASAIANGANKGNGATLGLGNFDNSRKAY GALIQALKTNTKSNLLSTPSIVTMDNEEAYIVVGQNVPFVTGSVTTNSTGINPYTTVERKDVGVTLKVVPHIGEGGTVRL EVEQEVSAVQDSRGQAADLVTSKRAIKTAVLAEHGQTVVLGGLVSDDTSLSRQGIPGLSSIPYVGRLFRSDNRSNVKRNL LVFIHPTIVGDANDVRRLSQQRYNQLYSLQLAMDKNGNFAKLPEQVDDIYNQKMTPPSIASKPKNYQQVPSGGKSSTITT PVAVEPTVQKQTLQLPDPEINRTKNTVTTTTLRPSTAP |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
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| BJAB0868_00339 | YP_008211665.1 | Type II secretory pathway, component PulD | Not tested | AbaR26 | Protein | 0.0 | 100 |
