Gene Information

Name : ABTJ_01298 (ABTJ_01298)
Accession : YP_006289204.1
Strain : Acinetobacter baumannii MDR-TJ
Genome accession: NC_017847
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : sodium--glutamate symport carrier GltS
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 1348481 - 1349716 bp
Length : 1236 bp
Strand : +
Note : PFAM: Sodium/glutamate symporter; TIGRFAM: sodium--glutamate symport carrier (gltS)

DNA sequence :
ATGGAATTTGTTTTTAATGGTTTTTATACACTAATTTCGGCGGTCATCGTTCTATTGTTGGGTCGCTTTCTTGTCAATCG
GATTGATTTTTTAAAACGTTATAATATCCCTGAACCAGTAGCAGGTGGTTTGGTCGCTGCGGTAGTTTCTTTACTTGTCC
ACACTTTTTGGGGATACAGTATTGTTTTTAGCAGTGAATTACAAACCAGCTTTATGCTCGTGTTCTTTGCTTCAATTGGT
TTAAGTGCCAATTTTATGAAGCTTAAAGAGGGTGGTACTGCTTTAGTCATCTTCTTAATTTGTGTAGCCTCATTTATTGT
TGTTCAAAATGCTGTCGGTATGAGCCTTGCAACCTTATTGGGTCTAGACCCACTTATTGGTTTGATTGCAGGTTCAATTA
CATTAACCGGTGGTCATGGTACAGCAGGTGCGTGGGGTGAAATTTTAGAAAGCCAGCATGGTATTCAGGGTGCTTTAGCG
TTAGGTATGGCAAGTGCTACGTTTGGCTTGATTATTGGTGGTGTCATTGGTGGTCCTTTAGCCAAATTGCTCATTAATCG
TTATAGCCTTGCTCAAGCAAAAACCAATGCTGAGATTCAGCAGCGTGACACGCATGTTGAACAAAATTCAGATGATCTTG
CACCGTTTGAAAACCCGCATCAAGTTCGTTTAATTACTGCCGACAATGCAATTACTACGCTTGGTATGTTTGCAGCATGT
TTAGCATTTGCTGAATTTATGACTGGCTTCAGTAAGGGAACTTGGTTTGAGTTACCAACTTTCGTTTGGGCACTTGGTGG
CGGTGTAATCTTAAGAAATATTTTAGAAAGCGTGTTGAAGGTTGATATTTTTGACCGCGCGATTGACGTTTTTGGTAATG
CGTCTTTATCTCTTTATTTAGCAATGGCATTGCTTTCATTAAAGCTTTGGCAACTTGCTGACTTAGCAGGTCCACTTGTG
GTTATTTTAGGTGCTCAAACACTGACTATGGCTTTATATGCAGCATTTGTGACTTTCCGTGTAATGGGGAAAAATTACGA
TGCGGCAGTATTGGCAGCAGGTCACTGTGGTTTCGGTATGGGGGCTACACCAACCGCCGTTGCAAATATGCAGGCGATTA
CCAATATGTATGGCCCATCGCATAAAGCATTCTTAATTGTTCCGCTTTGTGGTGCATTCTTTGTCGACTTGATTAATGCA
ACTGTGATTCAGCTTATGTTGAAATTTATTGCTTAA

Protein sequence :
MEFVFNGFYTLISAVIVLLLGRFLVNRIDFLKRYNIPEPVAGGLVAAVVSLLVHTFWGYSIVFSSELQTSFMLVFFASIG
LSANFMKLKEGGTALVIFLICVASFIVVQNAVGMSLATLLGLDPLIGLIAGSITLTGGHGTAGAWGEILESQHGIQGALA
LGMASATFGLIIGGVIGGPLAKLLINRYSLAQAKTNAEIQQRDTHVEQNSDDLAPFENPHQVRLITADNAITTLGMFAAC
LAFAEFMTGFSKGTWFELPTFVWALGGGVILRNILESVLKVDIFDRAIDVFGNASLSLYLAMALLSLKLWQLADLAGPLV
VILGAQTLTMALYAAFVTFRVMGKNYDAAVLAAGHCGFGMGATPTAVANMQAITNMYGPSHKAFLIVPLCGAFFVDLINA
TVIQLMLKFIA

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
gltS NP_273147.1 sodium/glutamate symport carrier protein Not tested IHT-A Protein 3e-95 61
unnamed AEA34672.1 sodium/glutamate symport carrier protein Not tested Not named Protein 1e-76 50