Name : Solca_3471 (Solca_3471) Accession : YP_006257652.1 Strain : Solitalea canadensis DSM 3403 Genome accession: NC_017770 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ATP-dependent DNA helicase RecG Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 4086625 - 4088799 bp Length : 2175 bp Strand : - Note : PFAM: Helicase conserved C-terminal domain; DEAD/DEAH box helicase; TIGRFAM: ATP-dependent DNA helicase RecG DNA sequence : TTGGGAATATTTAAAGAGAATACTTCCCAAAATGGCGTAGGAAGTTTAACTATTTTAGCTTTAGTGGAAAGAAAAGGATT TTTTGATACACCTATTGAATTCTTGAAAGGCGTTGGGCCCTCAAAAGCAGATGTGCTCAAAAAAGAACTGAATATTTATA CTTATGGTGACCTCCTCAGGCATTACCCATTTCGTTATATTGATAGAACCAGGTTCTATAGAATTGGAGAAATAACGCCT GATCTTCAGTATATCCAGTTAAAAGGAATTATCGTCGACAAGCAATTAATTGGAGAGCAGCGTCGTAAGCGATTGGTTGC GACGTTGCAGGATGAAAGAGGCTCTCATCTCGAATTAGTATGGTTTCAAGGTATTAAATTTATAGAGAAACATATTCATA TAGGGAAGGAGTATATTGCTTTCGGGAAGCCTAACTTTTTTAATAATAAAGCGAATCTTCCTCATCCAGATCTGGAATTA GTTTCAGAAGCTAAAAAAGAATTTCAGACAGCTTTGCAACCCGTTTATTCGTCTACAGAAAAATTAAAGCTATTTTTCCT GGACACCAAAGGTATTATGCGTTTGGTGTATAATCTCTTGGAACAGGGTGCTAATTTTATAGACGAAGATTTGCCTGAAG CTCCTTTGGAACAATATAAATTAATGTCAAGAAGAGATGCATTAATTCAAATTCATTTTCCCAAAGACTCTAAGCTGTTA CAGCGTTCCCAAGCGCGCTTGAAATTTGAAGAACTATTCTTTATTCAGTTACGATTACTTTTTAATAAGCAAATCAAAAA ACGTCTACATAATGGTAGCTTATTTTCAGTAGTGGGTGATAATTTTAATGGTTTTTATACGAATCATTTACCTTTTGAAC TGACCGGTGCCCAAAAAAGAGTTATTAAGGAAATCAGGAGAGACACCAACTCTGGTATGCAAATGAACAGGCTGGTTCAG GGTGATGTTGGAAGCGGAAAGACGGTAGTGGCGTTAATGTCGATGTTATTGGCTATCGACAATGGATTTCAGGCTTGTAT GATGGCTCCAACAGAAATTCTTGCCACTCAGCATTTTCATTCCATTTCAATGATGCTGAAAGATATGCCTGTTAAGGTTG AGTTGTTAACCGGTTCTACTAAAAAGAAGCAACGTGAGAAGTTATTTGAAGAATTGGCAAACGGAGAACTTAAATTACTG GTAGGAACGCATGCATTAATTGAAGATAAAGTTCAGTTTCAAAACCTGGGGTTAGTTATTATTGATGAGCAGCATCGGTT TGGTGTAGAACAACGTGCAAAATTGTGGCAAAAAAATAGTAGCCCTCCACACATTTTGGTAATGACAGCTACTCCAATTC CCAGGACCCTAGCAATGACGTTATATGGAGATTTAGATGTATCTGTAATTGACGAGCTTCCTGCCGGTAGAAAGCCTATT CAAACCTTACATAAATTCGAAAATCACCGGTTGCGCCTGCATGGATTTTTGAAAGAAGAGATTGCCAAAGGGAGACAGGT GTATATTGTTTATCCTTTAATTGAGGAATCAGAAAAAATGGATTACCTCGATCTGATGAATGGCTATGAACACATCACTA AATCTTTTCCACAGCCTCAGTACCAGGTAAGTATTGTTCATGGTAAAATGAAAGCTGCTGAAAAGGATTTTGAGATGAAT CGTTTCAAAAATGGGGAAACTCATATTATGGTGGCTACAACAGTTATTGAAGTTGGGGTAAACGTTCCTAATGCTTCCGT AATGGTTATTGAAAATGCAGAGAAATTTGGATTATCTCAACTGCATCAATTGAGAGGACGTGTTGGGCGTGGAGCAGAAC AATCTTTTTGTATTTTGATGAGTAGTCATAAATTATCTTCTGAAGCTAAAGTTCGGTTAGATACCATGGAAAGGACTAAT GACGGTTTTGAGATTTCTGAGGTGGATTTAAAGTTACGCGGACCAGGAGATTTGGAAGGAACTCAGCAAAGTGGTGTGCT TGATTTAAGGTTAGCAGATCTGGCAAAAGATCAGCAAATTTTGATCGAAGCGCGTCGGTGTGTAGAACAGATATTGGAGG AGGATCCTATGTTAAATATGGAAAAAAATAAAACTCTTCGTATTTATTTTGAGAAAAAAAGTAAAAGGGAAATAACTTGG GATAAAATTTCGTAA Protein sequence : MGIFKENTSQNGVGSLTILALVERKGFFDTPIEFLKGVGPSKADVLKKELNIYTYGDLLRHYPFRYIDRTRFYRIGEITP DLQYIQLKGIIVDKQLIGEQRRKRLVATLQDERGSHLELVWFQGIKFIEKHIHIGKEYIAFGKPNFFNNKANLPHPDLEL VSEAKKEFQTALQPVYSSTEKLKLFFLDTKGIMRLVYNLLEQGANFIDEDLPEAPLEQYKLMSRRDALIQIHFPKDSKLL QRSQARLKFEELFFIQLRLLFNKQIKKRLHNGSLFSVVGDNFNGFYTNHLPFELTGAQKRVIKEIRRDTNSGMQMNRLVQ GDVGSGKTVVALMSMLLAIDNGFQACMMAPTEILATQHFHSISMMLKDMPVKVELLTGSTKKKQREKLFEELANGELKLL VGTHALIEDKVQFQNLGLVIIDEQHRFGVEQRAKLWQKNSSPPHILVMTATPIPRTLAMTLYGDLDVSVIDELPAGRKPI QTLHKFENHRLRLHGFLKEEIAKGRQVYIVYPLIEESEKMDYLDLMNGYEHITKSFPQPQYQVSIVHGKMKAAEKDFEMN RFKNGETHIMVATTVIEVGVNVPNASVMVIENAEKFGLSQLHQLRGRVGRGAEQSFCILMSSHKLSSEAKVRLDTMERTN DGFEISEVDLKLRGPGDLEGTQQSGVLDLRLADLAKDQQILIEARRCVEQILEEDPMLNMEKNKTLRIYFEKKSKREITW DKIS |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
recG | CAJ77039.1 | ATP-dependent DNA helicase | Not tested | AbaR1 | Protein | 3e-93 | 41 |