Gene Information

Name : Solca_3471 (Solca_3471)
Accession : YP_006257652.1
Strain : Solitalea canadensis DSM 3403
Genome accession: NC_017770
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : ATP-dependent DNA helicase RecG
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 4086625 - 4088799 bp
Length : 2175 bp
Strand : -
Note : PFAM: Helicase conserved C-terminal domain; DEAD/DEAH box helicase; TIGRFAM: ATP-dependent DNA helicase RecG

DNA sequence :
TTGGGAATATTTAAAGAGAATACTTCCCAAAATGGCGTAGGAAGTTTAACTATTTTAGCTTTAGTGGAAAGAAAAGGATT
TTTTGATACACCTATTGAATTCTTGAAAGGCGTTGGGCCCTCAAAAGCAGATGTGCTCAAAAAAGAACTGAATATTTATA
CTTATGGTGACCTCCTCAGGCATTACCCATTTCGTTATATTGATAGAACCAGGTTCTATAGAATTGGAGAAATAACGCCT
GATCTTCAGTATATCCAGTTAAAAGGAATTATCGTCGACAAGCAATTAATTGGAGAGCAGCGTCGTAAGCGATTGGTTGC
GACGTTGCAGGATGAAAGAGGCTCTCATCTCGAATTAGTATGGTTTCAAGGTATTAAATTTATAGAGAAACATATTCATA
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CTCCTTTGGAACAATATAAATTAATGTCAAGAAGAGATGCATTAATTCAAATTCATTTTCCCAAAGACTCTAAGCTGTTA
CAGCGTTCCCAAGCGCGCTTGAAATTTGAAGAACTATTCTTTATTCAGTTACGATTACTTTTTAATAAGCAAATCAAAAA
ACGTCTACATAATGGTAGCTTATTTTCAGTAGTGGGTGATAATTTTAATGGTTTTTATACGAATCATTTACCTTTTGAAC
TGACCGGTGCCCAAAAAAGAGTTATTAAGGAAATCAGGAGAGACACCAACTCTGGTATGCAAATGAACAGGCTGGTTCAG
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GATGGCTCCAACAGAAATTCTTGCCACTCAGCATTTTCATTCCATTTCAATGATGCTGAAAGATATGCCTGTTAAGGTTG
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GTAGGAACGCATGCATTAATTGAAGATAAAGTTCAGTTTCAAAACCTGGGGTTAGTTATTATTGATGAGCAGCATCGGTT
TGGTGTAGAACAACGTGCAAAATTGTGGCAAAAAAATAGTAGCCCTCCACACATTTTGGTAATGACAGCTACTCCAATTC
CCAGGACCCTAGCAATGACGTTATATGGAGATTTAGATGTATCTGTAATTGACGAGCTTCCTGCCGGTAGAAAGCCTATT
CAAACCTTACATAAATTCGAAAATCACCGGTTGCGCCTGCATGGATTTTTGAAAGAAGAGATTGCCAAAGGGAGACAGGT
GTATATTGTTTATCCTTTAATTGAGGAATCAGAAAAAATGGATTACCTCGATCTGATGAATGGCTATGAACACATCACTA
AATCTTTTCCACAGCCTCAGTACCAGGTAAGTATTGTTCATGGTAAAATGAAAGCTGCTGAAAAGGATTTTGAGATGAAT
CGTTTCAAAAATGGGGAAACTCATATTATGGTGGCTACAACAGTTATTGAAGTTGGGGTAAACGTTCCTAATGCTTCCGT
AATGGTTATTGAAAATGCAGAGAAATTTGGATTATCTCAACTGCATCAATTGAGAGGACGTGTTGGGCGTGGAGCAGAAC
AATCTTTTTGTATTTTGATGAGTAGTCATAAATTATCTTCTGAAGCTAAAGTTCGGTTAGATACCATGGAAAGGACTAAT
GACGGTTTTGAGATTTCTGAGGTGGATTTAAAGTTACGCGGACCAGGAGATTTGGAAGGAACTCAGCAAAGTGGTGTGCT
TGATTTAAGGTTAGCAGATCTGGCAAAAGATCAGCAAATTTTGATCGAAGCGCGTCGGTGTGTAGAACAGATATTGGAGG
AGGATCCTATGTTAAATATGGAAAAAAATAAAACTCTTCGTATTTATTTTGAGAAAAAAAGTAAAAGGGAAATAACTTGG
GATAAAATTTCGTAA

Protein sequence :
MGIFKENTSQNGVGSLTILALVERKGFFDTPIEFLKGVGPSKADVLKKELNIYTYGDLLRHYPFRYIDRTRFYRIGEITP
DLQYIQLKGIIVDKQLIGEQRRKRLVATLQDERGSHLELVWFQGIKFIEKHIHIGKEYIAFGKPNFFNNKANLPHPDLEL
VSEAKKEFQTALQPVYSSTEKLKLFFLDTKGIMRLVYNLLEQGANFIDEDLPEAPLEQYKLMSRRDALIQIHFPKDSKLL
QRSQARLKFEELFFIQLRLLFNKQIKKRLHNGSLFSVVGDNFNGFYTNHLPFELTGAQKRVIKEIRRDTNSGMQMNRLVQ
GDVGSGKTVVALMSMLLAIDNGFQACMMAPTEILATQHFHSISMMLKDMPVKVELLTGSTKKKQREKLFEELANGELKLL
VGTHALIEDKVQFQNLGLVIIDEQHRFGVEQRAKLWQKNSSPPHILVMTATPIPRTLAMTLYGDLDVSVIDELPAGRKPI
QTLHKFENHRLRLHGFLKEEIAKGRQVYIVYPLIEESEKMDYLDLMNGYEHITKSFPQPQYQVSIVHGKMKAAEKDFEMN
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DKIS

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
recG CAJ77039.1 ATP-dependent DNA helicase Not tested AbaR1 Protein 3e-93 41