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Name : Solca_3096 (Solca_3096) Accession : YP_006257285.1 Strain : Solitalea canadensis DSM 3403 Genome accession: NC_017770 Putative virulence/resistance : Unknown Product : dihydrolipoamide dehydrogenase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 3645477 - 3647090 bp Length : 1614 bp Strand : - Note : PFAM: Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase; Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain; TIGRFAM: dihydrolipoamide dehydrogenase DNA sequence : GTGATTTATTTATGGAATAAATTGTTGAATTATACCATTTTTAGGTTTTATCCTATAAATCAAATCCCTACTTTTACGCC GGTTTTTAATTTTGGTTATTTAAAGCAACCAAAACGATACAATAGAATTGAGAACCTAGAGCAAGAAATCGGTGTTACAT ACAATACTGATACACTATCATCAGCACATAATAATAAATCAATAATAAACATGAAATACGACGTAGTAGTAATCGGTTCC GGTCCGGGTGGTTATGTTGCGGCAATTCGTTGCGCTCAGTTGGGTTTAAAAACGGCAATGGTTGAGCGTTACAGCACTTT TGGTGGAACCTGTTTAAATGTTGGATGTATTCCTTCAAAAGCATTACTTGATTCATCAGAGCATTATCATAATGCTGAAC ATACTTTTAAAACTCATGGTATTGAGCTTAGCAATTTAAAAGTTAATCTTGAGCAAATGATTAAACGTAAAAGTGAGGTA GTTAAACAAACTACTGACGGTATTACGTTTTTGATGAAGAAAAACAAGATTGATACCTACTACGGTCATGGTTCATTTGT GAATAAAAATACCATTAAGATCGCTAAAGGCGACGGTTCTGAACAAACAATAGAAACTGAAAAAGTAATTATTGCTACCG GTTCTAAACCAGCAACTTTGCCTTTTATTTCAATCGATAAAAAACGTATTATTACCTCAACCGAAGCTTTAAATCTTCAG GAAGTTCCTAAACATTTAGTGCTTATCGGTGGTGGAGTAATTGGTTTAGAGTTAGGTTCGGTTTATGCACGTTTAGGTGC AAAGGTTACTGTAGTTGAATACATGGATAGTATTATCCCAACTATGGATAAAGAGCTTGGTAAACAGTTACAACGCTCAT TAAAAGGGATTGGTTTTGAATTCTTATTAAGTCATAAAGTAACAGGTGCTACTGTAAAAGGTAAAGAAGTAACTGTGGCA GCAGAGAATTCAAAAGGCGAGCCTATTGAAATTAAAGGTGATTACTGTTTAGTTGCTGTTGGACGTTCAGCATATACTGA AGGTTTAGGCTTAGAAAATATTGGCTTAACAGTTGAAGAGCGTGGTAAGAAAATTACGGTTGATGATCACTTAGAAACTG CGGTAAAAGGTGTTTATGCAATTGGCGACGTAGTACGTGGTGCAATGCTGGCACATAAAGCTGAAGAAGAAGGTGTATTT GTTGCTGAATTAATTGCCGGACAAAAACCTCACATGAATTACAACTTAATTCCTGGAGTAGTTTATACGTGGCCAGAAGT AGCTTCTGTAGGTAAAACTGAGGAAGAACTTAAAGCATCTGGCGTAAAATATAAAACAGGCTCATTCCCGTTCAAAGCAA GTGGTCGTGCACGTGCAAGTATGGATACTGACGGCCTAATCAAAGTATTGGCTGATGCGCAAACAGATGAGATATTAGGA GTCCATATGATTGGTCCTCGCGTTGCCGATATGATTGCTGAGGCGGTTGTTGCAATGGAGTTCCGTGCTTCTGCAGAGGA TATCGGTCGTATTTGTCACGCTCACCCAACGTATACTGAATCGTTTAAAGAAGCAGCTTTAGCTGCAACTGCAAACAGAG CATTGCATATTTAA Protein sequence : MIYLWNKLLNYTIFRFYPINQIPTFTPVFNFGYLKQPKRYNRIENLEQEIGVTYNTDTLSSAHNNKSIINMKYDVVVIGS GPGGYVAAIRCAQLGLKTAMVERYSTFGGTCLNVGCIPSKALLDSSEHYHNAEHTFKTHGIELSNLKVNLEQMIKRKSEV VKQTTDGITFLMKKNKIDTYYGHGSFVNKNTIKIAKGDGSEQTIETEKVIIATGSKPATLPFISIDKKRIITSTEALNLQ EVPKHLVLIGGGVIGLELGSVYARLGAKVTVVEYMDSIIPTMDKELGKQLQRSLKGIGFEFLLSHKVTGATVKGKEVTVA AENSKGEPIEIKGDYCLVAVGRSAYTEGLGLENIGLTVEERGKKITVDDHLETAVKGVYAIGDVVRGAMLAHKAEEEGVF VAELIAGQKPHMNYNLIPGVVYTWPEVASVGKTEEELKASGVKYKTGSFPFKASGRARASMDTDGLIKVLADAQTDEILG VHMIGPRVADMIAEAVVAMEFRASAEDIGRICHAHPTYTESFKEAALAATANRALHI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SE0077 | NP_763632.1 | dihydrolipoamide dehydrogenase component of pyruvate dehydrogenase E3 | Not tested | SCCpbp4 | Protein | 9e-70 | 44 |
