Name : Solca_1919 (Solca_1919) Accession : YP_006256155.1 Strain : Solitalea canadensis DSM 3403 Genome accession: NC_017770 Putative virulence/resistance : Unknown Product : nucleoside permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 2277283 - 2278545 bp Length : 1263 bp Strand : + Note : PFAM: Na+ dependent nucleoside transporter C-terminus; Na+ dependent nucleoside transporter N-terminus; Nucleoside recognition DNA sequence : ATGGGTAGATTTACCGGTTTATTCGGCATTGCACTTATTTTGGGCATTGCTTTTTTAATGTCCAATAATAAAAGAAAAAT TAATTATCGTGTAGTGCTGAGCGGTTTATTGCTCCAGGTAATCATTGCAGTATTGGTTTTTAAAGTTCCATTTGTACGTC ATTTCTTTGAAATGCTGGGTCATGGAATGGAAAAAATTGAACATTTCGCATTTCAGGGTGCATCGTTTGTATATGGAGGT TTAGGTGTTGATAAAGGGAATGGTGTTATTGGTAACTATAACTCCGGTGGATTTGTATTTGCTTTTAATGTTACTGCTAC CATTATATTAGTTTGCGCATTAGTGGCTGTATTTTATCATTTTGGTATAATGCAACGTATTGTATCTCTTATTGCTAGAG CAATGAACTTTATTATGCGTGTTAGTGGTGCCGAAGCATTAAGTAATGTTGCCAGTGCATTTGTTGGTCAGGTGGAAGCC CAAGTAATGATACGCCCCTATCTTAAGACAATGACCAAAAGTGAGCTTTTAGCAAGTATGAGCGGAAGCTTGGCCTGTAT TGCTGGTGGTATTTTGGTTGTTTATGCTAAAATGGGTGCTCAAGCTGGAATGGACCTGGCTCCTAAATTAATTACAGCAA GTTTAATGGCTGCTCCCGGCGCTTTAGTTATTTCTAAAATTTTATATCCTGAAACTGAAGAAAGCCAAACATTAGGGCAT GTTAAACTGGATGTAAAAAGTAATTATTCCAATGTAATCGATGCGATTTCTCACGGTGCGGCAGATGGTTTTAAAATTGC CATGAATGTAATCGCGATGCTGATTGGCTTCATTGCTATTATTGCTTTGCTAGATGCTTTATTGTTATGGACGGGACAAC TTTTTAGTCCTGATTTAAACTTAAGCCTTAATTACATTTTCGGCAAAATCTTTTATCCTTTTGCATGGGCTATGGGTGTT CCAAGTGAAGATGTAAATAGTGTTGCTACTTTACTGGGTCAAAAAATAACAGTAAATGAATTTGTTGCCTTTTTGAATTT AACGAGCAAAACGGTGCCGGTTGTTACAGAAAAAGGATTAATGATTGTAAGTATTGCAATTTGCGGTTTTGCTAACTTCA GCAGTGTTGGGATGCAAATTGGCGGTATCGGAGCTCTTGTACCAGAACGTCGTGCGGACTTAGCCAAATTAGGCTTAAAA GCACTATTATGTGGTACATTAGCATCTTATCTTTCTGCTACAATTGCAGGTATCTTGATGTAA Protein sequence : MGRFTGLFGIALILGIAFLMSNNKRKINYRVVLSGLLLQVIIAVLVFKVPFVRHFFEMLGHGMEKIEHFAFQGASFVYGG LGVDKGNGVIGNYNSGGFVFAFNVTATIILVCALVAVFYHFGIMQRIVSLIARAMNFIMRVSGAEALSNVASAFVGQVEA QVMIRPYLKTMTKSELLASMSGSLACIAGGILVVYAKMGAQAGMDLAPKLITASLMAAPGALVISKILYPETEESQTLGH VKLDVKSNYSNVIDAISHGAADGFKIAMNVIAMLIGFIAIIALLDALLLWTGQLFSPDLNLSLNYIFGKIFYPFAWAMGV PSEDVNSVATLLGQKITVNEFVAFLNLTSKTVPVVTEKGLMIVSIAICGFANFSSVGMQIGGIGALVPERRADLAKLGLK ALLCGTLASYLSATIAGILM |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
yutK | YP_005163383.1 | putative sodium/nucleoside cotransporter | Not tested | Not named | Protein | 1e-45 | 42 |