Gene Information

Name : Solca_1919 (Solca_1919)
Accession : YP_006256155.1
Strain : Solitalea canadensis DSM 3403
Genome accession: NC_017770
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : nucleoside permease
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 2277283 - 2278545 bp
Length : 1263 bp
Strand : +
Note : PFAM: Na+ dependent nucleoside transporter C-terminus; Na+ dependent nucleoside transporter N-terminus; Nucleoside recognition

DNA sequence :
ATGGGTAGATTTACCGGTTTATTCGGCATTGCACTTATTTTGGGCATTGCTTTTTTAATGTCCAATAATAAAAGAAAAAT
TAATTATCGTGTAGTGCTGAGCGGTTTATTGCTCCAGGTAATCATTGCAGTATTGGTTTTTAAAGTTCCATTTGTACGTC
ATTTCTTTGAAATGCTGGGTCATGGAATGGAAAAAATTGAACATTTCGCATTTCAGGGTGCATCGTTTGTATATGGAGGT
TTAGGTGTTGATAAAGGGAATGGTGTTATTGGTAACTATAACTCCGGTGGATTTGTATTTGCTTTTAATGTTACTGCTAC
CATTATATTAGTTTGCGCATTAGTGGCTGTATTTTATCATTTTGGTATAATGCAACGTATTGTATCTCTTATTGCTAGAG
CAATGAACTTTATTATGCGTGTTAGTGGTGCCGAAGCATTAAGTAATGTTGCCAGTGCATTTGTTGGTCAGGTGGAAGCC
CAAGTAATGATACGCCCCTATCTTAAGACAATGACCAAAAGTGAGCTTTTAGCAAGTATGAGCGGAAGCTTGGCCTGTAT
TGCTGGTGGTATTTTGGTTGTTTATGCTAAAATGGGTGCTCAAGCTGGAATGGACCTGGCTCCTAAATTAATTACAGCAA
GTTTAATGGCTGCTCCCGGCGCTTTAGTTATTTCTAAAATTTTATATCCTGAAACTGAAGAAAGCCAAACATTAGGGCAT
GTTAAACTGGATGTAAAAAGTAATTATTCCAATGTAATCGATGCGATTTCTCACGGTGCGGCAGATGGTTTTAAAATTGC
CATGAATGTAATCGCGATGCTGATTGGCTTCATTGCTATTATTGCTTTGCTAGATGCTTTATTGTTATGGACGGGACAAC
TTTTTAGTCCTGATTTAAACTTAAGCCTTAATTACATTTTCGGCAAAATCTTTTATCCTTTTGCATGGGCTATGGGTGTT
CCAAGTGAAGATGTAAATAGTGTTGCTACTTTACTGGGTCAAAAAATAACAGTAAATGAATTTGTTGCCTTTTTGAATTT
AACGAGCAAAACGGTGCCGGTTGTTACAGAAAAAGGATTAATGATTGTAAGTATTGCAATTTGCGGTTTTGCTAACTTCA
GCAGTGTTGGGATGCAAATTGGCGGTATCGGAGCTCTTGTACCAGAACGTCGTGCGGACTTAGCCAAATTAGGCTTAAAA
GCACTATTATGTGGTACATTAGCATCTTATCTTTCTGCTACAATTGCAGGTATCTTGATGTAA

Protein sequence :
MGRFTGLFGIALILGIAFLMSNNKRKINYRVVLSGLLLQVIIAVLVFKVPFVRHFFEMLGHGMEKIEHFAFQGASFVYGG
LGVDKGNGVIGNYNSGGFVFAFNVTATIILVCALVAVFYHFGIMQRIVSLIARAMNFIMRVSGAEALSNVASAFVGQVEA
QVMIRPYLKTMTKSELLASMSGSLACIAGGILVVYAKMGAQAGMDLAPKLITASLMAAPGALVISKILYPETEESQTLGH
VKLDVKSNYSNVIDAISHGAADGFKIAMNVIAMLIGFIAIIALLDALLLWTGQLFSPDLNLSLNYIFGKIFYPFAWAMGV
PSEDVNSVATLLGQKITVNEFVAFLNLTSKTVPVVTEKGLMIVSIAICGFANFSSVGMQIGGIGALVPERRADLAKLGLK
ALLCGTLASYLSATIAGILM

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
yutK YP_005163383.1 putative sodium/nucleoside cotransporter Not tested Not named Protein 1e-45 42