|
Name : HCN_1423 (HCN_1423) Accession : YP_006235737.1 Strain : Helicobacter cinaedi PAGU611 Genome accession: NC_017761 Putative virulence/resistance : Unknown Product : type VI secretion protein VC_A0110 family Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1417667 - 1419391 bp Length : 1725 bp Strand : - Note : - DNA sequence : GTGAATAATGAAGATGTATTTTACTACCAAAAAGAGCTTTCCTATCTCTATCAAACAAGAGAATATTTTGTCAAAAAATT TCCAAAACTCGCACCATTTTTAGCTCTTGATAGTAAAGACCCAGATATTGAGAGAATTATTGAAAATCTTGCTATTTTGA CTTCTAAAATTCATCAGGAAATGGAACAAAATATTCCATACATAGCAGAATCTTTGTTGAATGTAGTCTCTCCTAATTAT ACTAATCCACTACCTTCTTTGTGTATGCAAGAGTTTCTTTTAAATAAAGATAGTAAAAAAAATAAGATTATTGTTCCAAA AGGAAGTCGCCTTCAGTCTATAACCATAGAACAAATTGAGTGTGAGTTTAGAACGATTTATGATGTTTATCTCTACCCTT TAGATATTGATGAAGTGTTTATGAGCAGTGAAAAACAATATCACACAATGGATTTAAGGTTAAAGGTTAATAAGCCTGAT TTAAAAATTTGTGATATAGGATTAGATTGTTTAAATTTATATCTTGGAGATGACATCTACACTTCCGCAACTTTACTTTT ATTCATTCACCTTTATTTGGAGGAGGTAAAAATCATTTCTTGTGATACTTCTGAAAAGTTTAAGCTTAATTCTTGCAACA TTAAAACAATAGGGCTTGAACCAAATGAAAGTTGTTTAAATTATGATGATTTAGGGTTTGAGGCTTTTTCTTTGCTTAGG GAGTATTTTTTTATCCCTGAAAAATTTAATTTTATAAGAATACAGGGTTTAGATATTTTAAAGGATTGTCAAGGCTCAAA TTTGAGTATTCAATTTAAGTTCAATAAAATTTTTCCAAAGAATTGCATCGTCAGAGCAGATTTATTTTCTTTAAGCATTA CGCCTATTGTGAATATTTTTCCCAAAAATGCAGAATCAATTATTAATGACCATACCAAAGATGGATATAGGATTTTTGTA GATAGGGTGCATTTAGATTCTTATGAAATTATAAAGATTAATCAAGTCAAAGCTCACAATAGTGATAGTGGAAGAAGGAT TCTTAAAAATTATAAGAGTTTTGAACGTTTTGAGTTTTTAAAAGACAATCAAAATGAATTTTATAGTATAAATGTTAAAA AAAATTCTAAAGGTGAAACATACAAAGAAATTTCTTTTTTTTCAGAGCATTCTTACAATGAGATAATTACCATTGATGCT TTGTGTTGTAATAAGAATTTACCCTCTAAGCTTAAGATAGGCGATATAAGACATATTAATTTTGAGGATATATCCACTAA AAATATTAAAATCCCAAGTATGATGAGAGAATATAGCGTTGATGGGCATTTACTTTGGAAGCTTGTATCTATACTCTCTT TTAATTATCAAAGTATTCTTAATACAACTTCATTTTTTGGAGTATTAGAAAGTTATAGTTTTGTCAATGACAAGGAGAAT GAAGAAACTTATAAGCGTTTAAAAAATTCTATTGCATATATAGAATCTAAATCGACTTACCTCGTTGATGAATACATTAC AAAAAAGGGAACACTCTGTATAATGGGCATTAAGGATTCTAATTTTTATTCTTTGGGAGAAGTTTATAAATTAGGGCTTA TAATATCTAAATTTTTTGCTTCTTTTGTAAGCATTAATTCTTTTTGCGAATTAAAGATAAAATGCTTGGATAGCAAAGAG ATTTTGTATTATCCAGCTACTCGCGGCAAAAAAGTTTCTTTATGA Protein sequence : MNNEDVFYYQKELSYLYQTREYFVKKFPKLAPFLALDSKDPDIERIIENLAILTSKIHQEMEQNIPYIAESLLNVVSPNY TNPLPSLCMQEFLLNKDSKKNKIIVPKGSRLQSITIEQIECEFRTIYDVYLYPLDIDEVFMSSEKQYHTMDLRLKVNKPD LKICDIGLDCLNLYLGDDIYTSATLLLFIHLYLEEVKIISCDTSEKFKLNSCNIKTIGLEPNESCLNYDDLGFEAFSLLR EYFFIPEKFNFIRIQGLDILKDCQGSNLSIQFKFNKIFPKNCIVRADLFSLSITPIVNIFPKNAESIINDHTKDGYRIFV DRVHLDSYEIIKINQVKAHNSDSGRRILKNYKSFERFEFLKDNQNEFYSINVKKNSKGETYKEISFFSEHSYNEIITIDA LCCNKNLPSKLKIGDIRHINFEDISTKNIKIPSMMREYSVDGHLLWKLVSILSFNYQSILNTTSFFGVLESYSFVNDKEN EETYKRLKNSIAYIESKSTYLVDEYITKKGTLCIMGIKDSNFYSLGEVYKLGLIISKFFASFVSINSFCELKIKCLDSKE ILYYPATRGKKVSL |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| HH0245 | NP_859776.1 | hypothetical protein | Not tested | HHGI1 | Protein | 1e-132 | 48 |
