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Name : HPPC18_00710 (HPPC18_00710) Accession : YP_006228428.1 Strain : Helicobacter pylori PeCan18 Genome accession: NC_017742 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 146926 - 148581 bp Length : 1656 bp Strand : + Note : COG1620 L-lactate permease DNA sequence : GTGTCAGAATTTCATCAAATTTATGACCCTTTGGGTAACATTTGGCTGAGCGCTCTTGTGGCCTTATTGCCGATTTTATT ATTTTTCTTATCTTTAATGGTTTTTAAACTCAAAGGTTATGCAGCGGCCTTTTTGAGCGTAGCCTTATCAGCCATTATTG CGGTTTTAGTGTATAAAATGCCTGTTAGCATGGTGGGTTCAAGCTTCCTTTATGGCTTTCTTTATGGCTTATGGCCGATC GCATGGATCATTATTGCGGCGATTTTTTTATACAAACTCAGCGTTAAATCCGGCTATTTTGAAATCTTAAAAGAAAGCGT TCAGTCCATCACTTTAGATCACCGCATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCATTTTTAGAAGGGGCGATCG GCTTTGGAGGGCCTATTGCCATCACAGCGGCGATTTTAGTGGGCTTGGGGTTAAGCCCTTTATACGCTGCCGGGTTATGT TTAATCGCTAACACCGCTCCTGTGGCCTTTGGCGCGGTGGGTATCCCTATAAGCGCGATGGCGAGCGCGGTAGGGGTGCC AGCGATCTTAATTTCAGCCATGACGGGTAAAATCCTCTTTTTTGTGAGCTTGTTAGTGCCGTTTTTTATTGTGTTTTTAA TGGATAGTTTTAAGGGGATTAAAGAGACTTTTCCGGCCGTTTTTATCGCGGCTTTTTCTTTCGCTGGCGCGCAATTTTTA AGCTCTAATTATTTAGGGCCAGAATTGCCCGGCATTATTTCAGCCCTTGTTTCACTCGTTGCAACAGCGCTCTTTTTGAA ATTTTGGCAGCCTAAAGCGATTTTTAGAAGCGACGGCAAAGCGGTCTCATTCACTAAAACTAACCATCATATCTGTAAAA TCTATGTCGCTTGGTCTCCTTTTGTGATTTTAGTTTTAGTCATTGTGCTATGGATACAGCCTTTTTTTAAAGCCTTGTTT GAAAAAGACGGCTTGTTAGCTTTTTCTAATTTTTATTTTGAGTTCAATAACATCAGCAACCACATCTTTAAAAGCCCGCC TTTTGTAGAAGCCAATCAAAGCGTGAATTTTCCGGTGGTGTTTAAATTTTTCTTAATCAACACGGTTGGCACTTCCATTT TTTTAGCCGCTCTCATTAGCATGCTCGTTTTAAGGGTGCGAGTGAGCGATGCGCTGAGCGTTTTTGGCGAAACTCTAAAA GAAATGCGCTACCCCATTCTTACCATTGGTTTAGTTTTAAGCTTTGCCTATGTGTCTAATTACAGCGGGATTTCTTCCAC TCTAGCCTTAGCGCTCACCCATACGGGCTTAGCTTTCACCTTTTTCTCGCCCTTGATCGGGTGGGTGGGCGTGTTTTTAA CCGGGAGCGATACGAGTTCTAATCTTTTATTTGGCTCTTTACAGCAACTCACCGCCCAACGATTGCATCTCCCTGAGATT TTAACCTTAACGGCTAATACCGTGGGTGGCACTTTAGGCAAGATGATAAGCCCTCAAAGCATCGCTATCGCTTGCGCGGC AGTGGGATTGGCCGGGAAAGAGAGCGATTTATTCAAATTCACGGTCAAATACTCCCTTATTTTTGTAGCGATCATGGGAG TCGTGATTAGCGCGATTGCATATTTGATCCCTGAAGTGGTGCCTGCGATAAAGTAG Protein sequence : MSEFHQIYDPLGNIWLSALVALLPILLFFLSLMVFKLKGYAAAFLSVALSAIIAVLVYKMPVSMVGSSFLYGFLYGLWPI AWIIIAAIFLYKLSVKSGYFEILKESVQSITLDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPIAITAAILVGLGLSPLYAAGLC LIANTAPVAFGAVGIPISAMASAVGVPAILISAMTGKILFFVSLLVPFFIVFLMDSFKGIKETFPAVFIAAFSFAGAQFL SSNYLGPELPGIISALVSLVATALFLKFWQPKAIFRSDGKAVSFTKTNHHICKIYVAWSPFVILVLVIVLWIQPFFKALF EKDGLLAFSNFYFEFNNISNHIFKSPPFVEANQSVNFPVVFKFFLINTVGTSIFLAALISMLVLRVRVSDALSVFGETLK EMRYPILTIGLVLSFAYVSNYSGISSTLALALTHTGLAFTFFSPLIGWVGVFLTGSDTSSNLLFGSLQQLTAQRLHLPEI LTLTANTVGGTLGKMISPQSIAIACAAVGLAGKESDLFKFTVKYSLIFVAIMGVVISAIAYLIPEVVPAIK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 1e-103 | 52 |
