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Name : HPPC18_00705 (HPPC18_00705) Accession : YP_006228427.1 Strain : Helicobacter pylori PeCan18 Genome accession: NC_017742 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 145228 - 146877 bp Length : 1650 bp Strand : + Note : COG1620 L-lactate permease DNA sequence : ATGGAATTTTATCAAGTCTATGACCCATTAGGCCATATTTGGCTGAGTGCTTTAGTGGCGCTATCGCCTATTGCGCTCTT TTTTATCTCTCTTATTGTCTTTAAACTTAAAGGGTATAGCGCTGGGTTTTTAAGCTTAGCGCTTTCAATCCTTATTGCGT TATTTGTGTATAAAATGCCTGTTCAAATGGTGAGCGCGAGTTTTTTCTATGGTTTTCTTTATGGCTTGTGGCCGATCGCA TGGATTGTGATCGCTGCGATTTTTCTTTACAACCTTTCAGTGAAATCCGGGTATTTTGAGATTTTAAAAGAAAGCATTTT AAGTTTGACGCCGGATCATCGCATTTTAGTGATTTTGATCGGGTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGCGCGATTGGTT TTGGAGGCCCGGTAGCGATCACAGCGGCGATTTTAGTGGGCCTTGGGCTAAACCCCTTATACGCTGCCGGGTTGTGTTTG ATCGCTAACACCGCTCCTGTAGCTTTTGGCGCGGTAGGTATCCCTATCACGGCGATGGCTAGCGTGGTGGGTATCCCTGA GTTAGAGATTTCTCAAATGGTGGGTAGGGTGTTACCCATTTTTTCCATTGGCATTCCTTTTTTCATCGTGTTTTTAATGG ATGGTTTTAGAGGGATTAGAGAAACCTTTCCTGCAGTGGCCGTTACCGGGTTTAGTTTCGCTATCGCGCAATTTTTAAGC TCTAATTATTTAGGGCCACAGCTCCCGGATATTATTTCAGCTTTAGTGTCATTGATTGCTACCACTTTATTTTTAAAATT CTGGCAGCCCAAACACATTTTCACCAGCAATGGCAAAGAGCCAACGATCAGCACAGAAAAACACCATATTTGTAAGGTGG TTGTGGCGTGGATGCCTTTTGTGTTGCTCACGATTACGATTATTATATGGACGCAACCCTGGTTTAAAGCGCTCTTTAAA GAAGGTGGGGCTTTGGCGTTTTCTAGCTTTGCGTTTGAATTCAATTCTATCAGTCAAAAGATTTTCAAAACCGTTCCCAT TGTTACTGAAGCGACCAATTTTCCTGTGGTGTTCAAACTCCCTTTGATTTTAACGACAGGCACTTCCATTTTTTTAGCCG CCCTTTTAAGCGTGTTTTTGTTGCGCGTGAAAATCAGCGATGCGATAGGGGTGTTTGGGGCTACTTTAAAAGAAATGCGT TTGCCGATTTTAACCATTGGCGTGGTTTTAGCGTTTGCGTATGTGGCTAATTATAGCGGCATGAGCGCTACGCTCGCTTT AGCGTTAGCGGATACTGGGCATGTTTTCACTTTCTTTTCGCCTGTGGTAGGTTGGCTTGGGGTGTTTTTAACCGGAAGCG ATACGAGTTCCAATCTCTTATTTGGATCTTTACAAATGCTCATCGCTACACAGCTTGGATTGCCTGAAGTGCTTTTCTTA GCGGCCAACACTTCCGGGGGCGTTGTGGGCAAAATGATAAGCCCTCAAAGTATCGCTATCGCTTGCGCGGCGGTGGGGTT AGTGGGGAAAGAGAGCGAATTGTTCAGATTTACAGTAAAATACTCTATCGCTTTGGCGATCATTATGGGGATTGTCTTCA CTCTTATCGCTTATGTTTTCCCCTTTATTATTCCAGTTACTCCTACTTAA Protein sequence : MEFYQVYDPLGHIWLSALVALSPIALFFISLIVFKLKGYSAGFLSLALSILIALFVYKMPVQMVSASFFYGFLYGLWPIA WIVIAAIFLYNLSVKSGYFEILKESILSLTPDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPVAITAAILVGLGLNPLYAAGLCL IANTAPVAFGAVGIPITAMASVVGIPELEISQMVGRVLPIFSIGIPFFIVFLMDGFRGIRETFPAVAVTGFSFAIAQFLS SNYLGPQLPDIISALVSLIATTLFLKFWQPKHIFTSNGKEPTISTEKHHICKVVVAWMPFVLLTITIIIWTQPWFKALFK EGGALAFSSFAFEFNSISQKIFKTVPIVTEATNFPVVFKLPLILTTGTSIFLAALLSVFLLRVKISDAIGVFGATLKEMR LPILTIGVVLAFAYVANYSGMSATLALALADTGHVFTFFSPVVGWLGVFLTGSDTSSNLLFGSLQMLIATQLGLPEVLFL AANTSGGVVGKMISPQSIAIACAAVGLVGKESELFRFTVKYSIALAIIMGIVFTLIAYVFPFIIPVTPT |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 9e-128 | 55 |
