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Name : HPSH112_00685 (HPSH112_00685) Accession : YP_006226866.1 Strain : Helicobacter pylori Shi112 Genome accession: NC_017741 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 139066 - 140721 bp Length : 1656 bp Strand : + Note : COG1620 L-lactate permease DNA sequence : GTGTCAGAATTTCATCAAGTTTATGACCCTTTGGGTAATATTTGGCTGAGCGCTCTTGTGGCCTTATTACCGATTTTGCT ATTTTTCTTATCTTTAATGGTTTTTAAACTCAAAGGTTATGCGGCGGCCTTTTTGAGCGTGGTTCTGTCAGCCATTATTG CGGTTTTAGTGTATAAAATGCCTGTTAGCATGGTGGGTTCAAGCTTTCTTTATGGCTTCCTCTATGGCTTATGGCCGATC GCTTGGATCATTATTGCGGCGATTTTTTTATACAAACTCAGCGTTAAATCCGGCTATTTTGAAATTTTAAAAGAAAGCGT TCAGTCCATCACTTTAGATCACAGGATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGAGCGATCG GCTTTGGAGGGCCTATTGCCATTACAGCGGCGATTTTAGTGGGCTTAGGGTTAAGCCCCTTATACGCTGCCGGGTTATGT TTGATTGCTAACACCGCTCCTGTAGCCTTTGGCGCGGTGGGTATCCCTATAAGCGCGATGGCGAGCGCGGTAGGGGTGCC AGCGATTTTGATTTCAGCCATGACGGGTAAAATCCTTTTTTTTGTGAGCTTGTTCGTGCCGTTTTTCATTGTGTTTTTAA TGGATGGCTTTAAGGGGATTAAAGAAACTTTTCCGGCCGTTTTTATCGCGGCTTTTTCTTTCGCTATTGCACAATTTTTA AGCTCTAATTACTTGGGACCAGAATTGCCTGGCATTATTTCAGCCCTTGTTTCACTCGTTGCAACGGCACTCTTTTTGAA ATTTTGGCAGCCTAAAGTGATTTTTAGAAGTGATGGCAAAGCGGCTTCATTCACTAAGAGTAACCATCATATCTGTAAGA TCTATGTCGCTTGGTCTCCTTTTGTGATTTTGGTTTTAGTGATTGTGTTATGGATACAGCCTTTTTTTAAGGCTTTATTT GAAAAAGACGGCTTGTTAGCTTTTTCTAATTTTTATTTTGAATTCAATAATATCAGTAACCACATCTTTAAAAGCCCGCC TTTTGTAGAATCCGATCAAAGCGCGAGTTTTCCGGTGGTGTTTAAATTTTCTTTAATCAACACGGTTGGCACTTCCATTT TTTTAGCCGCTCTCATTAGCATACTCGTTTTAAGGGTGCGAGTGAGCGATGCGCTGAGCGTCTTTGGCGAGACTTTAAAA GAAATGCGCTACCCCATTCTTACCATTGGTTTAGTTTTAAGCTTTGCCTATGTGTCTAATTACAGCGGGATTTCTTCCAC TCTAGCCTTAGCGCTCACCCATACGGGCTTAGCTTTCACCTTTTTCTCGCCCTTGATCGGGTGGGTGGGCGTGTTTTTAA CCGGGAGCGATACGAGTTCTAATCTTTTATTTGGCTCTTTACAGCAACTCACCGCCCAACGATTGCACCTCCCTGAGATT TTAACCCTAACGGCTAATACCGTGGGTGGCACTTTGGGCAAGATGATAAGCCCTCAAAGCATCGCTATCGCTTGCGCGGC AGTGGGATTGGCCGGGAAAGAGAGCAATTTATTCAAATTCACGGTCAAATACTCCCTTATTTTTGTAGCGATCATGGGAG TTGTGATTAGCGCGATTGCGTATTTGATCCCTGAAGTGGTGCCTGCGATAAAGTAG Protein sequence : MSEFHQVYDPLGNIWLSALVALLPILLFFLSLMVFKLKGYAAAFLSVVLSAIIAVLVYKMPVSMVGSSFLYGFLYGLWPI AWIIIAAIFLYKLSVKSGYFEILKESVQSITLDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPIAITAAILVGLGLSPLYAAGLC LIANTAPVAFGAVGIPISAMASAVGVPAILISAMTGKILFFVSLFVPFFIVFLMDGFKGIKETFPAVFIAAFSFAIAQFL SSNYLGPELPGIISALVSLVATALFLKFWQPKVIFRSDGKAASFTKSNHHICKIYVAWSPFVILVLVIVLWIQPFFKALF EKDGLLAFSNFYFEFNNISNHIFKSPPFVESDQSASFPVVFKFSLINTVGTSIFLAALISILVLRVRVSDALSVFGETLK EMRYPILTIGLVLSFAYVSNYSGISSTLALALTHTGLAFTFFSPLIGWVGVFLTGSDTSSNLLFGSLQQLTAQRLHLPEI LTLTANTVGGTLGKMISPQSIAIACAAVGLAGKESNLFKFTVKYSLIFVAIMGVVISAIAYLIPEVVPAIK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 7e-99 | 52 |
