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Name : HPSH417_00690 (HPSH417_00690) Accession : YP_006223794.1 Strain : Helicobacter pylori Shi417 Genome accession: NC_017739 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 141486 - 143141 bp Length : 1656 bp Strand : + Note : COG1620 L-lactate permease DNA sequence : GTGTCAGAATTTCATCAAGTTTATGACCCTTTGGGTAATATTTGGCTGAGCGCTCTTGTAGCCTTATTACCGATTTTGCT ATTTTTCTTATCTTTAATGGTTTTTAAACTCAAAGGTTATGCGGCGGCCTTTTTGAGCGTGGCTCTGTCAGCCATTATTG CGGTTTTAGTGTATAAAATGCCTGTTAGCATGGCGGGTTCAAGCTTTCTTTATGGCTTCCTCTATGGCTTGTGGCCGATC GCTTGGATCATCATTGCGGCGATTTTTTTATACAAACTCAGCGTTAAATCCGGCTATTTTGAAATTTTAAAAGAAAGCGT TCAGTCCATCACTTTAGATCACAGGATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGAGCGATCG GCTTTGGAGGGCCTATTGCCATTACAGCAGCGATTTTAGTGGGTTTAGGGTTAAGCCCTTTATACGCTGCCGGGTTATGT TTGATTGCTAACACCGCTCCTGTAGCTTTTGGCGCGGTGGGTATCCCTATAAGCGCGATGGCGAGCGCGGTAGGGGTGCC AGCGATTTTGATTTCAGCCATGACGGGTAAAATCCTTTTTTTTGTGAGCTTGTTCGTGCCGTTTTTCATTGTATTTTTAA TGGATGGCTTTAAGGGGATTAAAGAAACTTTTCCGGCCGTTTTTATTGCGTCTTTTTCTTTCGCTGGCGCGCAATTTTTA AGCTCTAATTACTTGGGGCCAGAATTGCCTGGTATTATTTCAGCCCTTGTTTCACTCGTTGCAACAGCGCTTTTTTTGAA ATTTTGGCAACCTAAAGTGATTTTTAGAAGCGATGGCAAAGCAGCTTCATTCACTAAGAGCAACCATCATATCTGTAAGA TCTATGTCGCTTGGTCTCCTTTTGTGATTTTGGTTTTAGTGATTGTGTTATGGATACAGCCTTTTTTTAAGGCTTTATTT GAAAAAGACGGCTTGTTAGCTTTTTCTAATTTTTATTTTGAATTCAATAACATCAGTAACCACATCTTTAAAAGCCCGCC TTTTGTAGAATCCGATCAAAGCGCGAGTTTTCCGGTGGTGTTTAAATTTTCTTTAATCAACACGGTTGGCACTTCCATTT TTTTAGCCGCTCTCATTAGCATGCTCGTTTTAAGGGTGCGAGTGAGCGATGCACTGAGCGTCTTTGGCGAAACTCTAAAA GAAATGCGCTACCCCATTCTTACCATCGGTTTAGTTTTAAGCTTTGCCTATGTGTCTAATTACAGCGGGATTTCTTCCAC CCTGGCCTTAGCGCTCACCCATACGGGATTAGCTTTCACCTTTTTCTCGCCCTTGATCGGGTGGGTGGGCGTGTTTTTAA CCGGAAGCGATACGAGTTCTAATCTTTTATTTGGCTCTTTACAGCAACTCACCGCCCAACGATTGCATCTCCCTGAGATT TTAACTCTAACGGCTAATACCGTGGGTGGCACTTTGGGCAAGATGATAAGCCCTCAAAGCATCGCTATCGCTTGTGCGGC AGTGGGATTGGCCGGGAAAGAGAGCGATTTATTCAAATTCACGGTCAAATACTCCCTTATTTTTGTAGCGATCATGGGAG TCGTGATTAGCGCGATTGCGTATTTGATCCCTGAAGTGGTGCCTGCGATAAAGTAG Protein sequence : MSEFHQVYDPLGNIWLSALVALLPILLFFLSLMVFKLKGYAAAFLSVALSAIIAVLVYKMPVSMAGSSFLYGFLYGLWPI AWIIIAAIFLYKLSVKSGYFEILKESVQSITLDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPIAITAAILVGLGLSPLYAAGLC LIANTAPVAFGAVGIPISAMASAVGVPAILISAMTGKILFFVSLFVPFFIVFLMDGFKGIKETFPAVFIASFSFAGAQFL SSNYLGPELPGIISALVSLVATALFLKFWQPKVIFRSDGKAASFTKSNHHICKIYVAWSPFVILVLVIVLWIQPFFKALF EKDGLLAFSNFYFEFNNISNHIFKSPPFVESDQSASFPVVFKFSLINTVGTSIFLAALISMLVLRVRVSDALSVFGETLK EMRYPILTIGLVLSFAYVSNYSGISSTLALALTHTGLAFTFFSPLIGWVGVFLTGSDTSSNLLFGSLQQLTAQRLHLPEI LTLTANTVGGTLGKMISPQSIAIACAAVGLAGKESDLFKFTVKYSLIFVAIMGVVISAIAYLIPEVVPAIK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 1e-104 | 52 |
