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Name : HCW_03985 (HCW_03985) Accession : YP_006222700.1 Strain : Helicobacter cetorum MIT 00-7128 Genome accession: NC_017737 Putative virulence/resistance : Unknown Product : pyrimidine nucleoside transport protein (nupC) Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 844484 - 845740 bp Length : 1257 bp Strand : + Note : COG1972 Nucleoside permease DNA sequence : ATGTTTATTAGTGCATTAATGAGCGTTGTGGGCATGGCGGTGCTTTTAGGTATCGCTTGGGTTTTTTCTAATAATAAAAA AGCAATTAATTATCGCACGATTATCAGCGCATTTGTTTTGCAAGTAAGTTTGGGGGCGTTGATTTTATATGTGCCAATAG GTAGGGAAATACTTCAAAGTTTAGCCAATGGCATACAGCATGTGATAAATTATGGCTATGAAGGGGTGCGCTTTTTATTT GGTAATTTAGCGCCAAATTCTCAAGGTGAGCAAGGGATAGGGGGCTTTGTCTTTGCGATTAATGTTTTAGCGGTGGTTAT CTTTTTTTCTAGCTTGATTTCATTATTGTATTATCTAAAAATCATGCCCTTATTTATCAATCTCATTGGTGGGGCATTAC AAAAATGCTTAGGCACTTCTAAAGCAGAAAGCATGAGTGCAGCAGCAAATATCTTTGTAGGACACACTGAGGCTCCTTTG GTAGTTAAACCCTATCTAAACAGCATGAGCAATTCAGAGATTTTTGCGATTATGAGTGCTGGAATGGCAAGTATTGCTGG GCCTGTGTTAGCTGGGTATGCGAGCATGGGCGTTCCTTTGACTTATCTATTAGCCGCCTCATTTATGTCAGCGCCTAGTG GGTTATTGTTTGCCAAAATGATTTATCCCCAAGATGAAAAAACCTCTAATGCGACAGATATTTCTATAGAAAAGCCCGTG AATGTTTTAGAGGCTATTTCTGATGGCGCTACTACAGGATTGAATTTAGCCTTACATATTGGGGCTATGCTTTTAGCCTT TGTAGCCATGTTGGCTCTAATTAATGGGATTTTAGGGGTTTTAGGGGGATTTTTAGGCATAGAGCATTTGTCTTTAGGAT TGATTTTAGGCACACTTTTAAAACCCTTAGCCTTTGTTTTAGGGATTCCTTGGAAAGAAGCTGGGGTTGCTGGAGAGATT ATAGGGATTAAAATCGCTTTGAATGAATTTATGGGCTATATGCAATTAGTGCCATATTTAAGCGATAACGCTCCCTTAGT GTTGAGTGAAAAAACCAAAGCGATTATTACTTTTGCGTTGTGCGGATTTGCTAATCTAAGCTCAGTTGCTATGCTCATTG GTGGGATTGGGAGCTTAGTGCCTAGTAAAAAAGAAATGATTGCCAAACTGGCTTTAAAAGCGGTGTTTGTAGGCACGCTT TCAAATTTTATGAGCGCAACAATCGCTGGATTATTCATAGGACTAAATGCGAATTAA Protein sequence : MFISALMSVVGMAVLLGIAWVFSNNKKAINYRTIISAFVLQVSLGALILYVPIGREILQSLANGIQHVINYGYEGVRFLF GNLAPNSQGEQGIGGFVFAINVLAVVIFFSSLISLLYYLKIMPLFINLIGGALQKCLGTSKAESMSAAANIFVGHTEAPL VVKPYLNSMSNSEIFAIMSAGMASIAGPVLAGYASMGVPLTYLLAASFMSAPSGLLFAKMIYPQDEKTSNATDISIEKPV NVLEAISDGATTGLNLALHIGAMLLAFVAMLALINGILGVLGGFLGIEHLSLGLILGTLLKPLAFVLGIPWKEAGVAGEI IGIKIALNEFMGYMQLVPYLSDNAPLVLSEKTKAIITFALCGFANLSSVAMLIGGIGSLVPSKKEMIAKLALKAVFVGTL SNFMSATIAGLFIGLNAN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| yutK | YP_005163383.1 | putative sodium/nucleoside cotransporter | Not tested | Not named | Protein | 2e-50 | 42 |
