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Name : HCW_01400 (HCW_01400) Accession : YP_006222199.1 Strain : Helicobacter cetorum MIT 00-7128 Genome accession: NC_017737 Putative virulence/resistance : Unknown Product : glutamate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 273264 - 274490 bp Length : 1227 bp Strand : + Note : COG0786 Na+/glutamate symporter DNA sequence : TTGCAAGAAATTAAACTAGATGTTTACGCTACTTTGGTGTGTATGGTCTTAGTGTTATTGCTTGGACGCTATGTTATTTC TAAGATAAAATTTTTAAGAGATTATGATATTCCAGAACCTGTTGTGGGTGGGGTTTTAGTAGCATTCTTTATCATGTTAG CCCACCAATTTTATGATTTTGATTTGCAATTTGATTCTTCTTTAAAAGACCCTTTAATGCTGACTTTCTTCATTACTATT GGCTTGAGTGCGGATTTCAAATCTTTGCAAAAAGGCGGGAAAATGCTTGCAGTTTTCTTGCTTGTGGTAGTGGGGTTTGT AGTGTGTCAAGATATTGTAGGTGTTGCTGTAGCAAGTCTTTTGGGGGTGAATCCTTTAATGGGACTTTTAGGGGGTTCTA TTGCTTTAGTGGGAGGGCATGGCACAAGTGCGGCATGGGCTAATTCTTTCACACAAGCTCCCTATGATTTTAGCTCAAGC TTGGAAGTGGGCATGGTGTGTGCGACCTTTGGATTGGTGAGTGGGGGGATTATTGGAGGGCCTGTTGCAAAATATTTGAT TTCTAAATACAAATTAGAGCCAAAAGATACTAAAGAAAAAGACGCTCTTGAAGGTATTGTCTCCAAAGGTTTTGAAACCC CTAAAGAAGAGCGCTTAATCACTGCATCAAGTTTTGTAGAGTCTTTAGCCTTGATTGCGATTGCTCTATTAGTAGGGACT TTTTTATCTCATTTAATGCCTAAGAGTTTCACTCTACCCACTTTTGTATTATGCTTGTTTGTGGGGGTTATTTTAAGAAA TGCTTTATCGTTTTTCAAAATCCATAGCGTGTTTGATAGAGAAGTTTCTGTAATAGGTAATGTAAGTTTGAGCTTGTTTT TAGCTTATGCTTTAATGAGCGTAAATTTATTAGAATTGTTAAAACTTGCTGTGCCATTAGCGGTTATTTTAACGACTCAA GTGGTGTTTATGATACTTTATGTGGTTCTTGTAACCTTTAGAGCATGTGGCAAAGATTATGATGCGGCGGTGCTATGTGC TGGGCATTGTGGTTTTGGACTTGGAGCAACCCCAACGGCTATGGTGAATATGCAAACTATCACCAACCACTACGGACATT CGCATGTGGCATTTATCGTAGTGCCGTTAGTAGGAGCGTTTTTTATTGACATTATTAACGCTTTAGTGATTAAAGGGTTT TTGTCTTTGCCCTTTTTTCCTAGTTAA Protein sequence : MQEIKLDVYATLVCMVLVLLLGRYVISKIKFLRDYDIPEPVVGGVLVAFFIMLAHQFYDFDLQFDSSLKDPLMLTFFITI GLSADFKSLQKGGKMLAVFLLVVVGFVVCQDIVGVAVASLLGVNPLMGLLGGSIALVGGHGTSAAWANSFTQAPYDFSSS LEVGMVCATFGLVSGGIIGGPVAKYLISKYKLEPKDTKEKDALEGIVSKGFETPKEERLITASSFVESLALIAIALLVGT FLSHLMPKSFTLPTFVLCLFVGVILRNALSFFKIHSVFDREVSVIGNVSLSLFLAYALMSVNLLELLKLAVPLAVILTTQ VVFMILYVVLVTFRACGKDYDAAVLCAGHCGFGLGATPTAMVNMQTITNHYGHSHVAFIVVPLVGAFFIDIINALVIKGF LSLPFFPS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| gltS | NP_273147.1 | sodium/glutamate symport carrier protein | Not tested | IHT-A | Protein | 8e-80 | 50 |
| unnamed | AEA34672.1 | sodium/glutamate symport carrier protein | Not tested | Not named | Protein | 2e-71 | 45 |
