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Name : HCW_08785 (HCW_08785) Accession : YP_006223640.1 Strain : Helicobacter cetorum MIT 00-7128 Genome accession: NC_017737 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1935417 - 1937087 bp Length : 1671 bp Strand : - Note : COG1620 L-lactate permease DNA sequence : GTGCAATCTGTTGTTGAATTTCATCAAGTCTATGACCCTTTGGGTAATATATGGTTGAGCGCTTTAGTAGCGGTGTTACC CATTGTGTTATTTTTCTTATCATTGATTGTATTTAAACTAAAGGGCTATAGCGCAGCGTTTTTAAGCGTGTTGCTTTCAG CCATTATTGCAGTGTTGGTGTATAAAATGCCCGTAAGTATGGTTGGCTCTAGTTTTGTTTATGGGTTTTTATATGGTTTG TGGCCAATTGCTTGGATTATTATTGCGGCAATTTTCTTATACAAGTTGAGCGTAAAATCAGGCTATTTTGAAATCTTAAA AGAAAGCGTGCAATCCATTACCTTAGACCATAGAATTTTAGTGATTTTAATTGGTTTTTGTTTTGGCTCATTTTTAGAAG GGGCTATTGGTTTTGGTGGGCCTATTGCTATTACAGCAGCTATTTTAGTGGGATTAGGACTAAGCCCCTTATATGCCGCT GGATTATGTTTGATTGCAAATACCGCCCCTGTAGCTTTTGGAGCAGTAGGTATTCCTATAACAGCTATGGCAGGAGCAGT AGGCGTGCCAGCGATTATGATTTCAGCAATGACAGGTAAAATCCTCTTTTTTGTAAGCTTGATTGTGCCATTTTTTATTG TGTTTTTAATGGATGGCTTTAGGGGTATTAAAGAGACTTTCCCAGCGGTCTTTATTGCGGCAGGAACTTTTGCTATCACG CAGTTTTTAAGCTCTAATTATCTAGGGCCAGAATTACCGGGCATTATTTCAGCAATTGTTTCATTGGTTTGCACAGCGGT ATTTTTGAGATTTTGGCAACCAAAGCATATCTTTAGAAGTGATGGCAAGGAAGTAGAATTAGCTAAGCACAATCATCATG TGTGCAAAATTTTTGTTGCATGGGCTCCGTTTGTGATTCTAATTGTAACGATTGTATTATGGACGCAACCTTGGTTTAAA GCCTTGTTTAAAGAGGGTGGGGCATTAGCATTTTCTAACTTCTATTTTGAGTTTGAAACCATTAGTAGAAAAATCTTTAA AAGCGCACCATTCTTAGTAGAGGGTAAAGACCCAAGCGATGCAGTGATTTTTAAATTCCCTTTAATTAACACCGTGGGAA CTTCAATTTTCTTAGCAGCTCTAGTTAGCATGCTTGTTTTAAGGGTAAAAGCTAGTGAGGCGATTGGAGTATTTGGAGAG ACCTTAAAAGAAATGCGCTTTCCTATTCTTACCATTGGTTTGGTATTAAGCTTTGCCTTTGTGTCTAATTACAGCGGAAT TTCTGCTACTTTGGCTCTAGCGCTTACTCATACGGGTCAGGCTTTCACTTTCTTCTCGCCCATTATTGGTTGGGTAGGAG TATTTTTAACCGGAAGTGATACAAGCTCTAACTTGCTCTTTGGTGCTTTACAACAACTTACTGCTGAGAGATTGGGTATC CCTGAAGTTCTAACTTTAACAGCAAATACGGTTGGTGGCACTCTAGGCAAGATGATTAGCCCACAAAGTATTGCCATTGC ATGTGCAGCGGTAGGATTAGCTGGTAAAGAGAGTGATTTATTCAAATTCACAGTGAAATACTCTATTATCTTTGTGATTC TTATGGGTGTAGTAATTAGTGCGATTGCGTATTTGATTCCCGATGCAGTGCCTGTTGCTCCACATCTTTAA Protein sequence : MQSVVEFHQVYDPLGNIWLSALVAVLPIVLFFLSLIVFKLKGYSAAFLSVLLSAIIAVLVYKMPVSMVGSSFVYGFLYGL WPIAWIIIAAIFLYKLSVKSGYFEILKESVQSITLDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPIAITAAILVGLGLSPLYAA GLCLIANTAPVAFGAVGIPITAMAGAVGVPAIMISAMTGKILFFVSLIVPFFIVFLMDGFRGIKETFPAVFIAAGTFAIT QFLSSNYLGPELPGIISAIVSLVCTAVFLRFWQPKHIFRSDGKEVELAKHNHHVCKIFVAWAPFVILIVTIVLWTQPWFK ALFKEGGALAFSNFYFEFETISRKIFKSAPFLVEGKDPSDAVIFKFPLINTVGTSIFLAALVSMLVLRVKASEAIGVFGE TLKEMRFPILTIGLVLSFAFVSNYSGISATLALALTHTGQAFTFFSPIIGWVGVFLTGSDTSSNLLFGALQQLTAERLGI PEVLTLTANTVGGTLGKMISPQSIAIACAAVGLAGKESDLFKFTVKYSIIFVILMGVVISAIAYLIPDAVPVAPHL |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 8e-121 | 52 |
