|
Name : HCW_06830 (HCW_06830) Accession : YP_006223254.1 Strain : Helicobacter cetorum MIT 00-7128 Genome accession: NC_017737 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transketolase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 2.2.1.1 Position : 1472848 - 1474773 bp Length : 1926 bp Strand : + Note : COG0021 Transketolase DNA sequence : ATGCAATTTAGTAACGCTGATTTAGAACAATTAAAAAACATGGCTACCACACTACGCTTTTTGTGTGCAGACATGGTGGA TAAGGCTAATAGTGGGCATCCTGGCGTGTGCTTGGGGTTAGCTGATATAATGGTAGTTTTAGGCTTGCATTTAAATCTTA ATCCTACTAACCCTAAATGGCTTAATAGAGATAGATTAGTTTTTAGTGGGGGGCATGCAAGTGCGTTAGCTTATAGCCTA CTGCATTTATGGGGTTTTAATTTAAGCCTAGAAGATTTAAAGAATTTTAGGCAATTAGATTCTATTACTCCGGGACACCC CGAATTACACCACACAGAAGGCATTGAAATCACTACAGGTCCTTTAGGGCAAGGCTTTGCTAATGCTGTGGGCTTTAGCA TGGCTAGTAAATACGCTCAAAACCTTTTGAATAAAGAAGTCATTTCTCATAAGATTTATTGTTTGTGCGGGGATGGGGAT TTGCAAGAAGGCATTAGCTATGAGAGTGCGTCTCTAGCGGGACATCATAACCTTAATAATCTTATTGTAATTTATGATAG CAACCAAATTAGTATTGAAGGCTCTACTCAAATCAGCTTTAGCGAAGATGTCAAAAAGCGTTTTTTAGCCCAAAATTGGG AAGTGCTAGAATGCGATGGGCATAACTATCAAGCCATTAATGACGCCTTGAAAGAGGCTAAAAAAGCCACTAAACCCACT CTTTTAATCGCCCACACAATTATTGGCAAGGGGGCTATTGGCTTAGAAGGAAGTGAAAAAACGCATGGTTCACCCTTAAA TAAAGAAGTTTTAAAACAATCCAAAGAAAACGCTCATTTCAATCCTAATGAAAGTTTTGTCATTGATTCAAAAGTTAGAA TGCATTTTGAAGATGTAAAGGTTAGGGGCATTAGCTTAGAAGCTTTATGGGAAAAATCCTTAAGCCCTAGCCTAAAAGAA AAAATTCATGCTTTAAAGAATTTTGATTTTAATACTATCAACTACCCCACTTTTAAAGAAGGCGAGAGCCTAGCCACTAG AGTGAGTAATGGAATGATTTTAAACGCTATTGCTAAAGAATATGAAGGCTTTTTAGGGGGGAGTGCGGATTTAGCCCCTT CTAATAACACGCATTTAAAACATTCTAGTGATTTTCCATTAGGACAAAACTTGCATTTTGGAATTAGAGAGCATGCCATG GGGGCTATTACTAATGCTCTAGCTACTTATGGCTTATTTGTGCCATTTTGTGCGACCTTTTTTGTATTTAGCGATTATTT AATGCCAAGCATGCGTTTAAGCGCTTTGATGAAGTTAAAAGCCCTTTTTATTTTTACGCATGATAGTATCGGTGTGGGTG AAGATGGAGCTACACACCAGCCTATAGAGCAACTAAGCCATTTACGCTCTTTAGTTAATTTCTATGCTTTTAGACCAAGC GATGCTTTTGAAAATACCGCTTGCATGCAGGTGGCATTAAGCCTAAATGCCCCTAGTGGCTTTATTTTATCTCGCCAAAA CTTGCCTGTGCTTAATGAAGTGTCTAAGGAGCAAGTTTTAAAAGGGGCGTATGTTAAACGCCACGCTAAAAACCCTGTAA TCACGCTTGTTGCAAGTGGGAGCGAAGTATCTCTCGCTCTAGAGAGTGCTAAAAAATTAGAACAAGTTAATATCCAAGCT CAAGTAGTGAGTGTGCCATGCTTTGACTTACTCATAGAACAAGATGAAAGCTATTTTAAAGAGCTTTTTAAGGGTAAAGT CTTAGTCGTTGAGGCAAGTCGTGGTTTAGAATGGTATCGTTTTGCTGATAAAGTCATTAGCATGGATTGTTTTGGAAGTT CAGGTAAGGGCGATAAGCTCTTTGAAAAATTTGGCTTTAATATTGAAAATATTATTACTCAAACTAAAGAATTACTCAAC GCATGA Protein sequence : MQFSNADLEQLKNMATTLRFLCADMVDKANSGHPGVCLGLADIMVVLGLHLNLNPTNPKWLNRDRLVFSGGHASALAYSL LHLWGFNLSLEDLKNFRQLDSITPGHPELHHTEGIEITTGPLGQGFANAVGFSMASKYAQNLLNKEVISHKIYCLCGDGD LQEGISYESASLAGHHNLNNLIVIYDSNQISIEGSTQISFSEDVKKRFLAQNWEVLECDGHNYQAINDALKEAKKATKPT LLIAHTIIGKGAIGLEGSEKTHGSPLNKEVLKQSKENAHFNPNESFVIDSKVRMHFEDVKVRGISLEALWEKSLSPSLKE KIHALKNFDFNTINYPTFKEGESLATRVSNGMILNAIAKEYEGFLGGSADLAPSNNTHLKHSSDFPLGQNLHFGIREHAM GAITNALATYGLFVPFCATFFVFSDYLMPSMRLSALMKLKALFIFTHDSIGVGEDGATHQPIEQLSHLRSLVNFYAFRPS DAFENTACMQVALSLNAPSGFILSRQNLPVLNEVSKEQVLKGAYVKRHAKNPVITLVASGSEVSLALESAKKLEQVNIQA QVVSVPCFDLLIEQDESYFKELFKGKVLVVEASRGLEWYRFADKVISMDCFGSSGKGDKLFEKFGFNIENIITQTKELLN A |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| tktA | AAO17218.1 | TktA | Not tested | tcd island | Protein | 4e-94 | 41 |
