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Name : HCW_06525 (HCW_06525) Accession : YP_006223193.1 Strain : Helicobacter cetorum MIT 00-7128 Genome accession: NC_017737 Putative virulence/resistance : Unknown Product : homoserine dehydrogenase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 1.1.1.3 Position : 1400797 - 1402065 bp Length : 1269 bp Strand : - Note : COG0460 Homoserine dehydrogenase DNA sequence : ATGAAAAAAAGATTGTGTGTAGGAATAGTTGGATTAGGGTGCGTAGGGAGTGCGGTTGTTAAAATTTTAGAAGATAATAA AGAAATTATTAGAGATAGGGCTGGGGTAGAAATTGTTATTAAAAAAGCTATTGTGCGTGATGTAGAAAAATATCAAGGCT ACCCTTTTGAAATCAGTAATGATTTGGAAAGTTTAGTAGAAGATACAGAGATAGATATTGTAATAGAGCTTATGGGTGGG GTTGAAGTGCCTTATGAATTAGCTAAAAAAACTTTAGTTAAACAAAAAGCCTTTGTTACAGCCAATAAAGCCATGCTTGC GTATCACCGCTATGAATTAGAACAAATTGCTCAAAACACCCCTATAGGGTTTGAAGCAAGCGTGTGTGGGGGTATTCCTG TAATCAAGGCTTTAAAAGATGGTTTGAGTGCTAATCACATTCTTTCTTTAAAAGGGATTTTAAATGGTACAAGCAACTAC ATTCTCACACAAATGTTTAACCACAATAGAAGTTTCAAAGACGCCTTAAAAGACGCTCAAGATTTAGGCTATGCTGAAAT GAATCCTGAATTTGATATTAAGGGTATTGATGCGGCCCATAAACTATTGATTTTAGCCTCTTTAGCCTATGGTATTGATG CTAGATTAGAAGAAATTTTAATTGAGGGTATTGAAAAAATAGAGCAAGATGACATAGATTTTGCTAAAGAGTTTGGCTAT AACATTAAGCTATTAGGTGTTGCCAAAAAACATAAAGATTGTATTGAATTAAGAGTGCATCCAAGCATGATAAAAAATGA GCGCATGCTCTCTAAAGTAGATGGCGTAATGAATGCCATAAGTATTGTGGGTGATAAAGTGGGCGAGACTTTGTATTATG GAGCTGGAGCTGGGGGAGAGGCAACAGCGAGTGCGGTTATTAGTGATATTATAGAAATTGCAAGAGAAAAAAGCTCTTTG ATGCTAGGATTTGAATGCCCCCAAAGCCTACCATTAAAACCACAAGAAAGCATAGAGAGTGCTTATTATGTGCGTTTGTT AGTCAATGATGAAAAAGGCGTTTTATCTCAAATTAGTGCAATTTTAGCACAAAATGATATTTCGCTTAACAATGTCTTGC AAAAGGAAATCTCACAAGCTAATAGGGCAAAAATCTTGCTCTCTACGCATTTAACTAATGAAAAGACAATTTTAAACGCT CTCAAAGAGCTTGAAAATCTATCTAGCGTGCTAGATACCCCTAAAATGATTCGCTTAATAACAGAATGA Protein sequence : MKKRLCVGIVGLGCVGSAVVKILEDNKEIIRDRAGVEIVIKKAIVRDVEKYQGYPFEISNDLESLVEDTEIDIVIELMGG VEVPYELAKKTLVKQKAFVTANKAMLAYHRYELEQIAQNTPIGFEASVCGGIPVIKALKDGLSANHILSLKGILNGTSNY ILTQMFNHNRSFKDALKDAQDLGYAEMNPEFDIKGIDAAHKLLILASLAYGIDARLEEILIEGIEKIEQDDIDFAKEFGY NIKLLGVAKKHKDCIELRVHPSMIKNERMLSKVDGVMNAISIVGDKVGETLYYGAGAGGEATASAVISDIIEIAREKSSL MLGFECPQSLPLKPQESIESAYYVRLLVNDEKGVLSQISAILAQNDISLNNVLQKEISQANRAKILLSTHLTNEKTILNA LKELENLSSVLDTPKMIRLITE |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| BJAB07104_00305 | YP_008207770.1 | Homoserine dehydrogenase | Not tested | AbaR25 | Protein | 5e-60 | 41 |
| BJAB0868_00309 | YP_008211635.1 | Homoserine dehydrogenase | Not tested | AbaR26 | Protein | 5e-60 | 41 |
