Gene Information

Name : HCD_03920 (HCD_03920)
Accession : YP_006221008.1
Strain : Helicobacter cetorum MIT 99-5656
Genome accession: NC_017735
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : DNA adenine methylase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 830389 - 831234 bp
Length : 846 bp
Strand : +
Note : COG0338 Site-specific DNA methylase

DNA sequence :
ATGACAAAAATATTTGTTCCACCTATAAAATCGCAAGGTATTAAAACAAAATTGGTAGATTGGATTAAGGAAAGTTCAAA
AAAAGTTAAATTTGAGCGTTGGGTTGAGCCGTTTATGGGGACAGGCGTTGTAGCCTTTAATATTCAACCCCAAAAAGCCT
TATTGTGCGATAATAATCCGCATTTAATTTGTTTTTATAAAGCTATTCAAGATGAAAAAATCACTCCAAAAATTGTGAGA
GATTTTCTTAATAAAGAAGGTTTGAAATTATTGCAGAGCAATGGAGAATATTATTATGAAGTGAGAGAACGATTTAATAA
AAACCACAACTCTCTTGATTTTTTATTCTTAAATCGTGCATGTTTTAATGGTATGATACGCTTTAATCAAAAAGGAAAAT
TTAATGTTCCATTTTGTAAAAATCCTCAGCGCTTTGCTCAAAGTTTGGTTACTAAAATTGTTAATCAAGTGGAAAATATA
GCAAAAATTATTAAAAGCAATCATTATGAATTTAAGTGTCAAGATTTTCAAGAAACACTTTTAGAAACAAATCAAGACGA
TTTAATTTATGCTGACCCCCCTTATATTGGAAGAAATACGGATTATTTTGATTGCTGGAATGAAGAAAACGAAGTTATAC
TGCAACAAATATTATCAAAATCTAAACACAAGTTCATTCTTTCTACATGGTTTAGCAATAAATACCGCAAAAATCATTAT
ATTTTTTCTATTTGGAAAAATTATCACATAATAACTAAAGAACATTTTTATTATGTTGGAGCAAAAGAAAACAATCGTAA
TATCATTTATGAAGCACTTTTGTCAAATGTGAATATATCGTATTAA

Protein sequence :
MTKIFVPPIKSQGIKTKLVDWIKESSKKVKFERWVEPFMGTGVVAFNIQPQKALLCDNNPHLICFYKAIQDEKITPKIVR
DFLNKEGLKLLQSNGEYYYEVRERFNKNHNSLDFLFLNRACFNGMIRFNQKGKFNVPFCKNPQRFAQSLVTKIVNQVENI
AKIIKSNHYEFKCQDFQETLLETNQDDLIYADPPYIGRNTDYFDCWNEENEVILQQILSKSKHKFILSTWFSNKYRKNHY
IFSIWKNYHIITKEHFYYVGAKENNRNIIYEALLSNVNISY

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
HH0238 NP_859769.1 DNA adenine methylase Not tested HHGI1 Protein 2e-63 49