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Name : HCD_03240 (HCD_03240) Accession : YP_006220874.1 Strain : Helicobacter cetorum MIT 99-5656 Genome accession: NC_017735 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 687071 - 688714 bp Length : 1644 bp Strand : - Note : COG1620 L-lactate permease DNA sequence : ATGGAATTTCATCAAGTCTATGACCCATTGGGCAATATTTGGCTGAGTGCTTTGGTGGCGCTATCGCCTATCGCACTCTT TTTTATCTCTCTCATTGTATTTAAGCTCAAGGGCTATAGTGCCGGATTTTTAAGCTTAGTGCTTTCGGTGGTTATTGCGT TGTTTGTGTATAAAATGCCTACTGAAATGGTAAGTGCGAGTTTTCTCTATGGGTTTTTATATGGTTTGTGGCCGATTGCT TGGATTGTGATTGCAGCGATTTTTCTCTACAATCTCTCGGTGAAGTCGGGGTATTTTGAGATTTTAAAAGAAAGCATTTT AAGTCTTACGCCTGATCATAGAATTTTAGTGATTTTAATTGGCTTTTGCTTTGGCTCATTCTTAGAAGGGGCTATTGGTT TTGGGGGTCCTGTAGCAATTACTGCAGCGATTTTAGTGGGCTTAGGTTTAAGCCCCTTATACGCCGCTGGATTATGCTTA ATTGCAAATACCGCCCCTGTAGCTTTTGGAGCGGTGGGTATTCCTATTACAGCTATGGCAAATGTAGTGGGTATCCCTGA GTTAGAGATTTCTCAAATGGTGGGGCGTGTGTTACCTATCTTTTCTATCGGCATTCCTTTTTTCATTGTGTTTTTAATGG ATGGTTTTAAGGGTATTAGAGAGACCTTTCCTGTAGTGGCTGTTACAGGGTTTAGCTTTGCTATCGCACAATTTTTTAGC TCTAATTATTTAGGGCCACAGCTCCCTGATATTATTTCAGCCTTAGTATCTTTGATTACTACGACTTTGTTTTTAAAATT TTGGCAACCTAAAAATATCTTTACAAGCCATGGCGAAAAAGTAGAAATTGGGGTTAAAAAACACCATATCTGCAAGGTTA TTGTGGCGTGGATGCCTTTTGTGTTACTGACAATTACCATTATCATATGGACTCAACCTTGGTTTAAGGGTTTATTTAAA GAAGGGGGAGTCTTGGCGTTTTCTAGCTTTGCTTTTGAGCTTGAATCCATTAGTCAAAAGATTTTTAAAACCGCTCCCAT TGTTACTGAAGCGACAAGTTTTCCTGTTGTGTTTAAACTCCCTTTAATTTTAACGACAGGCACTTCCATTTTTTTAGCTG CAATTTTGAGCGTTTTTTTACTTCGTGTAAAAATAAGTGATGCAATAGGGGTATTTGGTGCAACCTTGAAAGAAATGCGT TTTCCTATTCTTACTATAGGTTTGGTTCTAGCGTTTGCGTTTGTGGCTAATTTCAGCGGAATGAGTGCCACACTAGCTTT AGCCCTAGCTGATACAGGGCATGTTTTCACATTCTTTTCGCCTATTGTGGGGTGGCTTGGAGTGTTTTTAACCGGAAGTG ATACAAGCTCTAATCTCTTATTTGGCTCTTTGCAAATGCTCATTGCCACGCAGCTTGGTGTGCCTGAAGTGCTTTTCTTA GCGGCAAACACTTCAGGGGGCGTTGTGGGTAAGATGATAAGTCCACAAAGTATTGCCATAGCCTGTGCGGCGGTAGGATT AGTGGGTAGAGAGAGTGAATTATTTAGATTTACGGTAAAATACTCTATCGCTTTGGCGATTATTATGGGAATTGTCTTTA CTCTTATTGCCTATGTCTTTCCTTTCATTATTCCTACAACCTAA Protein sequence : MEFHQVYDPLGNIWLSALVALSPIALFFISLIVFKLKGYSAGFLSLVLSVVIALFVYKMPTEMVSASFLYGFLYGLWPIA WIVIAAIFLYNLSVKSGYFEILKESILSLTPDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPVAITAAILVGLGLSPLYAAGLCL IANTAPVAFGAVGIPITAMANVVGIPELEISQMVGRVLPIFSIGIPFFIVFLMDGFKGIRETFPVVAVTGFSFAIAQFFS SNYLGPQLPDIISALVSLITTTLFLKFWQPKNIFTSHGEKVEIGVKKHHICKVIVAWMPFVLLTITIIIWTQPWFKGLFK EGGVLAFSSFAFELESISQKIFKTAPIVTEATSFPVVFKLPLILTTGTSIFLAAILSVFLLRVKISDAIGVFGATLKEMR FPILTIGLVLAFAFVANFSGMSATLALALADTGHVFTFFSPIVGWLGVFLTGSDTSSNLLFGSLQMLIATQLGVPEVLFL AANTSGGVVGKMISPQSIAIACAAVGLVGRESELFRFTVKYSIALAIIMGIVFTLIAYVFPFIIPTT |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 4e-134 | 56 |
