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Name : HCD_03235 (HCD_03235) Accession : YP_006220873.1 Strain : Helicobacter cetorum MIT 99-5656 Genome accession: NC_017735 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 685344 - 687011 bp Length : 1668 bp Strand : - Note : COG1620 L-lactate permease DNA sequence : GTGTTAGAATTTCATCAAGTTTATGACCCTTTAGGTAATATTTGGTTAAGTGCTTTTGTAGCCTTACTACCTATTTTATT GTTTTTCTTATCTTTAATTGTTTTTAAGCTTAAAGGTTATAACGCCGCTTTTTTAAGTGTAGCGCTATCTGCTGTTATCG CTGTTTTTGTGTATAAAATGCCTGTGAGTATGGTAGGCTCAAGCTTTGTCTATGGGTTTTTATATGGTTTGTGGCCGATT GCTTGGATTATTATTGCAGCGATTTTTTTGTATAAGCTAAGTGTTAAATCAGGCTATTTTGAAATCTTAAAAGAAAGCGT TCAGTCTATTACTTTAGACCATAGAATTTTAGTGATTTTAATTGGCTTTTGCTTTGGCTCATTCTTAGAAGGAGCCATTG GTTTTGGAGGGCCTATTGCAATTACTGCAGCAATTTTAGTTGGCTTAGGTTTAAGCCCCTTATACGCTGCTGGATTGTGT TTAATTGCAAATACTGCCCCTGTAGCTTTTGGAGCAGTGGGTATTCCTATTACAGCTATGGCAAGTGCAGTAGGGGTGCC AGCGATTTTGATTTCAGCTATGGCAGGTAAAATTCTCTTTTTTGTGAGTTTATTGGTGCCGTTTTTCATTGTGTTTTTAA TGGATGGTTTTAAGGGCATTAAAGAGACTTTTCCGGCGGTTTTTGTAGCGGCTTTTTCTTTTGCTATTGCACAATTTTTA AGCTCTAATTACCTAGGGCCAGAGTTACCGGGCATTATTTCAGCTCTTGTTTCATTGGTATGCACAGCAATATTTTTAAA ATTTTGGCAACCCAAACACATTTTTAGAAGCGATGGCAAAGTGGCAACGCTCACTAAGAGTAATTACCATGTGTGTAAAG TTTATGTTGCTTGGGCGCCTTTTGTGATTTTGATTTTAACGATTGTGCTATGGACACAGCCTTCTTTTAAGGCTTTATTT GAAAAAGATGGCTTGTTAGCTTATTCTAATTTCTATTTTGAGTTTAGTAATATCAGTAACAAGATTTTTAGAAGTCCGCC TTTTGTAGAAGTAGGCCAAAGCGTAAGCATTCCTGTTGTTTTTAAATTTCTGTTGATTAATACCGTTGGCACTTCCATTT TTTTAGCCGCTCTTATTAGCATGTTTGTGTTAAGGGTAAAAGTGAGTGATGCTGTTGGTGTCTTTAATGAAACCTTGAAA GAAATGCGTTACCCTATCCTTACAATTGGTCTGGTCTTAAGCTTTGCTTTTGTGTCTAATTACAGCGGAATTTCTTCCAC TCTAGCTCTAGCACTCACGCATACCGGTGCTGCTTTTACCTTTTTCTCGCCTTTAATTGGATGGGTGGGGGTATTCTTAA CCGGAAGTGATACAAGCTCTAATCTTTTATTTGGTTCTTTACAGCAGCTTACCGCTCAAAGACTAAACATTCCTGAAGTT CTCACTCTAACTGCAAATACGGTGGGTGGCACTTTGGGTAAGATGATAAGCCCACAAAGCATTGCCATAGCTTGTGCGGC AGTAGGCTTAGCGGGTAGAGAGAGTGAATTGTTTAAATTTACGGTTAAATACTCACTTATCTTTGTAGTGATTATGGGGA TAGTCATTAGTGCGATTGCGTATTTAGCCCCAGAAATAGTGCCTGTGCCACCAGCAAGTTTAAACTAA Protein sequence : MLEFHQVYDPLGNIWLSAFVALLPILLFFLSLIVFKLKGYNAAFLSVALSAVIAVFVYKMPVSMVGSSFVYGFLYGLWPI AWIIIAAIFLYKLSVKSGYFEILKESVQSITLDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPIAITAAILVGLGLSPLYAAGLC LIANTAPVAFGAVGIPITAMASAVGVPAILISAMAGKILFFVSLLVPFFIVFLMDGFKGIKETFPAVFVAAFSFAIAQFL SSNYLGPELPGIISALVSLVCTAIFLKFWQPKHIFRSDGKVATLTKSNYHVCKVYVAWAPFVILILTIVLWTQPSFKALF EKDGLLAYSNFYFEFSNISNKIFRSPPFVEVGQSVSIPVVFKFLLINTVGTSIFLAALISMFVLRVKVSDAVGVFNETLK EMRYPILTIGLVLSFAFVSNYSGISSTLALALTHTGAAFTFFSPLIGWVGVFLTGSDTSSNLLFGSLQQLTAQRLNIPEV LTLTANTVGGTLGKMISPQSIAIACAAVGLAGRESELFKFTVKYSLIFVVIMGIVISAIAYLAPEIVPVPPASLN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 8e-104 | 54 |
