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Name : HCD_02760 (HCD_02760) Accession : YP_006220780.1 Strain : Helicobacter cetorum MIT 99-5656 Genome accession: NC_017735 Putative virulence/resistance : Unknown Product : pyrimidine nucleoside transport protein (nupC) Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 585551 - 586807 bp Length : 1257 bp Strand : - Note : COG1972 Nucleoside permease DNA sequence : ATGGTTTTTAACTCCCTTTTGAGTATTGTAGGCATGGCGGTGCTTTTAGGTATCGCATGGGTTTTTTCTAGTGATAAAAA AGCGATTAATTATCGCACGATTATCAGTGCATTTGTGATTCAAGTGGTTCTAGGGGCGTTGATTTTATATGTGCCTTTAG GAAGAGATTTGCTACAGAATTTAGCTAATGCGATAGAGAGCGTTATAGCTTATGGCTATGAAGGGGTGCGTTTTTTATTT GGCAATTTAGCTCCTAATTCTCAAGGCGAGCAAGGAATTGGGGGGTTTGTCTTTGCAATTAATGTTTTAGCGGTGGTTAT CTTTTTTTCTAGCTTGATTTCATTATTGTATTATCTAAAAATCATGCCCTTATTTATCAATCTTATTGGTGGAGCGCTCT CAAAATGCTTAGGCACTTCTAAGGCAGAGAGTATGAGTGCGGCGGCAAATATTTTTGTAGGACACACTGAAGCCCCCTTG GTGATTAAGCCCTATCTAAAAAGCATGAGCAATTCAGAGATTTTTGCGATTATGTGTGTGGGTATGGCAAGCATTGCTGG GCCTGTGTTAGCTGGATATGCGAGCATGGGCGTTCCTTTAACCTACTTACTAGCCGCTTCGTTTATGTCAGCCCCTAGCG GATTACTCTTTGCTAAAATAGTCTATCCGCAAAATGAAAAAGTTTCTAACCATATAGATATTTCTATAGAAAAACCCGTG AATGCTATAGAAGCTATCGCTAGTGGGGCAAGCACAGGATTAAATCTAGCCTTGCATATTGGAGCTATGCTTTTAGCCTT TGTAGGAATGCTCGCACTAGTTAATGGGCTTTTAGGGGTTTTAGGGGGATTTTTAGGCATAGAGCATTTGTCTTTAGGAT TGATTTTAGGCACGCTTTTAAAACCCTTAGCCTTTATTTTAGGTATTCCTTGGAAAGAAGCAGGGGTTGCTGGAGAGATT ATAGGGATTAAAATCGCTTTGAATGAATTTATGGGTTATATGAAGCTCATTCCTTATCTAAGCGATAACGCTCCCTTGGT GTTGAGTGAAAAAACCAAAGCAATTATTACTTTTGCGTTGTGCGGATTTGCAAACTTAAGCTCAGTTGCCATGCTTATTG GTGGGATTGGTAATTTAGTGCCTAGTAAAAAAGAAATGATAGCCAAATTAGCTTTAAAAGCGGTGTTTGTAGGCACGCTT TCAAATTTTATGAGTGCAACAATCGCTGGATTATTCATAGGGCTAAATGCGAATTAA Protein sequence : MVFNSLLSIVGMAVLLGIAWVFSSDKKAINYRTIISAFVIQVVLGALILYVPLGRDLLQNLANAIESVIAYGYEGVRFLF GNLAPNSQGEQGIGGFVFAINVLAVVIFFSSLISLLYYLKIMPLFINLIGGALSKCLGTSKAESMSAAANIFVGHTEAPL VIKPYLKSMSNSEIFAIMCVGMASIAGPVLAGYASMGVPLTYLLAASFMSAPSGLLFAKIVYPQNEKVSNHIDISIEKPV NAIEAIASGASTGLNLALHIGAMLLAFVGMLALVNGLLGVLGGFLGIEHLSLGLILGTLLKPLAFILGIPWKEAGVAGEI IGIKIALNEFMGYMKLIPYLSDNAPLVLSEKTKAIITFALCGFANLSSVAMLIGGIGNLVPSKKEMIAKLALKAVFVGTL SNFMSATIAGLFIGLNAN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| yutK | YP_005163383.1 | putative sodium/nucleoside cotransporter | Not tested | Not named | Protein | 1e-50 | 42 |
