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Name : HCD_07585 (HCD_07585) Accession : YP_006221714.1 Strain : Helicobacter cetorum MIT 99-5656 Genome accession: NC_017735 Putative virulence/resistance : Virulence Product : VirD4 coupling protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1607731 - 1609479 bp Length : 1749 bp Strand : - Note : COG3505 Type IV secretory pathway, VirD4 components DNA sequence : ATGAAGTTAAAAAACGCTCTTAAAAAAAGCTCTAACATTCTCTATCAAGGCTTTAATAAAAGTTTTAAAGGTATCCAAGC CTTCCATAATGGTTATTACAAAAATCTAAGCCAAGCGCTTTGTGGTATTTTAACTTTAGGAGTAAGTGTAGAACACCCTA TGGATTTGAATTTCAAACAAGGCGTAGTAGTTGGTTTGCACAACAACAAACCAGTCTATTATGACACGCCTTTATCCACT TTAATCATTGCGCCACCTGGTAGTGGTAAAACTGCCGCAGTAGCTATTCCTAATTTGCTAACTTTAAAAAGCTCCGTAGT GGTGCTAGATATTAAGGGGGAATTATGCGATTTAACCGCAGGCTATAGACAGCAAGTCTTAGGTAATGAAATTTACATTT TTAATCCACTAGGCGATGACAATTCCTTGAAATTCAATCCTTTTGATAAGCGTATTGTAGAAAAGCTAGATTTCAATAGA AAAAGAAGGCTTGTAGATGAAGTGGGCAATACCATTTTTAGTGGTGATGGCAAAGAGAACGACCCTTATTGGAGAAAACA GGCTAGAAATCTATTTGTCTTTTACGCTCTTTATGATTTATGCGTTAAGCAAGAAAGCTTTTTATTTGATTTGGCTTTTG CACCTATTCAAAACTTTGTTCCCTTAATCCACCCTAAAAGCCCTTATTACAAAGAACTCTATATCCATAAAGTTGACCAA GATGGTAATTTTATATTAGATGAAAACAATGAGCCTATACTAGAAAGAGATAGCAATGGCAATCCTATCTTAAACACACA AGCTAATGCTGAGAATTTATGGTATAGGCAAGTAAGCGAACAAGTCTATTTAGATGTCAATGACCCTAGAAATTATGATG GCACAGTCAATAGATTAGAAAAAGATAAGAAAGGTAATGTTATTATTAAAGAAGGTATGTTAGACCCTGTTATTAGGACA TGGGCTAATAAGTGGTCTATTTCTAATGAAAAAGAATTTGCCTCTATTATGAGCGTGTATTCAGAGTTTATGCAAGTTTT TACAAGTTATCAAGTCAAAAGTGCCACAGATAACATGAGCTTTGAATACGAGGATTTAAGGCGTAAAAATATCAGCCTTT ATATCAAAATCGCCCAAACTGACATTGATACTCTAGCCCCCTTAATTAGAGTTCTTTTAGAAAGCATAGGTAAGAATCTT TTATTAAGAGAAAGTAAGAAGTTTAATGAAAGGGTGTATCTAATTTTAGATGAGTTTGTAAGATTTGGAAAACTTCCTTT TTTGTTAGAAATGCCAGCACTTAGTAGAAGTTATGGTGTAGTGATTATGTTTATCACGCAATCTAATGCGCTCATAGAAA AATACTATGGCAAAGAAGACGCTAGGATTGTTAATAGCACGGTAGCATATAAGATTGTCTTTAAAATGGATGACTTAGAT TACGCTAAGCAACTTAGCGAAGAAATAGGCAAATACACACGAGAAAAACGAAATCGTTCTACTGAAAAAAATCAAGTGAT TTTTGGTGGGACAAGCTCTTATTCTGAAGAGGGCTATGAATTAGTTTCTGCACAAGATATTATGAATATTAACAAAGATG AAGTGATTATTCTAGTAAGCGGACATAAAGCAACGCCCTTAAAGCTCAAAGCCAACTATTACTTCAAAAACAAAAGATTG CCTAAATGTCTCAATATACCCTTAAAACCTAATGAAGAAGCGTTTAAGGGGTTGAGAAAGGTAAATTGA Protein sequence : MKLKNALKKSSNILYQGFNKSFKGIQAFHNGYYKNLSQALCGILTLGVSVEHPMDLNFKQGVVVGLHNNKPVYYDTPLST LIIAPPGSGKTAAVAIPNLLTLKSSVVVLDIKGELCDLTAGYRQQVLGNEIYIFNPLGDDNSLKFNPFDKRIVEKLDFNR KRRLVDEVGNTIFSGDGKENDPYWRKQARNLFVFYALYDLCVKQESFLFDLAFAPIQNFVPLIHPKSPYYKELYIHKVDQ DGNFILDENNEPILERDSNGNPILNTQANAENLWYRQVSEQVYLDVNDPRNYDGTVNRLEKDKKGNVIIKEGMLDPVIRT WANKWSISNEKEFASIMSVYSEFMQVFTSYQVKSATDNMSFEYEDLRRKNISLYIKIAQTDIDTLAPLIRVLLESIGKNL LLRESKKFNERVYLILDEFVRFGKLPFLLEMPALSRSYGVVIMFITQSNALIEKYYGKEDARIVNSTVAYKIVFKMDDLD YAKQLSEEIGKYTREKRNRSTEKNQVIFGGTSSYSEEGYELVSAQDIMNINKDEVIILVSGHKATPLKLKANYYFKNKRL PKCLNIPLKPNEEAFKGLRKVN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| virD4-1 | YP_002301090.1 | VirD4 coupling protein | Virulence | cag PAI | Protein | 0.0 | 70 |
