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Name : HCD_06445 (HCD_06445) Accession : YP_006221501.1 Strain : Helicobacter cetorum MIT 99-5656 Genome accession: NC_017735 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transketolase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 2.2.1.1 Position : 1365769 - 1367694 bp Length : 1926 bp Strand : + Note : COG0021 Transketolase DNA sequence : ATGCAATTTAGTAACACTGATTTAGAACGATTAAAGAGCATGGCCACTACACTACGCTTTTTGTGTGCGGATATGGTAGA TAAGGCTAATAGTGGGCATCCGGGCGTGTGCTTGGGATTAGCTGATGTAATGGTAGTCTTAAGCTTGCATTTAAATCTCA ACCCTACTAACCCTAAATGGCTTAATCGTGATAGATTAGTTTTTAGTGGGGGGCATGCAAGCGCATTAGCTTATAGTTTG TTGCATTTATGGGGTTTTAATTTAAGCCTAGAAGATTTAAAGAATTTTAGGCAATTACATTCCAAAACGCCCGGACACCC CGAATTACACCATACAGAAGGCATTGAAATCACTACAGGCCCTTTGGGGCAAGGCTTTGCTAATGCCGTAGGCTTTAGCA TGGCTAGCAAATACGCTCAAAATCTCTTGAATAAAGAAGTCATTTCTCATAAGGTCTATTGTTTGTGCGGAGATGGAGAT TTGCAAGAAGGCATTAGCTATGAGAGTGCTTCAATAGCAGGACATCATAACCTTGAAAACTTAATTGTGATTTATGATAG CAACCAAATTAGTATTGAAGGCTCTACTCAAATTAGCTTTAGCGAAGATGTTAAAAGGCGTTTTTTAGCCCAAAATTGGG AAGTGCTAGAATGCGATGGGCATAACTATCAGGCTATTCATAATGCTTTAGAAAAGGCTAAAAAAACCACTAAACCCACT CTTTTAATCGCTCACACAACGATTGGTAAGGGAGCTATTGGCTTAGAAGGAAGCGAAAAAACACATGGCTCACCCTTAAA TAAGGAAGTTTTAAAACAATCCAAAGAAAACGCTCATTTCAATCCTAATGAAAGTTTTGTCATTGATTCAAAAGTTAAAA TGCATTTTGAAGAAATAAAGGTTAGGGGCATTAGCTTAGAAGCTTTATGGGAAAAATCCTTAAGCCCTAGCATAAAAGAA AAAATTCATGCTTTAGAGAATTTTGATTTTAATACTATCAACTACCCCACTTTTAAAGAAGGCGAGAGCCTAGCTACTAG AGTGAGTAATGGAATGATTTTAAACGCTATTGCCAAAGAGTATGAAGGCTTTTTAGGGGGGAGTGCGGATTTAGCCCCTT CTAATAACACACATTTAAAACATTCTAGTGATTTTCCTTTAGGACAAAACTTGCATTTTGGCATTAGAGAGCATGCTATG GGGGCTATTACTAACGCTCTAGCGGCTTATGGCTTGTTTGTGCCATTTTGTGCGACCTTTTTTGTATTTAGCGATTATTT AATGCCTAGCATGCGTTTAAGCGCTTTGATGAAATTAAAAGCCCTTTTTATCTTTACGCATGATAGTATCGGTGTGGGCG AAGATGGAGCCACACACCAACCCATAGAGCAACTAAGCCACTTACGCTCTTTAGTTAACTTCTATGCTTTTAGACCAAGC GATGCTTTTGAAAATATCGCTTGCATGCAGGTGGCATTAAGCTTAAATGCCCCTAGTGGCTTTATTTTATCTCGCCAAAA CTTGCCTGTGCTTAATGAAGTGTCTAAAGAGCAAGTTTTAAAAGGGGCGTATGTTAAAAAACACGCTCAAAACCCTGTAA TTACGCTCGTTGCAAGTGGGAGCGAAGTATCTCTCGCTCTAGAGAGTGCTAAAAAATTAGAACAAGCTAATATCCAAGCT CAAGTAGTGAGTGTGCCATGCTTTGATTTACTCATAGAACAAGATGAAAGCTATTTTAAAGAGCTTTTTAAGGGTAAAGT CTTAGCGATTGAAGCGAGCCGTGGCTTAGAATGGTATCGTTTTGCTGATAAAATTATTAGCATGGATTGCTTTGGAAGCT CAGGCAAGGGCGATAAACTCTTTGAAAAATTTGGCTTTAATGTTGAAAATATTATTATTCAGGCTAAAGAATTGCTCAAC GCATGA Protein sequence : MQFSNTDLERLKSMATTLRFLCADMVDKANSGHPGVCLGLADVMVVLSLHLNLNPTNPKWLNRDRLVFSGGHASALAYSL LHLWGFNLSLEDLKNFRQLHSKTPGHPELHHTEGIEITTGPLGQGFANAVGFSMASKYAQNLLNKEVISHKVYCLCGDGD LQEGISYESASIAGHHNLENLIVIYDSNQISIEGSTQISFSEDVKRRFLAQNWEVLECDGHNYQAIHNALEKAKKTTKPT LLIAHTTIGKGAIGLEGSEKTHGSPLNKEVLKQSKENAHFNPNESFVIDSKVKMHFEEIKVRGISLEALWEKSLSPSIKE KIHALENFDFNTINYPTFKEGESLATRVSNGMILNAIAKEYEGFLGGSADLAPSNNTHLKHSSDFPLGQNLHFGIREHAM GAITNALAAYGLFVPFCATFFVFSDYLMPSMRLSALMKLKALFIFTHDSIGVGEDGATHQPIEQLSHLRSLVNFYAFRPS DAFENIACMQVALSLNAPSGFILSRQNLPVLNEVSKEQVLKGAYVKKHAQNPVITLVASGSEVSLALESAKKLEQANIQA QVVSVPCFDLLIEQDESYFKELFKGKVLAIEASRGLEWYRFADKIISMDCFGSSGKGDKLFEKFGFNVENIIIQAKELLN A |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| tktA | AAO17218.1 | TktA | Not tested | tcd island | Protein | 1e-95 | 41 |
