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Name : HCD_05475 (HCD_05475) Accession : YP_006221307.1 Strain : Helicobacter cetorum MIT 99-5656 Genome accession: NC_017735 Putative virulence/resistance : Virulence Product : glutamine synthetase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1147628 - 1149067 bp Length : 1440 bp Strand : + Note : COG0174 Glutamine synthetase DNA sequence : ATGAAGACCCATAATAGCAACGATAAAATTAAAGACTTTTTTGAATTTTGTAAAGAAAATGAAGTAGAATTTGTAGATTT TAGATTTAGCGATATTAAAGGCACTTGGAATCATATTACCTATTCTTTCAGCGCTTTAAGTAACGAAATGTTTATAGAAG GCATCCCTTTTGATGCGAGCTCTTTTAAGGGTTGGCAAAGCATTGAAAACTCCGATATGATTTTAACCCCAGACCTAGTG CGTTATTTTATTGACCCCTTCAGTGCAGATGTGAGCGTAGTCGTATTTTGCGATGTCTATGATGTATACAAAAATCAGCC CTATGAAAAATGCCCTAGAAGTATCGCTAAAAAATCCTTACAGCTCTTAAAAGATTTGGGCTTAGGTAGCGTAGCCTATT TTGGTGCAGAGAATGAATTTTTTATCTTTGATTCTATTAAGATTAAGGACGCTTCTAATTCACAATACTATGAAGTGGAT AGCGAAGAAGGTGAATGGAATCGGGATAAAAGTTTTGAAAGTGGCGTAAATTATGGGCATAGACCGGGCAAACAAGGAGG CTATTTACCTGTGCCACCGACTGATTCTATGATGGATATTCGCACTGAGATTGTTAAAGTCTTAAATCAAGTGGGGCTAG AAACTTTTGTTGTTCATCATGAAGTCGCACAAGCACAAGGTGAAGTGGGCGTAAAATTTGGGGATTTAGTAGAAGCTGCC GATAATGTCCAAAAACTTAAATATGTGGTTAAAATGGTCGCTCATTTAAATGGAAAAACCGCCACCTTTATGCCAAAGCC TTTATATGGAGATAATGGAAGTGGGATGCACACTCATGTAAGCATTTGGAAAAATAATGAAAATCTCTTCAGTGGCGAGA CCTACAAAGGCTTGAGCGAATTTGCTCTGCACTTTTTAGGGGGGGTTTTACACCATGCTAGGGGACTAGCTGCCTTCACT AACGCTTCTACTAATTCCTATAAACGCTTGATTCCAGGCTATGAAGCCCCTTCAATTTTAACTTACTCCGCACATAATAG AAGTGCGAGCGTGCGTATTCCTTATGGAATTTCCAAAAAAAGTGCAAGGTTAGAATTTAGATTTCCTGATAGCTCATCTA ACCCCTACTTAGCTTTTGCAGCCATTTTAATGGCGGGCATTGATGGGGTTACAAATAGGATTGAACCAGGCAAAGCTATG GATATTAATCTTTTCAAACTGACTTTAGATGAGATTAGAGAAAAAGGTATCAAACAAATGCCTCACACCCTAAGAAGTGC GTTAGAAGAGATGTTAGCTAACAGACAATATTTAAAAGAAGGGCAAGTCTTTAGCGAAGAATTTATTCAGGCCTATCAGT CTCTTAAATTCCATTCTGAAGTGTTTCCTTGGGAGAGCAAACCCCACCCTTTTGAATTTATCACTACTTACTCTTGCTAA Protein sequence : MKTHNSNDKIKDFFEFCKENEVEFVDFRFSDIKGTWNHITYSFSALSNEMFIEGIPFDASSFKGWQSIENSDMILTPDLV RYFIDPFSADVSVVVFCDVYDVYKNQPYEKCPRSIAKKSLQLLKDLGLGSVAYFGAENEFFIFDSIKIKDASNSQYYEVD SEEGEWNRDKSFESGVNYGHRPGKQGGYLPVPPTDSMMDIRTEIVKVLNQVGLETFVVHHEVAQAQGEVGVKFGDLVEAA DNVQKLKYVVKMVAHLNGKTATFMPKPLYGDNGSGMHTHVSIWKNNENLFSGETYKGLSEFALHFLGGVLHHARGLAAFT NASTNSYKRLIPGYEAPSILTYSAHNRSASVRIPYGISKKSARLEFRFPDSSSNPYLAFAAILMAGIDGVTNRIEPGKAM DINLFKLTLDEIREKGIKQMPHTLRSALEEMLANRQYLKEGQVFSEEFIQAYQSLKFHSEVFPWESKPHPFEFITTYSC |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glnA | YP_003728749.1 | glutamine synthetase | Not tested | cag PAI | Protein | 0.0 | 92 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| HCD_05475 | YP_006221307.1 | glutamine synthetase | VFG1399 | Protein | 6e-90 | 45 |
