Gene Information

Name : HCD_05445 (HCD_05445)
Accession : YP_006221301.1
Strain : Helicobacter cetorum MIT 99-5656
Genome accession: NC_017735
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 1141383 - 1142384 bp
Length : 1002 bp
Strand : -
Note : COG3034 Uncharacterized protein conserved in bacteria

DNA sequence :
ATGAAAAAAATATGGTTTGGTTTTATAATGAGTTTAATCAGCATGGTTTTATTGAATGCTGATGAGCGGTTGCTAGATAT
TTTACGCCTTTATCAAAAGCAAGGCTTACAAGTTGTAGGTAAAAAACTTGATTCTTACCTAAGAGATGAGTCTTTTTGGA
TAGAAGAACTTAAAAACAAGGATACTGATTTTGGTTATTATGAAAACAAGCAGTTTTTATTTGTATCGGACAAATCTAAA
CCCGATTTGAGACTCTATGAAGTTCAAGATAATATGCTTAAAAAAATCAATAGTTCTAAAGCCCTTGTAGGTTCTAAAAA
GGGTGATAAAACTTTAGAAGGCGATTTAGCTACGCCTATTGGGGTGTATCGTATCACACAGAAATTAGAGCGTTTAGACC
AGTATTATGGTCCTTTAGCCTTTGTAACTAACTACCCTAATTTGTATGATACATTGAAAAAACGCACAGGGCATGGCATT
TGGGTGCATGGAATGCCTTTAAATGGCGATAGGAATGAGTTAAACACGAAGGGTTGTATTGCGATTGAAAATCAGATTTT
AAGTTCTTATGATAATTTATTGAAAGGTAAAAAAGCTCTCTTAATTGTTTATGAGAACAAGTTTATCCCCAGCACCAAAG
AAGAATTAGCCATGATTTTAAGCTCACTCTTTCAATGGAAAGAAGCTTGGGCTAAGGGCGATTTTGAGCGTTATATGGGA
TTTTATGACCCTAGTTTCACTCGTTATGATGGCATGAAAATCAACGCTTTTAAAGAGTATAAAAAAAGGGTATTTGCCAA
AAAAGAAAGGAAGAACATTGCTTTTTTCTCTATCAATGTTACCCCTTATCCAAATTCTGAAAATAAACGCTTATTTTATG
TGGTGTTTGACCAGGATTACAAGGCATACCAGCAAGAAAGGCTCTCTTATAGCTCTAATTCTAGGAAAGAGCTCTATGTA
GAGATTAAAAATGATAAGATGTCTATTGTGGTAGAAAAATAA

Protein sequence :
MKKIWFGFIMSLISMVLLNADERLLDILRLYQKQGLQVVGKKLDSYLRDESFWIEELKNKDTDFGYYENKQFLFVSDKSK
PDLRLYEVQDNMLKKINSSKALVGSKKGDKTLEGDLATPIGVYRITQKLERLDQYYGPLAFVTNYPNLYDTLKKRTGHGI
WVHGMPLNGDRNELNTKGCIAIENQILSSYDNLLKGKKALLIVYENKFIPSTKEELAMILSSLFQWKEAWAKGDFERYMG
FYDPSFTRYDGMKINAFKEYKKRVFAKKERKNIAFFSINVTPYPNSENKRLFYVVFDQDYKAYQQERLSYSSNSRKELYV
EIKNDKMSIVVEK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
HPB8_734 YP_003728755.1 hypothetical protein Not tested cag PAI Protein 3e-128 81